$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Изменения TMV в возбудимых клетках in vitro , вызванные электрическими импульсами, могут быть оптически отслежены с помощью этого протокола, а флуоресцентные сигналы могут быть проанализированы для извлечения их соответствующих параметров.
Экспериментальная установка показана на рисунке 1А. Типичный сигнал в 100 мкс электрического импульса, используемый в экспериментах, показан на рисунке 1В. Клетки в камерах, которые помещаются под микроскоп, обычно выглядят как клетки на рисунке 1C (светлопольное изображение) и рисунке 1D (флуоресцентное изображение). Мы проводим эксперимент, в котором каждые 2 минуты на те же ячейки подается электрический импульс с возрастающим напряжением. Обратите внимание, что время между импульсами в 2 минуты может быть недостаточно большим, чтобы обеспечить полное повторное герметизацию и восстановление клеточных мембран, особенно при использовании импульсов с наибольшей амплитудой, которые связаны с выраженной электропорацией. Таким образом, можно ожидать некоторого кумулятивного эффекта импульсов. Чтобы избежать этих кумулятивных эффектов, межимпульсную задержку можно продлить, но за счет уменьшения количества исследуемых амплитуд импульсов и избегания слишком долгого пребывания клеток на микроскопе.
После получения флуоресцентных изображений в экспериментах проанализируйте их с помощью специального приложения MATLAB. Во-первых, определите пороговые значения пикселей (рис. 2A); Регулируя нижний порог, мы получаем четкое изображение мембран вокруг клеток (фиолетовым цветом), а регулируя высокий порог, мы убираем сигнал мусора (зеленым). Затем приложение определяет среднюю интенсивность флуоресценции всех пороговых пикселей для каждого подаваемого последовательного импульса для получения зависящего от времени сигнала относительного изменения флуоресценции F/F0. Этот сигнал корректируется на фотообесцвечивание красителя путем вычитания наклона линейного уменьшения F, определенного из контрольной цейтраферной записи, в которой импульс не подавался (рис. 2B). После коррекции сигнала извлекаются параметры откликов в виде таблицы в приложении и графика скорректированного сигнала флуоресценции (рисунок 2C). В редких случаях алгоритм не обнаруживает очевидный пик или обнаруживает ложные шумовые сигналы как ложные срабатывания. В этих случаях у пользователя есть возможность вручную выбрать соответствующую точку в сигнале флуоресценции в качестве пика или удалить обнаруженный ложный пик (Рисунок 2D-удаление небольшого пика, который был аномально обнаружен до подачи электрического импульса).
Используя приложение MATLAB, мы можем получить изображения реакции TMV на электрические импульсы как в возбудимых клетках S-HEK (рис. 3A), так и в невозбудимых клетках NS-HEK (рис. 3B). Извлекаются следующие параметры отклика (Таблица 1): количество пиков (NoPeaks), среднее время от пика до пика (при обнаружении более одного пика, MPPT), максимальный отклик (MR), время до первого пика (TtFP) и время от пика до 25%, 50%, 75% и 90% восстановления (T25, T50, T75, T90 соответственно). Эти параметры позволяют оценить реакцию на различные электрические импульсы (например, определить количество пиков, вызванных электрическими импульсами разного E, рис. 3C) и взаимодействие между возбуждением и электропорацией.

Рисунок 1: Установка, форма сигнала и ячейки S-HEK. (A) Изображение камеры на предметном столике микроскопа. (B) Пример формы сигнала импульса, используемого в исследовании (напряжение (U) во времени). (С, Г) Изображение ячеек S-HEK ((C): светлое поле, (D): флуоресценция), масштабная линейка: 100 мкм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 2: Приложение для анализа данных. (А) Изображение интерфейса приложения - пороговое значение. (В) График исходного и скорректированного сигнала изменения флуоресценции. (В) Изображение интерфейса приложения - извлеченные данные. (D) Ручная коррекция обнаружения пиков (удаление небольшого пика, который был аномально обнаружен до подачи электрического импульса, отмеченного красной стрелкой). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.

Рисунок 3: Репрезентативные результаты. (A, B) Инициирование изменений TMV в (A) возбудимом S-HEK и (B) невозбудимом NS-HEK с помощью электрических импульсов с длительностью 100 мкс различной амплитуды, результаты репрезентативных экспериментов. Для наглядности отображаются только отклики на выбранные импульсы в примененной последовательности импульсов. (C) Параметры откликов TMV, вызываемых импульсами с частотой 100 мкс различной амплитуды: в примере показано количество пиков. Результаты выражены в виде среднего ± SE, количество экспериментов: N = 13. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
| Индекс | Е-сила (В/см) | Без пиков (-) | МППТ (мс) | МИСТЕР (-) | ТтФП (мс) | Т25 (мс) | Т50 (мс) | Т75 (мс) | Т90 (мс) |
| 1 | 0 | | | | | | | | |
| 2 | 126 | 9 | 224 | 0.104 | 360 | 72 | 108 | 144 | 180 |
| 3 | 150 | 6 | 354 | 0.097 | 108 | 72 | 108 | 144 | 180 |
| 4 | 176 | 2 | 144 | 0.089 | 36 | 72 | 108 | 144 | 180 |
| 5 | 200 | 1 | | 0.075 | 0 | 108 | 144 | 180 | 252 |
| 6 | 250 | 2 | 396 | 0.064 | 0 | 108 | 216 | 432 | 2052 |
| 7 | 300 | 1 | | 0.059 | 0 | 180 | 1188 | 2448 | |
| 8 | 350 | 1 | | 0.053 | 0 | 1008 | 2340 | | |
| 9 | 400 | 1 | | 0.047 | 0 | 1512 | | | |
Таблица 1: Параметры откликов TMV, вызванных импульсами с длительностью 100 мкс различной амплитуды.