Цельноклеточные биосенсоры (ВКБ) являются инструментальными платформами для обнаружения и определения характеристик регуляторных элементов и развития биоинженерии. Они также имеют огромные перспективы для мониторинга окружающей среды и продуктов питания. Несмотря на то, что значительные усилия были вложены в повышение их чувствительности и портативности, стандартизация их обработки и анализа данных остается относительно неразвитой. В этой статье представлено подробное руководство по использованию двух недавно разработанных WCB, Mer-Blue и Mer-RFP, которые доказали свою способность обнаруживать ионную ртуть на уровнях ниже предельно допустимых значений для питьевой воды, установленных Всемирной организацией здравоохранения. Протоколы, подробно описанные в настоящем документе, охватывают подготовку микробных культур, калибровку датчиков, сбор и анализ данных. Для флуориметрического биосенсора Mer-RFP используется новая теорема о распределении биосинтеза для определения временного интервала для надежных и точных измерений зависимости «доза-реакция». Для колориметрического биосенсора Mer-Blue недорогая конфигурация камеры позволяет проводить точные измерения в условиях, где отсутствуют дорогие спектрофотометры и флуориметры, что способствует децентрализованному мониторингу загрязнения. Описаны процедуры, используемые для тестирования проб пресной воды, и обсуждены ограничения этих биосенсоров в отношении типов проб. Делясь этими методами обработки и анализа, мы поощряем более широкие исследовательские группы внедрять и совершенствовать эти биологические устройства для разработки эффективных решений по мониторингу окружающей среды. В конечном счете, это исследование направлено на содействие широкому внедрению биосенсорных технологий в экологическом сообществе, способствуя более эффективному и действенному мониторингу загрязнения микроэлементами в различных экосистемах.