Этот протокол содержит подробное описание генерации, культивирования и анализа мантийноклеточной лимфомы в гидрогелевых срезах опухоли, напечатанных на 3D-принтере.
Методическая статья
Этот протокол содержит подробное описание генерации, культивирования и анализа мантийноклеточной лимфомы в гидрогелевых срезах опухоли, напечатанных на 3D-принтере.
Мантийноклеточная лимфома (МКЛ) является редким агрессивным В-клеточным новообразованием, которое часто рецидивирует и проявляет лишь ограниченный ответ на обычную химиотерапию. Основной проблемой в исследованиях MCL является культивирование первичных клеток MCL ex vivo, поскольку клетки имеют тенденцию подвергаться спонтанному апоптозу при культивировании в 2D-суспензионной культуре. Хотя известно, что 3D-модели лучше повторяют ситуацию с солидными опухолями in vivo , их применение все еще плохо изучено при лимфомах. Разработка 3D-моделей, которые воспроизводят in vivo условия MCL в лимфатическом узле, может повысить их выживаемость, облегчить изучение перекрестных помех микроокружения MCL-опухоли и имитировать реакцию на лекарственные препараты in vivo . Здесь была создана 3D-печатная модель MCL в виде гидрогелевых срезов опухоли, а также оптимизированный метод культивирования. Стандартизированный процесс был разработан с использованием клеточных линий MCL или первичных клеток MCL, в котором клетки погружаются в гидрогель, содержащий альгинат, коллаген I типа и матрицу базальной мембраны, путем биопечати в желатиновой подложке. Полученные срезы гидрогелевых опухолей MCL культивируются на фильтрующей подложке для поддержания их стабильности в течение всего периода культивирования. К системе можно применять медикаментозное лечение. Реакцию отдельных клеток внутри гидрогелевого среза опухоли можно отследить с помощью четырехцветной 3D-флуоресцентной визуализации в реальном времени. Первичные клетки MCL продемонстрировали стабильную жизнеспособность при культивировании в гидрогелевых срезах опухоли. Этот протокол содержит подробное описание получения, культивирования и анализа клеток MCL в срезах гидрогелевых опухолей. За счет точной имитации микроокружения опухоли и использования культуры на границе раздела воздух-жидкость представленная модель повышает физиологическую значимость по сравнению с традиционной 2D-культурой. Он предлагает значительный потенциал для продвижения как биологических, так и терапевтических исследований MCL.
Мантийноклеточная лимфома (МКЛ) — редкая и агрессивная В-клеточная неходжкинская лимфома, происходящая из мантийной зоны лимфатических узлов1. Мантийная зона состоит из кольца мелких лимфоцитов, окружающих зародышевый центр фолликула В-клеток. Как правило, MCL показывает агрессивное клиническое течение, с частыми рецидивами после начальной химиотерапии. Благодаря лучшему пониманию формирования заболевания1 и разработке новых методов лечения, включая иммунохимиотерапию2, ингибиторы тирозинкиназы Брутона3 или конъюгаты антитело-лекарство4, варианты лечения пациентов с MCL привели к улучшению показателей ответа и увеличению выживаемости без прогрессирования. Тем не менее, устойчивость к лекарствам и рецидивы по-прежнему делают болезнь неизлечимой5. Отчасти это является следствием ее гетерогенности и влияния микроокружения опухоли на развитие опухоли и лекарственную устойчивость6. Проблемой в изучении MCL является сложность культивирования первичных клеток MCL в суспензионной культуре7, поскольку клетки подвергаются спонтанному апоптозу ex vivo 4,5. Это подчеркивает необходимость альтернативных подходов для лучшего моделирования MCL в доклинических моделях.
В естественных условиях опухоли представляют собой трехмерные (3D) структуры, состоящие из различных клеточных компонентов, включая опухолевые клетки, иммунные клетки и стромальные клетки, а также неклеточных компонентов, таких как внеклеточный матрикс (ВКМ). ВКМ, который состоит из макромолекул, таких как коллаген и ламинин, образует сложную волокнистую сеть из эластичных волокон, которая обладает высокой гидрофильностью, создавая гелеобразную среду 2,8,9,10. Чтобы лучше воспроизвести эти in vivo состояния опухолей ex vivo, были разработаны различные 3D-модели. В последние годы эти модели стали иметь решающее значение для изучения фармакологии и биологии рака, в основном сосредоточившись насолидных опухолях.
На сегодняшний день эта область остается малоизученной при лимфомах, поскольку гематологические раковые клетки обладают способностью расти как во взвешенном состоянии, так и в стромальном окружении, таком как лимфатические узлы, костный мозг иливторичные лимфоидные ткани. In vivo клетки MCL диссессируются из мантийной зоны лимфатических узлов в кровь или костный мозг, хотя они в основном пролиферируют в лимфатических узлах, из которых они происходят13,14. В лимфатических узлах клетки MCL окружены Т-клетками, макрофагами и мезенхимальными стромальными клетками, которые, как было показано, контролируют выживаемость или реакцию на лекарственные препараты клеток MCL 14,15,16,17,18. Кроме того, перекрестные помехи микроокружения опухоли MCL, а также пористость и механические свойства являются важными факторами, которые могут влиять на реакцию на лекарства и резистентность 6,14. Таким образом, для изучения первичной МКЛ требуются стандартизированные и воспроизводимые 3D-модели опухолей МКЛ, имитирующие нативное микроокружение. До сих пор были созданы в основном клеточные модели, такие как сфероиды или органоиды первичных клеток MCL 6,19. Они успешно повышают жизнеспособность и долгосрочное культивирование первичных клеток MCL. Тем не менее, внеклеточный матрикс недостаточно представлен в этих моделях. В этом контексте перспективным подходом является передовая 3D-биопечать. Путем непосредственной сборки живых клеток и гидрогелей эта технология позволяет создавать физиологически релевантные 3D-модели лимфатических узлов на основе гидрогеля.
Здесь была создана 3D-биопечатная модель MCL в виде гидрогелевых срезов опухоли, а также оптимизирован метод культивирования. Клетки встраиваются в гидрогели на основе коллагена I-, альгинат- и матригеля путем произвольной обратимой встраивания суспензионных гидрогелей (FRESH) биопечать20. Гидрогелевые срезы опухоли культивируются на фильтрующей основе, что позволяет клеткам MCL расти в условиях, которые точно повторяют условия in vivo в лимфатических узлах.
Этот протокол содержит подробное описание генерации, культивирования и анализа клеток MCL в гидрогелевых срезах опухоли. Используя четырехцветную 3D-флуоресцентную визуализацию в реальном времени, можно отслеживать жизнеспособность или реакцию на лекарственные препараты отдельных клеток внутри гидрогелевого среза опухоли. Первичные клетки MCL продемонстрировали улучшенную выживаемость при культивировании в срезах гидрогелевых опухолей. Эта модель предоставляет инструмент для изучения биологии MCL и реакции на лечение, прокладывая путь к пониманию влияния микросреды и вариабельности пациентов с MCL.
Работа с первичными клетками MCL должна быть одобрена местным этическим комитетом. В этом исследовании комиссия по этике медицинского факультета Университета Эберхарда-Карла и университетской клиники Тюбингена одобрила сбор и обследование образцов пациентов и здоровых доноров (проект No 159/2011BO2), а также было получено информированное письменное согласие пациентов в соответствии с Хельсинкской декларацией. Использованные здесь первичные клетки MCL были выделены из целых лимфатических узлов пациента с MCL и, таким образом, включали не только клетки MCL, но и другие клетки, такие как иммунные клетки и фибробласты.
1. Приготовление желатиновой суспензии для поддерживающей ванны
ПРИМЕЧАНИЕ: Желатиновая суспензия будет служить в качестве поддерживающей ванны в процессе 3D-биопечати. Он индуцирует сшивание биочернил, что позволяет формировать 3D-структуру. Приготовление желатиновой суспензии должно проводиться в стерильных условиях в колпаке для клеточных культур.
2. Приготовление биочернил, загруженных клетками
3. Биопечать в ванне
ПРИМЕЧАНИЕ: Если возможно, проводите процесс 3D-печати в стерильной среде, например, под колпаком для клеточных культур. Используемый 3D-принтер был модифицирован для FRESH печати путем добавления удлинителя шприцевого насоса, как описано в Hinton et al.20.
4. Бактериологическое исследование и лечение гидрогелевых срезов опухолей
5. Анализ жизнеспособности клеток методом исключения трипанового синего
6. Четырехцветная 3D флуоресцентная визуализация в реальном времени
ПРИМЕЧАНИЕ: Четырехцветное окрашивание, используемое здесь, позволяет дифференцировать живые клетки (TMRM-положительные), апоптотические клетки (субстрат Fluorogenic Casspase-3) и мертвые клетки (PicoGreen-положительные)21,22,23. Ядра обнаруживаются с помощью DRAQ5. Тем не менее, этот протокол может быть адаптирован к любому другому фотостационарному, специфическому флуоресцентному красителю для обнаружения биомаркеров, клеточных структур или типов клеток по выбору. Перед окрашиванием убедитесь, что микроскоп способен обнаруживать длины волн флуорофоров, используемых для окрашивания.
Гидрогелевые срезы опухоли, содержащие клетки MCL, были сгенерированы по описанному выше протоколу. Этапы рабочего процесса для 3D-печати и культивирования гидрогелевых срезов опухоли показаны на рисунке 1A. Используемый 3D-принтер был модифицирован для FRESH печати путем добавления удлинителя шприцевого насоса, как описано в Hinton et al.20 (рис. 1B). Одновременно печаталось до пяти срезов (рис. 1C) и культивировалось на одной подложке фильтра (рис. 1D). Под опорой фильтра была добавлена среда для обеспечения снабжения питательными веществами гидрогелевых срезов опухоли. Капля среды добавлялась поверх каждого гидрогелевого среза опухоли, чтобы предотвратить их высыхание. На рисунке 1Е показан обзор пяти гидрогелевых срезов опухоли, культивируемых на одном фильтрующем носителе, а также изображения среза гидрогеля крупным планом. В течение периода культивирования в течение 3 дней гидрогелевые срезы опухоли были стабильны и сохраняли свою структуру (рис. 2А). Сразу после печати в срезах гидрогелевой опухоли присутствовали пузырьки воздуха, но они исчезли во время культивирования (рис. 2А).
Жизнеспособность клеточной линии MCL Jeko-1, культивируемой в гидрогелевых срезах опухоли (3D), по сравнению с клетками Jeko-1, культивируемыми в культуре суспензии (2D), оценивали с помощью анализа исключения трипанового синего (рис. 2B). После 3 дней культивирования 80% клеток стали жизнеспособными, по сравнению с первоначальной жизнеспособностью 88% клеток Jeko-1 до печати. Клетки Jeko-1, культивируемые в 2D, сохраняли исходную жизнеспособность на уровне 88%. Существенной разницы между клетками Jeko-1, культивируемыми в 2D и 3D, не выявлено. Чтобы оценить, пролиферируют ли клетки Jeko-1 в срезах гидрогеля, было определено среднее количество клеток Jeko-1 на срез гидрогеля (рис. 2C). В то время как 5x105 Jeko-1 клеток содержались в каждом срезе сразу после печати (d0), это число почти удвоилось до 9,3x105 клеток после 3 дней культивирования.
Распределение и состояние клеток Jeko-1, культивируемых в гидрогелевых срезах, оценивали с помощью четырехцветной живой флуоресцентной визуализации (рисунок 2D) сразу после печати или через 3 дня культивирования. После печати 3D-реконструкции срезов гидрогеля Jeko-1 показали однородное распределение клеток. Большинство клеток были положительными на TMRM, маркер потенциала митохондриальной мембраны22. Меньшинство клеток было положительным на активность каспазы-3, маркера индукции апоптоза23, а также на маркер мертвых клеток PicoGreen21. Через 3 дня культивирования наблюдалось увеличение количества клеток наряду с формированием клеточных кластеров. Большинство клеток оставались TMRM-положительными, в то время как только несколько клеток были окрашены положительно на активность каспазы-3 или PicoGreen (рис. 2C).
Чтобы проанализировать, реагируют ли клетки MCL в гидрогелевых срезах на химиотерапию, клетки Jeko-1, культивируемые либо в культуре суспензии (2D), либо в гидрогелевых срезах (3D), обрабатывали химиотерапевтическим препаратом доксорубицином, который является частью стандартного лечения пациентов с MCL24. Общая структура гидрогелевых срезов сохранялась во время лечения доксорубицином (рис. 3А). Жизнеспособность клеток Jeko-1, культивируемых в гидрогелевых срезах, снижалась дозозависимо в ответ на лечение доксорубицином. IC50 доксорубицина в клетках Jeko-1 увеличивался при культивировании клеток в гидрогелевых срезах (IC50=5,8 мкМ) по сравнению с клетками Jeko-1, культивируемыми в 2D суспензионной культуре (IC50=2,0μM; Рисунок 3В). Четырехцветная флуоресцентная визуализация в реальном времени показала снижение TMRM- и повышенный сигнал PicoGreen в клетках Jeko-1, культивируемых в срезах гидрогеля в ответ на лечение доксорубицином, что подтверждает индуцированное лечением снижение жизнеспособности. Изображения, полученные с помощью четырехцветной флуоресцентной визуализации в реальном времени, были реконструированы в 3D, сегментированы на основе сигнала ядер DRAQ5 и проанализированы с помощью скрипта Python, описанного в дополнительном файле 1. Пример маски сегментации показан на дополнительном рисунке 1. Номер ячейки, идентифицированный по сигналу DRAQ5, использовался для определения общего номера ячейки. Количество клеток, положительное на активность TMRM, PicoGreen и Casspase-3, использовалось для определения процента жизнеспособных, мертвых или апоптотических клеток соответственно. Количественное определение четырехцветного живого флуоресцентного окрашивания клеток Jeko-1, культивируемых в гидрогелевых срезах в течение 3 дней с 9 мкМ Доксорубицином или без него, показало сопоставимую жизнеспособность с методом исключения трипанового синего (Таблица 2).
В дополнение к установленным клеточным линиям MCL, первичные клетки MCL трех разных пациентов с MCL культивировали либо в культуре 2D-суспензии, либо в 3D-срезах гидрогеля (рис. 4, дополнительный рисунок 2). По данным патологоанатома, все три МКЛ (пациент 1-3) имели классическую/общую морфологию с индексами Ki67 20%-50%. Первичные клетки MCL включали все типы клеток, выделенных из лимфатических узлов пациента с MCL, и, таким образом, содержали не только клетки MCL, но и другие типы иммунных клеток или стромальных клеток. Жизнеспособность первичных гидрогелевых срезов MCL оценивали с помощью теста исключения трипанового синего. После 4 дней культивирования первичные MCL-клетки в гидрогелевых срезах сохраняли жизнеспособность 43,6% (45,7% на 3-й день) по сравнению с исходной жизнеспособностью 71,0% до печати (рис. 4A). Это представляет собой повышенную жизнеспособность по сравнению с клетками, культивируемыми в суспензии (2D), которые имели выживаемость 19,6% после четырех дней культивирования (28,4% на 3-й день). Эта жизнеспособность была визуализирована с помощью четырехцветной флуоресцентной визуализации в реальном времени, в которой большинство клеток были TMRM-положительными и жизнеспособными, в то время как субпопуляция была положительной на активность Casspase-3 и PicoGreen, что указывает на апоптоз и гибель клеток, соответственно (рис. 4B). Данные количественной оценки на рисунке 4B приведены в таблице 2. Первичные клетки еще двух пациентов с MCL показали повышенную выживаемость клеток при культивировании в гидрогелевых срезах (3D) по сравнению с соответствующей культурой 2D-суспензии (дополнительный рисунок 1).

Рисунок 1: Рабочий процесс 3D-печати гидрогелевых срезов опухоли.(А) Рабочий процесс 3D-печати и культивирования клеток в срезах гидрогелевых опухолей. (B) Принтер используется для 3D-биопечати гидрогелевых срезов в желатиновой подложке. (C) Печать чертежа в программном обеспечении 3D-принтера. Одновременно печаталось до пяти гидрогелевых срезов. (D) Схематическое изображение культуры гидрогелевых срезов. Гидрогелевые срезы культивировали на фильтрующей подложке в 6-луночной пластине. Капля среды добавлялась поверх каждого ломтика гидрогеля для поддержания их влажности. На одной подложке фильтра можно культивировать до пяти ломтиков гидрогеля. (E) Напечатанные на 3D-принтере гидрогелевые ломтики, культивируемые на подложке фильтра, как показано на обзорном изображении или на изображениях крупным планом. Масштабные линейки представляют собой 5 мм, 1 мм или 200 мкм, как показано на рисунке. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.

Рисунок 2: Культивирование клеточной линии мантийноклеточной лимфомы (MCL) в 3D-печатных срезах гидрогеля. (A) Крупный план репрезентативного гидрогелевого среза, содержащего клеточную линию MCL Jeko-1, после печати (d0) или после 3 дней культивирования (d3). Масштабная линейка представляет 1 мм. (B) Жизнеспособность клеток Jeko-1, культивируемых в суспензии (2D) или в срезах гидрогеля (3D) в течение 2 дней, оцененных с помощью анализа исключения трипанового синего. Показано среднее ± SD трех независимых экспериментов по биопечати. (C) Номер клеток Jeko-1, содержащийся в каждом гидрогелевом срезе непосредственно после печати (d0) или после культивирования в течение 3 дней (d1-d3). Показано среднее ± SD трех независимых экспериментов по биопечати. Статистически значимой разницы не наблюдалось (n.s., p > 0,05, критерий Манна-Уитни). (D) Трехмерная реконструкция срезов гидрогеля Jeko-1 в день печати (d0) или через 3 дня культивирования (d3). Модель была сгенерирована из z-стеков четырехцветной 3D-флуоресцентной визуализации в реальном времени. Живые клетки показаны красным цветом (TMRM), апоптотические клетки — желтым (ферментативная активность каспазы-3), мертвые клетки — зеленым (PicoGreen), а ядра — синим (DRAQ5). Масштабная линейка представляет собой 50 мкм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 3: Медикаментозное лечение клеточной линии мантийноклеточной лимфомы (MCL) в срезах гидрогеля. (A) Крупный план репрезентативного гидрогелевого среза, содержащего клеточную линию MCL Jeko-1, обработанного 3 мкМ доксорубицином в течение 3 дней (d3). Масштабная линейка представляет 1 мм. (B) Клетки Jeko-1, культивируемые в суспензии (2D) или в гидрогелевых срезах (3D), обрабатывали возрастающими концентрациями химиотерапевтического агента доксорубицина в течение 2 дней. Жизнеспособность клеток оценивали с помощью метода исключения трипанового синего. Показано среднее ± SD четырех независимых экспериментов по биопечати. (C) Трехмерная реконструкция срезов гидрогеля Jeko-1, обработанных 9 мкМ доксорубицином (Doxo) в течение 3 дней (d3). Модель была сгенерирована из z-стеков четырехцветной 3D-флуоресцентной визуализации в реальном времени. Живые клетки показаны красным цветом (TMRM), апоптотические клетки — желтым (ферментативная активность каспазы-3), мертвые клетки — зеленым (PicoGreen), а ядра — синим (DRAQ5). Масштабная линейка представляет собой 50 мкм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 4: Культивирование первичных клеток MCL в гидрогелевых срезах, напечатанных на 3D-принтере. (А) Жизнеспособность первичных клеток MCL, культивируемых в суспензии (2D) или в гидрогелевых срезах (3D) в течение 4 дней, по результатам анализа исключения трипанового синего. Показана средняя жизнеспособность одного эксперимента. (B) Трехмерная реконструкция первичных клеток MCL, культивируемых в гидрогелевых срезах (3D) в течение 3 дней. Z-стеки были получены из гидрогелевых срезов, окрашенных четырехцветным живым окрашиванием, и проанализированы с помощью конфокального лазерного сканирующего микроскопа (CLSM). Живые клетки показаны красным цветом (TMRM), апоптотические клетки — желтым (ферментативная активность каспазы-3), мертвые клетки — зеленым (PicoGreen), а ядра — синим (DRAQ5). Масштабная линейка представляет собой 50 мкм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
| Пятно | ТМРМ | ДРАК5 | Субстрат NucView405 Каспаза-3 | ПикоГрин |
| Возбуждение/излучение | 548 нм/574 нм | 647 нм/681 нм | 429 нм/ 469 нм | 488 нм/ 520 нм |
Таблица 1: Максимумы возбуждения/излучения красителей, используемых для четырехцветной 3D флуоресцентной визуализации в реальном времени.
| Образец | % ячеек | ||
| TMRM (жизнеспособные клетки) | PicoGreen (Мертвые клетки) | Каспаза-3 (Апоптотические клетки) | |
| Jeko-1 Ctrl | 83 | 23.6 | 18.3 |
| Jeko-1 Doxo 9 мкМ | 27.6 | 81.3 | 86.6 |
| Первичный пациент 1 ЛКМ | 75.2 | 31.1 | 33.1 |
Таблица 2: Количественная оценка 3D-реконструкций четырехцветного живого окрашивания гидрогелевых срезов опухолей, культивируемых. Гидрогелевые срезы опухолей культивировали в течение 3 дней и содержали либо клетки Jeko-1, культивируемые с обработкой 9 мкМ доксорубицином, либо без нее (пациент 1).
Дополнительный рисунок 1: Идентификация клеток с помощью 3D-реконструкций четырехцветного живого окрашивания. 3D-реконструкции конфокального изображения, меченного с помощью DRAQ5, получены из (А) четырехцветного окрашивания в реальном времени и (Б) сегментированного изображения на этом канале, сгенерированного с помощью конвейера анализа изображений Python. Масштабная линейка представляет собой 200 μм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы загрузить этот рисунок.
Дополнение Figure 2: Культивирование первичных клеток MCL пациентов 2 и 3 в гидрогелевых срезах опухоли . Жизнеспособность первичных клеток MCL пациента (А) 2 или (В) пациента 3, культивируемых в суспензии (2D) или в гидрогелевых срезах (3D), в течение 4 дней по результатам анализа исключения трипанового синего. Показана средняя жизнеспособность одного эксперимента. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать эту цифру.
Дополнительный файл 1: Инструкции по анализу 3D-реконструкций, полученных в результате четырехцветного окрашивания в реальном времени. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительный файл 2: Скрипт Python для анализа 3D-реконструкций, полученных в результате четырехцветного окрашивания в реальном времени. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительное кодирование File 1: Stl. файл, содержащий схему гидрогелевых срезов опухоли. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Гидрогелевые срезы опухоли, описанные в этом протоколе, представляют собой модель MCL, которая имитирует структуру лимфатических узлов, что позволяет изучать выживаемость клеток MCL и реакцию на лекарственные препараты в 3D-микроокружении опухоли, созданном с помощью биопечати.
Наиболее широко используемые методы биопечати основаны на экструзии, при которой биочернила выбрасываются через систему дозирования. При струйной печати, например, биочернила быстро сшиваются после осаждения с образованием 3D-структур25. Однако этот подход имеет ограничения, особенно с точки зрения вязкости используемых материалов и возможности укладки слоев. В отличие от этого, при 3D-биопечати на основе встроенного шприца, такой как биопечать FRESH, используемая в этом протоколе, применяется подход «геле в геле». Это позволяет печатать биочернила с низкой вязкостью, такие как коллаген, в стабильные конструкции, что позволяет имитировать сложное микроокружение опухоли20,26. В то время как 3D-принтеры, специально разработанные для биопечати, могут быть дорогими, метод, представленный здесь, предлагает более доступную точку входа. Он может быть адаптирован к стандартным экструзионным принтерам с относительно простыми модификациями. Эти модификации могут быть напечатаны на 3D-принтере с помощью доступных нитей, а проекты доступны в виде ресурсов с открытым исходным кодом, например, Hinton et al.20. Однако важно отметить, что приготовление гидрогелевой ванны для биопечати FRESH очень чувствительно к температуре и требует тщательного внимания во время приготовления суспензии.
Часто напечатанные на 3D-принтере модели опухолей культивируются в плавающих системах, в которых отсутствует градиент кислорода in vivo 25, или в микрофлюидных чип-культурах27, которые обладают высокой степенью сложности, но имеют низкую пропускную способность и требуют интенсивного обслуживания. Эти препятствия можно преодолеть с помощью описанных здесь гидрогелевых срезов опухоли. Установка культивирования до пяти гидрогелевых срезов опухоли на границе раздела воздух-жидкость получена из культивирования прецизионно разрезанных срезов солидных опухолей28. Мембрана фильтрующего носителя, используемая в этом протоколе, состоит из политетрафторэтиленовой мембраны (ПФТЭ) с размером пор 0,4 мкм, которая обеспечивает обмен питательных веществ, но предотвращает прикрепление клеток или миграцию клеток29. Культура на мембране из ПТФЭ обеспечивает физическую поддержку срезам для поддержания их стабильности и предотвращения их разрыва или распада. Кроме того, они обеспечивают взаимодействие воздух-жидкость, обеспечивая кислород в основном из воздуха выше и питательные вещества из среды, расположенной ниже фильтра30. Таким образом, система включает в себя пространственно-временные изменения в поступлении питательных веществ, пролиферации клеток и насыщении кислородом, поскольку они могут происходить in vivo25. Культивируемые в гидрогелевых срезах опухоли на фильтрующей основе, первичные клетки MCL сохраняли жизнеспособность более 40% в течение 4 дней, что превышало жизнеспособность, наблюдаемую в культуре 2D-суспензии (рис. 3A, дополнительный рис. 2). Дальнейшие исследования должны выяснить, может ли быть достигнута пролонгированная жизнеспособность путем добавления цитокинов или совместного культивирования с CD40L-экспрессирующими фибробластами, как это было описано в сфероидах и органоидах первичной опухоли В-клеточной лимфомы 6,19,30 или в кокультурах первичных клеток MCL с CD40L-экспрессирующими фибробластами L-клеток14. Включение таких подходов в гидрогелевые срезы опухоли следует рассматривать для улучшения культуры первичных клеток MCL, а также сходства с нативным микроокружением.
Лимфатические узлы содержат хорошо развитую сеть волокон внеклеточного матрикса. Из-за своего рисунка они известны как сетчатые волокна. В основном, эти волокна состоят из коллагена и компонентов, специфичных для базальной мембраны 31,32,33. Для создания матрицы, напоминающей ситуацию in vivo в лимфатических узлах, биочернила, используемые для создания гидрогелевых срезов опухоли, состоят из коллагена I типа и Матригеля, который состоит из четырех основных белков ЭКМ базальной мембраны: ламинина, коллагена IV, энтактина и перлекана34. Кроме того, альгинат добавляется в биочернила для стабилизации гидрогелевых срезов опухоли, что позволяет проводить длительное культивирование и транспортировку из одного сосуда в другой с помощью шпателя. Тестирование различных гидрогелей, содержащих коллаген и альгинат, показало наивысшую клеточную жизнеспособность в сочетании со стабильным и долговечным срезом гидрогеля при использовании биочернил с 0,5% альгината и 20% коллагена (данные не показаны). Помимо компонентов, диаметр гидрогелевого среза опухоли 0,8 см еще больше напоминает средний диаметр лимфатических узлов 1 см35. Живая 3D-визуализация гидрогелевых срезов опухоли также показала равномерное распределение клеток (Рисунок 2C).
При этом способность обрабатывать срезы гидрогеля лекарственными препаратами была продемонстрирована при лечении доксорубицином, который является частью терапии R-CHOP (ритуксимаб, циклофосфамид, доксорубицин, винкристин, преднизолон), стандартной терапии для пожилых пациентов подгруппыMCL подгруппы 24. По сравнению с 2D-культурами, влияние микроокружения опухоли на эффекты лечения может быть изучено в срезах гидрогелевой опухоли. Как показано на рисунке 3, клетки Jeko-1, культивируемые в срезах гидрогеля, были более устойчивы к обработке доксорубицином, чем клетки, культивируемые 2D. Это согласуется с наблюдениями о том, что внеклеточный матрикс может влиять на реакцию на лекарственные препараты и часто усиливать лекарственную устойчивость за счет модуляции жесткости опухоли36, межклеточной коммуникации37 и доставки лекарств38. Кроме того, проточный цитометрический анализ, а также иммуногистохимическое или мультиплексное иммунофлуоресцентное окрашивание могут дать более глубокое представление об ответе на лечение отдельных клеток в срезах гидрогелевых опухолей.
В заключение, этот протокол описывает генерацию и культивирование гидрогелевых срезов опухоли, которые представляют собой 3D-модель лимфатических узлов, имитирующую нативную трехмерную структуру лимфатических узлов. Он обладает потенциалом для расширения применения от клеток MCL до других первичных показаний к лимфоме.
Это исследование было поддержано Фондом Роберта-Боша и Министерством науки, исследований и искусств Баден-Вюртемберга (3R-Network BW).
Мы благодарим Керстин Виллеке за ее превосходную техническую помощь и Ян Чжана за его ценную помощь в анализе 3D-изображений.
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| &микро;-слайд 8 лунок со стеклянным дном | ibidi GmbH | 80827 | Предметные стекла со стеклянным дном используются для визуализации гидрогелевых срезов в реальном времени |
| 10x PBS | Carl Roth GmbH + Co.KG | 9150.1 | Компонент Bioink |
| 10X RPMI-1640 Средний | Сигма-Олдрич | Р1145 | Компонент Bioink |
| Газонепроницаемый шприц 2,5 мл модель 1002 TLL | Гамильтон | 81420 | Шприц для биопечати |
| 3D экструзионный принтер, PrintrBot Simple | Printrbot | Самомодифицированные для печати биочернил | |
| 6-луночный планшет | Th. Geyer GmbH & Co.KG | 7696790 | Культура гидрогелевых срезов |
| Вакуумные фильтрующие системы, мембрана PES, 500 мл, 0.22 и микро; m размер пор, 70 мембрана диаметром мм | Corning Inc. | 513-3355 | Стерильная фильтрация буферов |
| Дегидрат хлорида кальция | Carl Roth GmbH + Co.KG | Т885.2 | Компонент промывочного буфера и желатиновой суспензии |
| Коллаген I из крысы | Corning Inc. | CLS354249 | Компонент Bioink |
| Программное обеспечение Cura Version 15.04.5 для 3D-печати | Ультимейкер | Программное обеспечение, используемое для 3D-печати | |
| ДРАК5 | ООО «Биостатус» | DR50050 | Морилка для визуализации гидрогелевых срезов в реальном времени |
| Этилендиаминтетрауксусная кислота (ЭДТА) дигидрат динатриевой соли | Сигма-Олдрич | Е5134 | Компонент альгинатного растворимого буфера |
| Автоматический счетчик ячеек EVE | Нано ЭнТек Инк. | 10027-452 | Счетчик ячеек |
| Бактериологические чашки Петри Falcon с крышкой, диаметр 35 мм | Сокол | 351008 | Заполнен желатиновой суспензией для формирования опорной ванны для биопечати |
| Пробирки Falcon, 50 мл | Sarstedt AG & Co.KG | 62.547.254 | |
| Эмбриональная сыворотка для теленка | Сигма-Олдрич | С0615 | Добавка к среде для клеточных культур |
| Желатин из свиной кожи | Сигма-Олдрич | Г1890 | Основной компонент желатиновой суспензии |
| HEPES, свободная кислота, класс молекулярной биологии | Merck KGaA | КАС 7365-45-9 | Компонент промывочного буфера и желатиновой суспензии |
| Клеточная линия Jeko-1 MCL | АТКС | ЦРЛ-3006 | Клеточная линия MCL |
| Салфетки KIMTECH Science Precision | Корпорация «Кимберли Кларк» | 7551 | Используется для забора лишней воды из желатиновой суспензии и для удаления капель из сопла 3D-принтера |
| Версия программного обеспечения LAS X 3.5.7.23225 | Лейка | Программное обеспечение, используемое для 3D-реконструкций | |
| Leica TCS SP8 Конфокальный лазерный сканирующий микроскоп | Лейка | ТКС SP8 | Конфокальный микроскоп для визуализации в реальном времени |
| Mason Баночка обычная пинта 16 унций | Болл Корпорейшн | Г001 | Банка, в которой готовится желатиновая кашица |
| Матрица базальной мембраны с уменьшенным фактором роста (СКФ) Матригел | Corning Inc. | 356231 | Компонент Bioink |
| Вкладыш для культивирования милликлеточных клеток, 0,4 &; м размер пор | Merck KGaA | ПИКМОРГ 50 | Поддержка фильтра для ломтиков гидрогеля |
| Подложка NucView 405 Каспаза-3, 1 мМ в 1x PBS | Биотиум | 10405 | Морилка для визуализации гидрогелевых срезов в реальном времени |
| Блендер серии Oster Professional | Остер | БПСТ02-Б00 | Блендер для получения желатиновой суспензии |
| Пенициллин/стрептамицин | Gibco | 15140163 | Добавка к среде для культивирования клеток MCL |
| Quant-iT PicoGreen dsDNA Assay-Kits und dsDNA-Reagenzien | Инвитроген | П7589 | Морилка для визуализации гидрогелевых срезов в реальном времени |
| Ротина 35 Р | Хеттих | 24573 | Центрифугирование клеток |
| Центрифуга ROTINA 38/38R | Хеттих | Z720109 | Центрифугирование желатиновой суспензии |
| RPMI-1640+GlutaMAX | Gibco | 61870036 | Основа питательной среды для клеток MCL |
| Альгинат натрия | Сотрудничество с FMC | GQ9109901 | Компонент Bioink |
| Хлорид натрия | Merck KGaA | 1.06404 | Компонент альгинатного растворимого буфера |
| Цитрат натрия | Carl Roth GmbH + Co.KG | 3580.1 | Компонент альгинатного растворимого буфера |
| Канюли для тупой аппликации Sterican 21G 0,8x22 мм | Б.Браун | 9180109 | Сопло для 3D-печати |
| Тетраметилродамин-метилэфирперхлорат (ТМРМ) | Сигма-Олдрич | Т5428 | Морилка для визуализации гидрогелевых срезов в реальном времени |
| Трипан синий, 0,4% | Сигма-Олдрич | Т8154 | Морилка для анализа жизнеспособности |
| Водонепроницаемый термометр | ВВР | 620-2099 | Термометр для контроля температуры желатиновой суспензии |