$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Описание набора данных и исследовательский анализ
Набор данных состоит из нескольких источников для повышения надежности и точности модели. Merged_dataset содержит 20 620 изображений из наборов данных A (3 054), B (3 264), C (10 000) и D (4 292). Кроме того, было добавлено 1425 изображений из набора данных Брэда для степеней опухоли глиомы (HGG, LGG). Этот разнообразный набор данных обеспечит лучшее обобщение, уменьшит смещения и повысит производительность модели. Большой набор данных позволяет проводить всесторонние оценки, и, таким образом, существует более высокая вероятность получения правильных прогнозов в реальных приложениях задач классификации.
В этом исследовании использовались два различных набора данных. В период с 2005 по 2010 год первый из них был приобретен у больницы Наньфан и больницы общего профиля Тяньцзинского медицинского университета в Китае. В коллекцию включены Т1-взвешенные изображения с контрастным усилением от 233 человек с опухолями, а также глиомой II и III степени. Набор данных предлагает очень полное распределение категорий опухолей и общий анализ данных. Для глиомы высокой степени злокачественности (HGG) доступно 1050 изображений, а для глиомы низкой степени злокачественности (LGG) — 375 изображений, что означает, что больше внимания уделяется более тяжелым случаям (HGG).
На рисунке 1 показаны снимки МРТ, которые подразделяются на три типа опухолей головного мозга. Каждая строка относится к одному типу опухоли, и для каждой категории есть три образца изображений. Сканы имеют различные характеристики в различных ориентациях и видах, включая аксиальную, сагиттальную и корональную. Образцы глиомы имеют неправильную структуру, которая проникает в ткани мозга. Образцы менингиомы проявляются в виде локализованных образований у поверхности мозга, а образцы опухолей гипофиза расположены вблизи центра мозга. Эти примеры демонстрируют изменчивость внешнего вида опухоли, тем самым помогая обучать модели машинного обучения точному обнаружению, а также классификации опухолей при анализе медицинских изображений.

Рисунок 1: МРТ опухолей. МРТ менингиомы, глиомы и опухолей гипофиза в аксиальной, сагиттальной и корональной проекциях, подчеркивающая различные характеристики изображения. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
Глиома имеет наибольшее количество изображений, которое составляет чуть более 6000. Менингиома имеет около 6000 изображений, в то время как гипофиз имеет почти столько же изображений, сколько менингиома. По-видимому, существует почти равное разделение между тремя категориями, что означает, что каждый из типов опухолей хорошо представлен для обучения или любого анализа. Глиома имеет самый большой медианный размер файла, хотя менингиома имеет более ограниченный диапазон и больше выбросов. Умеренная дисперсия гипофиза содержит несколько очевидных выбросов. Каждая категория содержит действительно огромные размеры файлов.
На рисунке 2 показан PCA для трех типов опухолей. Главный компонент 1 улавливает наибольшую дисперсию и значительно отделяет гипофиз (правый кластер) от остальных. Глиомы и менингиомы накладываются друг на друга слева, что указывает на то, что их характеристики сопоставимы и что их сепарабельность уменьшается.

Рисунок 2: PCA функций образа. Анализ главных компонент выделенных признаков, дифференцирующих классы глиомы, менингиомы и опухоли гипофиза. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
Тепловая карта корреляции, показанная на рисунке 3 , показывает отношения между атрибутами метаданных изображения: File_Size, высотой и шириной. File_Size показывает очень низкую корреляцию как с высотой (-0,01), так и с шириной (0,0039).

Рисунок 3: Корреляционная тепловая карта метаданных. Тепловая карта, показывающая связи между атрибутами метаданных изображения, такими как размер файла, высота и ширина. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
Высота и ширина также показывают очень низкую положительную корреляцию 0,0039. Диагональные значения равны 1, что указывает на идеальную корреляцию каждой переменной с самой собой. Как правило, атрибуты в основном не коррелированы, что означает независимые вариации размера файла, высоты и ширины изображения.
Методология и предлагаемая архитектура
Рабочий процесс, который систематически обнаруживает, классифицирует и анализирует опухоли головного мозга на основе данных МРТ, представлен на рисунке 4. Методология включает в себя передовые методы предварительной обработки, сегментации и DL для обеспечения надежного прогнозирования и классификации опухолей.

Рисунок 4: Рабочий процесс предлагаемой методологии. Пошаговый рабочий процесс для обнаружения, классификации и анализа опухолей с использованием данных МРТ. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
Процесс начинается с интеграции нескольких наборов данных (обозначенных как A, B, C и D). Затем наборы данных объединяются в один комплексный набор данных для получения целостных данных. Он также включает в себя набор данных Brad для сегментации, кластеризации и классификации изображений. Объединенный набор данных включает в себя добавление всех изображений в каждом наборе данных и объединенных каталогах, что обеспечивает всеобъемлющий и унифицированный набор данных для дальнейшего анализа и разработки модели с несколькими классификациями.
Во-вторых, завершается предварительная обработка, что является важным шагом в повышении качества и вариативности данных. К исходным изображениям МРТ применяются девять процессов аугментации для повышения производительности модели и разнообразия наборов данных. Изменение размера изображения до общего размера гармонизирует их, а преобразование RGB в оттенки серого упрощает обработку. Переключение по горизонтали/вертикали повышает надежность, а вращение с масштабированием имитирует различные условия изображения. Использование фильтрации по методу Собеля повышает остроту характеристик, а добавление шума улучшает вариативность. Маскирование нерезкости повышает четкость изображения, а смещение по высоте и ширине добавляет вариации положения. Каждый из них в сочетании повышает обобщаемость модели и точность классификации. Все это гарантирует, что модель обобщает широкий спектр ситуаций визуализации. Всего имеется 20 620 изображений МРТ, а общее количество изображений, использованных для разработки модели, после предварительной обработки дает 185 580 изображений.
Затем объединенный набор данных сегментируется с помощью модели U-Net, которая широко используется в медицинской визуализации. Архитектура точно настроена и обучена для идентификации опухолевых областей с помощью МРТ-сканирования. На этом этапе получаются замаскированные изображения, которые выделяют опухоль и устраняют ненужные детали. Сегментация изображений обеспечивает более качественные входные данные для классификации и анализа.
На следующем этапе эти модели будут точно настроены для категоризации изображений по различным классам, используя трансферное обучение для повышения точности при одновременном сокращении времени обучения. Для классификации используется ряд предварительно обученных моделей глубокого обучения, каждая из которых обладает особыми преимуществами. Благодаря простоте использования и эффективности в категоризации изображений, VGG16 и VGG19 используются часто. Обладая оптимальной вычислительной эффективностью, EfficientNetB0 и EfficientNetB7 обеспечивают высочайшую производительность. Более глубокая архитектура ResNet101 повышает точность классификации за счет эффективного захвата сложных шаблонов. После этого точный диагноз обеспечивается за счет классификации данных МРТ обученными алгоритмами по четырем классификациям опухолей. Глиальные клетки являются источником опухолей глиомы, которые нарушают функцию мозга. Опухоли менингиомы развиваются в мозговых оболочках, которые являются защитными слоями головного и спинного мозга. Гипофиз является местом возникновения опухолей гипофиза, которые влияют на гормональный баланс и физиологические процессы.
Затем, чтобы помочь в точной диагностике, используются методы кластеризации, такие как K-ближайшие соседи (KNN), для прогнозирования степени опухоли. Третья и четвертая степени глиомы высокой степени злокачественности (HGG) указывают на тяжелое развитие опухоли. 1 и 2 степени низкодифференцированной глиомы (LGG) являются медленно растущими, менее агрессивными опухолями соответственно. Эта классификация имеет важное значение для установления агрессивности опухоли и, следовательно, для непосредственного клинического лечения.
Наконец, чтобы оценить эффективность моделей категоризации, они сопоставляются по важным критериям. Их эффекты оцениваются, чтобы установить, повысили ли эффективность модели стратегии дополнения и сегментации. Чтобы гарантировать надежность и эффективность, производительность также проверяется на различных наборах данных, а точность классификации сравнивается с самыми передовыми моделями.
Рабочий процесс объединяет подготовку данных, предварительную обработку, сегментацию, классификацию и оценивание в единую структуру. Он повышает точность обнаружения и классификации опухолей головного мозга за счет применения передовых методов DL и тщательной предварительной обработки. Включение классификации опухолей еще больше способствует принятию клинических решений, что делает эту систему комплексной для анализа опухолей.

Рисунок 5: Фреймворк глубокого обучения. Предложена структура классификации опухолей головного мозга с использованием моделей глубокого обучения. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
На рисунке 5 показана архитектура в связи с системой классификации медицинских изображений, которая идентифицирует опухоли головного мозга с помощью передовых вычислительных методов, таких как глубокое обучение. Он начинается с сбора изображений МРТ, которые засекречиваются. Таким образом, это станет основой для процесса классификации. Затем входные данные поступают в модуль предварительной обработки данных, в котором осуществляется нормализация или изменение размера и увеличение изображения, а также удаление шума. Предварительная обработка стандартизирует входные изображения, чтобы максимально эффективно использовать этапы обучения модели. Весь этап заключается в подготовке к прохождению последующих этапов с интенсивными вычислениями. После этапа предварительной обработки данные подаются в модуль извлечения признаков. В этом случае использование вычислительных методов или моделей, возможно, моделей DL, таких как СНС, может быть использовано для идентификации особенностей изображений. Выделяемые признаки могут включать в себя паттерны, указывающие на аномалии или характеристики опухоли. Затем этот набор признаков вводится в модель классификации. Учитывая, что это, вероятно, будет направлено на различение различных классов, которые включают в себя существование или несуществование опухоли и тип опухоли, модель полагается на довольно сложную архитектуру, вероятно, Inception-ResNet-v2, среди прочих, для точных прогнозов. Он определяет, существует ли опухоль на отсканированном изображении мозга. Эта ступень классификации подразделяется на «Опухоль» и «Без опухоли». Когда опухоль обнаружена, система классифицирует тип опухоли как глиому, менингиому или гипофиз. Каждый из этих типов имеет характеристики, которые модель распознает с помощью извлеченных признаков. Для выявленных опухолей затем определяется степень опухоли. Степени варьируются от 1 до 4, что указывает на тяжесть и прогрессирование опухоли. Степень 1 является наименее агрессивной, в то время как степень 4 является наиболее серьезной. Эта классификация помогает в медицинской диагностике и планировании лечения. Конечные результаты включают отсутствие или наличие опухоли, ее тип и степень. Такие результаты очень ценны для клинического применения для принятия решений по уходу и лечению пациентов.
Этот процесс представляет собой интегрированный конвейер для анализа медицинских изображений и классификации типов опухолей. Начиная с необработанных данных, он последовательно проходит через подготовительные данные, извлечение признаков и классификацию. Система определяет, действительно ли у него есть опухоль, указывает ее тип, а также сообщает степень тяжести или степени. Этот конвейер, использующий более сложные формы вычислений, оптимизирует диагностику в медицинской визуализации, чтобы оценки опухолей головного мозга могли быть более быстрыми и точными. Модульный рабочий процесс обеспечивает гибкость, при этом компоненты могут быть оптимизированы отдельно для повышения производительности.