$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Ген TP53, который кодирует белок супрессора опухолей p53, мутирует примерно в 50% человеческих видов рака 1,2. Такие мутации не только устраняют опухолоподавляющие функции p53, но и в некоторых вариантах горячих точек способствуют образованию прионоподобныхагрегатов 3,4. Эти агрегированные формы мутантного p53 часто приобретают свойства усиления функции, включая повышение устойчивости к противораковымтерапиям 5,6. Поэтому определение мутаций горячих точек p53 склонных к агрегации крайне важно для разработки эффективных стратегий лечения рака с мутацией p53 7,8.
В наших предыдущих исследованиях мы наблюдали, что специфические мутации p53 в плоскоклетной карциноме головы и шеи (HNSCC) и линиях рака молочной железы демонстрируют сильные сигналы окрашивания тиофлавина T (ThT), указывающие на наличие агрегированных белков. ThT — это бензотиазольный краситель, который специфически связывается с β-слоевыми амилоидными структурами, обеспечивая усиленную флуоресценцию присвязывании 9. Например, клеточная линия Detroit 562 HNSCC, несущая мутацию p53 R175H, демонстрировала сильные сигналы флуоресценцииThT 10. Аналогично, две другие линии клеток HNSCC, TW01 и HONE-1, обе с мутацией p53 R280T, также показали выраженное окрашиваниеThT 11. В этих случаях сигналы ThT колокализованы с p53, что подтверждает наличие агрегированного p5310,11.
В клетках рака молочной железы MDA-MB-231 (мутация p53 R280K) и T47D (мутация p53 L194F) также демонстрировали сильное окрашивание ThT с чёткой ко-локализацией p53/ThT 12. В отличие от этого, клетки MCF7, экспрессирующие дикий тип p53, и клетки MDA-MB-468 (мутация p53 R273H), обе демонстрировали лишь слабые сигналыThT 12. Аналогично, клетки OECM-1 HNSCC с мутацией p53 V173L демонстрировали низкий уровень окрашиванияThT 10.
По сравнению с другими методами обнаружения агрегации белков — такими как фильтрующие ловушки, трансмиссионная электронная микроскопия (TEM) или иммунокрашивание с агрегированно-специфическими антителами — анализ флуоресценции ThT предлагает ряд преимуществ. Он неразрушителен, быстрый и применим как к живым, так и к фиксированным клеткам без обширной обработки. Хотя фильтрующие тесты эффективно захватывают нерастворимые заполнители, они требуют жёсткой денатурации и непригодны для использования в живыхклетках 13. TEM обеспечивает прямую визуализацию морфологии фибрилл, но является трудоёмким инизкопроизводительным 14. Агрегированно-специфическое иммунокрашивание позволяет выявлять на месте с помощью конформно-зависимых антител, хотя доступность и специфичность антител могутограничивать 15. В отличие от этого, флуоресценция ThT — особенно в сочетании с многоточечным показанием пластин — предлагает простой, количественный и пространственно надёжный подход к обнаружению β-слоевых или амилоидных структур.
Практические соображения также имеют ключевое значение для воспроизводимости. Флуоресценция ThT линейно коррелирует с концентрацией амилоида в широком диапазоне концентраций (0,2–500 мкм), а пиковый сигнал обычно достигается при 20-50 мкм, в зависимости от белка — хотя самофлуоресценция ThT может возникать при ≥5 мкм, а более высокие концентрации могут влиять на кинетику агрегации16. Поэтому рабочая концентрация ThT обычно рекомендуется около 10-20 мкм для баланса чувствительности при минимизации потенциального влияния на процессы агрегации16. В нашем протоколе запас 1 000x ThT (12 мМ) разбавляется в пропорции 1:1 000, чтобы получить рабочую концентрацию примерно 12. μM, что попадает в рекомендуемый диапазон.
ThT преимущественно связывается с β-слоевыми амилоидными структурами, характерными для амилоидных фибрилл. Эта специфичность возникает из-за взаимодействия красителя с архитектурой перекрёстного β амилоидных фибрилл, где поверхности, образованные β-цепями, служат сайтами связывания для ThT. Следовательно, ThT может не обнаруживать эффективно другие неправильно свернутые или неамилоидные агрегаты, которые не проявляют такую β-слойнуюструктуру 17. Поэтому, хотя ThT является ценным инструментом для идентификации амилоидных фибрилл, рекомендуется использовать методы дополнительной валидации — такие как ко-локализация с p53 иммунофлуоресценцией или биофизические методы — для подтверждения идентичности и специфичности обнаруженныхагрегатов 10,18.
Структурные исследования прогнозирования показывают, что мутация p53 V157F принимает конформацию, более склонную к агрегации, чем белок дикоготипа 19. В этом исследовании мы сравнивали сигналы флуоресценции ThT между клетками рака молочной железы Hs578T, которые содержат мутацию p53 V157F, склонную к агрегации, и клетками рака молочной железы MCF7, экспрессирующими дикий тип p53. Используя многоточечный тест окрашивания с считывателем пластин, мы стремились оценить склонность агрегации p53 V157F относительно дикого типа p53.