$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Лихорадка чикунгунья (CHIKF) — это всё более распространённое арбовирусное заболевание, которое преимущественно передаётся переносчиками комаров Aedes aegypti и Aedes albopictus. Характеризуется повторяющимися вспышками в тропических регионах, это заболевание клинически проявляется как острое лихорадочное заболевание, часто сопровождающееся сильной болью в суставах и персистированнымартритом 1. По состоянию на 26 июля общее количество лабораторно подтверждённых случаев чикунгунья в городе Фошань достигло 4 824, из которых впечатляющие 87,2% приходится на район Шунде. Эта выраженная географическая концентрация создаёт значительную нагрузку на региональную инфраструктуру общественного здравоохранения и приводит к значительным расходам на здравоохранение, а также к более широким макроэкономическимвызовам 2.
В условиях всё более перекрывающейся циркуляции вирусов CHIKV, DENV и ZIKV современные диагностические методы сталкиваются с тремя основными ограничениями. Во-первых, серологические анализы не могут отличить острые инфекции из-за длительной персистенции антител после вирусногоклиренса 1. Во-вторых, методы вирусного культурирования демонстрируют низкую чувствительность и требуют нескольких дней, что затрудняет своевременное клиническое принятие решений. В-третьих, хотя количественные ПЦР-анализы демонстрируют высокую специфичность (более 95%), они не могут обнаружить коинфекции в рамках одной реакции, что является значительным недостатком с учётом сообщаемого уровня коинфекции CHIKV-DENV в 12,8% вИндии 3. Филогенетический мониторинг указывает на сдвиг парадигмы. Линия ECSA, доминировавшая во время эпидемии в Индии 2019–2022 годов, приобрела конвергентные мутации в белках оболочки: E1-A226V (повышающий инфекцию комаров) и E2-K252Q (связанный с уклонением от иммунитета). Эти мутации привели к появлению генотипа с задокументированно более высокой вирулентностью, как сообщалось в недавних эпизотажных исследованиях в Керале иМахараштре 3. Параллельно Китай сталкивается с трудностями из-за импорта генотипа ECSA, задокументированного в Юньнаньской вспышке, и других генотипов, при этом автохтонная передача зарегистрирована в нескольких провинциях, включаяЮньнань 4.
Эти реалии создают острые, ограниченные ресурсами потребности в (i) дифференциальной диагностике, несмотря на перекрывающиеся клинические проявления, 5) диагностические анализы, устраняющие сложность инструментов, обычно требуемой для традиционного количественного ПЦР в реальном времени (qPCR)6, и (iii) всесторонней валидации новых технологий точечной помощи, включая RT-LAMP и методы на основеCRISPR 5. Для решения этих диагностических проблем мы предлагаем быстрый тройной ПЦР-анализ, использующий полностью автоматизированную интегрированную систему, позволяющую одновременно обнаруживать CHIKV, DENV и ZIKV в одной реакции. Мы подтвердили эффективность нашего триплексного qPCR-анализа путем прямого сравнения с устоявшимися моноплекснымианализами 5, которые служили эталонным стандартом. В следующих разделах подробно описаны процедуры как для триплексного, так и для референсных одинаковых анализов. Сравнительный анализ результатов обоих методов представлен в разделе «Репрезентативные результаты».