Врожденная диафрагмальная грыжа (CDH) характеризуется лёгочной гипоплазией и недоразвитием сосудов, что приводит к нарушению газообмена и высокой неонатальной смертности. Точная и количественная оценка лёгочных сосудов крайне важна для понимания тяжести заболевания, однако ручная сегментация трёхмерных сосудистых сетей на медицинских изображениях требует много времени и зависит от оператора.
Этот протокол представляет собой полностью автоматизированный метод на основе глубокого обучения для сегментации лёгочных сосудов и морфометрического анализа с использованием постнатальной компьютерной томографии (КТ). Конвейер включает стандартизированные этапы предварительной обработки — преобразование в единицы Хаунсфилда, окна, изотропное редискретирование и контрастно-ограниченное адаптивное гистограммное уравнивание (CLAHE) — для нормализации данных визуализации и улучшения видимости сосудов. Архитектура сверточной нейронной сети U-Net (CNN) затем обучается сегментировать лёгочную сосудистую систему, а затем трехмерный алгоритм скелетизации для количественной оценки морфометрических параметров, таких как количество ветвей, средняя длина ветви и глубина поколений.
Репрезентативные результаты показывают, что предлагаемая модель достигает высокой точности сегментации, при этом конфигурация трансферного обучения обеспечивает наилучшую производительность. Количественный морфометрический анализ показывает заметно сниженную сосудистую сложность при CDH по сравнению с контрольными лёгкими, что соответствует известным патологическим признакам лёгочной гипоплазии.
Этот автоматизированный подход позволяет воспроизводить, количественно и неинвазивно оценивать морфологию лёгочных сосудов при CDH. Метод может быть адаптирован для других методов визуализации и применён для изучения развития лёгких плода и новорождённых, что способствует трансляционным исследованиям и будущей клинической интеграции.