Экспериментальные протоколы, использованные в настоящем исследовании, были утверждены Этическим комитетом Хайнаньской общей больницы (протокол No 2021-239). Руководство Национальных институтов здравоохранения США по уходу и использованию лабораторных животных и Декларация Хельсинки строго соблюдались во всех экспериментальных процедурах. Реагенты и оборудование, использованные в этом исследовании, перечислены в Таблице материалов.
1. Модель животных и экспериментальный дизайн
В этом исследовании использовали тридцать шесть самцов мышей C57BL/6J (4 недели, примерно 20 г). Все мыши содержались в стандартных лабораторных условиях (20–25 °C, относительная влажность 50%–65%, цикл свет/тёмный 12 часов) с доступом к пище и воде ad libitum. После 7-дневного периода акклиматизации мышей случайным образом разделили на две группы (n=18 на группу): группу с перегрузкой железа (модельная группа), которая получала внутрибрюшинные инъекции декстрана железа (0,2 г/кг) дважды в неделю в течение 4 недель; и контрольная группа, получая эквивалентные объёмы нормального физиологического раствора через инъекцию внутрибрюшинного раствора. Через 4 недели мышей усыпили, а для последующего анализа изобрали ткани поджелудочной железы.
2. Измерение железа в сыворотке
Образцы крови были собраны из ретро-орбитального синуса под 1% пентобарбитальной анестезией во время диструса. После того как её оставили стоять при комнатной температуре в течение 1 часа, центрифугировали при 4 °C, 3 000 об/мин в течение 15 минут. Сыворотка отделялась и хранилась при -80 °C. Концентрации железа в сыворотке определялись с помощью колориметрического теста железа в соответствии с протоколом производителя.
3. Гистологический анализ
Образцы тканей поджелудочной железы погружались в 4% параформальдегид для фиксации, после чего перед подготовкой срезов был вложён парафин. Серийные срезы ткани толщиной от 4 до 5 мкм были получены и обработаны с помощью стандартных процедур депарафинизации и регидратации. Гистоморфологическое исследование было проведено с использованием окрашивания гематоксилином и эозином, а осаждение железа в тканях поджелудочной железы оценивалось с помощью прусского синего окрашивания по традиционным гистологическим протоколам.
4. Клеточная культура и мелкая интерферирующая трансфекция рибонуклеиновой кислоты
Клетки под β желудочной железы MIN6 MIN6 были культивированы в модифицированной среде Eagle Dulbecco с высоким содержанием глюкозы, дополненной сывороткой плода бычьей крупной рогатой скота 15%, пенициллином 100 мкг/мл, стрептомицином 100 мкг/мл, 10 мМ HEPES, пируватом натрия 50 мкм и 50 мкмоль/л β-меркаптоэтанолом. Все эксперименты проводились при слиянии клеток 80%. Каждый раз во время клеточной культуры берётся 6–8 мл культурной среды. Клетки поддерживались при 37 °C в увлажнённой атмосфере с концентрацией 5% CO₂. Для функциональных исследований клетки MIN6 в логарифмической фазе роста были трансфектированы с помощью специфических для lncRNA малых интерферирующих (si)РНК (нацеливаясь на выбранные lncRNA на основе результатов микрочипа; Группа ингибиторов) или отрицательную контрольную siRNA (группа Inhibitor NC) с использованием Lipofectamine 2000, согласно инструкции производителя. После культивирования в течение 24 часов клетки анализировались с помощью количественной полимеразной цепной реакции (qRT-PCR) или western blot для определения эффективности блокировки. Целевые последовательности этой siRNA были следующими: siMEG3: GCGUCUCUCUGUGCCAUUUTTAAAUGGCACAGGAAGGCTT; siNC: UUCUCCGAACGUCGUCGUTTACGUGACGUUCGGAGAATT. Каждый эксперимент проводился в трёх экземплярах и повторялся три раза.
5. Анализ цепной реакции с обратной транскрипцией полимеразы
Общая РНК была извлечена из образцов тканей поджелудочной железы и клеток MIN6 с использованием коммерчески доступного реагента для выделения РНК на основе фенолов согласно инструкциям производителя. Комплементарная ДНК была синтезирована с помощью комплекта обратной транскрипции при общем объёме реакции 20 мкл. После обратной транскрипции концентрация кДНК большинства образцов составляла примерно 1 мкг/мкл по количественному анализу образцов. Впоследствии 1 мкл кДНК-шаблона использовался для количественной амплификации ПЦР в реальном времени. qRT-PCR проводилась с использованием ПЦР-обнаружения на базе SYBR Green при следующих циклических условиях: 95 °C за 30 с, 90 °C 15 с, 60 °C 34 с и 68 °C 30 с. Относительные уровни экспрессии генов определялись с помощью метода сравнительного порогового цикла (метод 2-ΔCT ). GAPDH использовался в качестве внутреннего референсного гена для нормализации данных ПЦР в реальном времени. Все экспериментальные процедуры выполнялись в соответствии с протоколами соответствующих производителей, и каждый эксперимент повторялся независимо как минимум три раза. Последовательности праймеров, использованные в этом исследовании, перечислены в Дополнительной таблице 1 и Таблице 2.
6. Анализ для подсчёта клеток 8
Способность к пролиферации клеток была определена с помощью анализа комплекта для подсчёта клеток 8 в соответствии с рекомендациями производителя. Кратко, клетки MIN6 были покрыты в культивных пластинах с 96 лунками с плотностью 5 x 103 клеток на каждую скважину после трансфекции si-MEG3 или si-NC и поддерживались в течение 24 часов. В определённые временные моменты в каждую скважину вводилось 10 мкл реагента жизнеспособности клеток, а пластины инкубировали при 37 °C в течение 2 часов. Значения поглощения впоследствии измерялись на 450 нм с помощью микропластинного считывателя. Жизнеспособность клеток рассчитывалась в процентах относительно контрольной группы.
7. Обнаружение апоптоза с помощью потоковой цитометрии
Апоптотические изменения в клетках MIN6 были исследованы с помощью набора для обнаружения апоптоза Annexin V-FITC/PI согласно инструкциям производителя. После 48 часов трансфекции сиРНК клетки были собраны, дважды промыты холодным фосфатно-буферным физиологическим раствором и вновь суспендированы в буфере связывания. После этого клетки инкубировали с 5 мкл Annexin V-FITC и 5 мкл йодида пропидия в течение 15 минут при комнатной температуре в тёмных условиях. Сразу после окрашивания образцы анализировались с помощью проточной цитометрии. Ранние и поздние популяции апоптотических клеток количественно оценивались с помощью программного обеспечения для анализа потоковой цитометрии. Доля апоптотических клеток была впоследствии рассчитана для межгрупповых сравнений. Каждый эксперимент проводился независимо три раза.
8. Вестерн-блот анализ
Эксперименты Western blot проводились согласно ранее опубликованнымпротоколам 18. Клетки сначала переваривались с помощью трипсина, затем были собраны и лизированы на льду с помощью радиоиммунопреципитационного буфера лизиса. Концентрации белков были количественно измерены, и эквивалентные количества белка подвергались разделению на гелях электрофореза с 10% натрием додецилсульфатом-полиакриламидом перед передачей на мембраны с поливинилиденфторидом. После блокировки мембраны образцы инкубировали с первичными антителами против NF-κB (1:1000), Bcl-2 (1:1000), Bax (1:1000), каспазы-3 (1:1000) и глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы (GAPDH) (1:2000) при указанных коэффициентах разбавления, затем инкубировали вторичными антителами, связанными с пероксидазой хрена. Белковые сигналы были обнаружены с помощью системы хемилюминесценции и количественно измерены с помощью программного обеспечения ImageJ. GAPDH использовался в качестве контроля внутренней нагрузки, а уровни экспрессии белков экспрессировались в виде изменений складок относительно контрольной группы.
9. Статистический анализ
Данные были выражены в виде среднего ± стандартного отклонения (SD). Сравнения между группами проводились с помощью теста Mann–WhitneyU 19 с использованием статистического анализа. p-значение <0,05 считалось статистически значимым.