Высокоразрешающая интравитальная микроскопия изменила изучение динамического клеточного поведения в целостных тканях, позволив напрямую визуализировать миграцию клеток, сосудистые взаимодействия и иммунный надзор с разрешением одной клетки 1,2,3,4. Хотя эти подходы широко применяются в исследованиях рака 3,5, их применение при лёгочных инфекциях ограничено движением дыхательных путей, хрупкостью тканей и ограничениями по биобезопасности. Недавние достижения в платформах торакальной визуализации, включая вакуумно-стабилизированные и постоянно имплантированные оптические окна, решили многие из этих технических задач, обеспечивая стабильное, безподвижное изображение микросреды лёгких на длительном времени6, 7, 8 и 9 и 10. В частности, постоянно имплантируемые окна являются мощными инструментами, поскольку они позволяют многократно визуализировать сосудистый поток, динамику иммунных клеток и поведение отдельных клеток в течение нескольких часов или недель, а также сыграли ключевую роль в определении механизмов метастазирования рака, сосудистой проницаемости и иммунногонадзора 11,12.
Несмотря на эти достижения, интравитальная визуализация ранее не применялась для инфекции Mycobacterium tuberculosis (Mtb) в легких млекопитающих in vivo с одноклеточным разрешением. Ближайшие прецеденты связаны с интравитальной визуализацией микобактериальных инфекций в других условиях. Визуализация инфекции Mycobacterium marinum в эмбрионахданио-рерио-рерио-данио в реальном времени 13 выявила ранние взаимодействия макрофагов и инициацию гранулёмы, а двухфотонная визуализация гранулом БЦЖ в печенимыши 14,15 выявила динамику макрофагов и Т-клеток в процессе развития гранулемы и продемонстрировала ограниченную презентацию антигена и функцию эффектора Т-клеток в гранулематозных поражениях. Эти исследования заложили фундаментальные представления о взаимодействиях микоббактериального хозяина и патогена, но не получили доступ к целостному легкомумлекопитающему 8,16.
Интравитальные методы визуализации также применялись к лёгким в других инфекционных и биологических контекстах, включая общую лёгочнуювизуализацию 8, исследования показали, что патрулирование альвеолярных макрофагов может скрывать бактерии от иммуннойсистемы 17 и характеризует немедленный миелоидный ответ на инфекцию SARS-CoV-2 в лёгких человека16. Интравитальная визуализация аналогично применялась к легким, инфицированным гриппом, что позволяет напрямую визуализировать динамическое поведение иммунных клеток в инфицированной тканилёгких 18,19.
Методы оптической визуализации всего тела с использованием волоконно-оптической микроэндоскопической возбуждения20 и технологии флуоресценции репортерногофермента 21,22 позволили чувствительно обнаружить Mtb в лёгких мышей, но не могут обнаружить отдельные или небольшие кластеры бацилл, отслеживать динамику агрегации бактерий или визуализировать прямые взаимодействия между микобактериями и клетками хозяина внутри целостной ткани лёгких. Для инфицированных лёгких в условиях BSL-3 внедрены методы интравитальной визуализации с высоким содержанием, включая SARS-CoV-2 синфекцией 23 и мультифотонные платформы с фокусом наMtb 24. Эти исследования демонстрируют возможность визуализации заражённых лёгких под контролем, однако такие установки остаются технически сложными и не являются широко доступными. Работа с вирулентным Mtb требует изоляции BSL-3, что создаёт значительные инженерные и биобезопасность для интравитальнойвизуализации 23,24. В результате большинство исследований ранней инфекции Mtb опираются на статические конечные анализы, которые не могут отразить пространственную и временную динамику поведения бактерий в лёгких.
Разработка генетически определённых, одобренных BSL-2 тройных ауксотрофных Mtb штаммов предоставляет уникальную возможность преодолеть эти ограничения. Штамм mc27902, производный Mtb ауксотрофа Mtb из H37Rv, полностью атенуирован, не размножается у иммунокомпрометированных мышей, сохраняет классическое кислотно-быстрое окрашивание, обладает нормальной восприимчивостью к фагам и может безопасно работать вне установок BSL-325. Эти свойства делают mc27902 идеальным суррогатом для установления интравитальных методов визуализации и исследования ранних взаимодействий между хозяином и патогеном при снижении биобезопасности.
Здесь мы применяем окно для высокоразрешающей визуализации лёгких (WHRIL) с mc28471, флуоресцентным tdTomato-экспрессирующим производным тройного ауксотрофного Mtb штамма mc27902, чтобы визуализировать раннюю инфекцию Mtb в целом мышином лёгком. Эксперименты проводились на мышах с ослабленным иммунитетомRag2-/- 26, скрещённых с мышамиMacBlue 27, в которых промотор Csf1r стимулирует экспрессию усиленного цианового флуоресцентного белка (ECFP) в моноцитах, микроглиях и подгруппах дендритных клеток и макрофагов. Трансген MacBlue позволяет чётко визуализировать популяции мононуклеарных фагоцитов в ранних случаях заражения Mtb. Мы решили использовать мышей с дефицитом Rag2, чтобы сосредоточить систему на самых ранних врожденных взаимодействиях хозяина и патогена и избежать дополнительной сложности адаптивных иммунных ответов в короткое окно визуализации, рассмотренное здесь. Важно, что эта техника не ограничивается мышами с дефицитом Rag2 и может применяться и на иммунокомпетентных животных.
Объединяя постоянное окно лёгких с флуоресцентным атенуированным Mtb-штаммом, совместимым с BSL-2, эта платформа позволяет проводить серийную интравитальную визуализацию взаимодействий бацилл и клеток хозяина в одной и той же лёгкой микросреде с разрешением одной клетки в течение нескольких дней. Хотя платформа демонстрирована здесь для раннего заражения, сама платформа не ограничена ранними временными точками и, в принципе, может применяться на более поздних стадиях в зависимости от экспериментальной модели и дизайна исследования. Поскольку успешное применение этой платформы для визуализации зависит от использования конкретной флуоресцентной бациллярной подготовки, описанной здесь, мы включили основные шаги для генерации и подготовки этого реагента в состав полного протокола. Эта платформа обеспечивает прямую визуализацию поведения Mtb in vivo в реальном времени и закладывает основу для будущих механистических исследований бактериальной физиологии, распознавания хозяина и иммунно-опосредованного очищения.