Влияние экстракта ZeLan на клинические фенотипы СПКЯ
Введение DHEA индуцировало у крыс эндокринные и метаболические фенотипы, подобные СПКЯ, о чем свидетельствует значительное увеличение массы тела, концентрации тестостерона в сыворотке крови, соотношения LH/FSH и уровней инсулина натощак по сравнению с контрольной группой (все P < 0.05). Оценка распределения с помощью критерия Шапиро-Уилка подтвердила применимость параметрического анализа для основных показателей массы тела и уровней гормонов, обобщенных в Таблице 1. Лечение экстрактом ZeLan в течение 28 дней значительно уменьшило эти метаболические и гормональные нарушения. Масса тела регистрировалась в конце периода лечения на 56-й день протокола, включая 7-дневный период акклиматизации. Как показано в Таблице 1, масса тела в группе Model (291.12 ± 15.35 g) была существенно выше, чем в группе Control (227.45 ± 10.12 g, P < 0.05), в то время как лечение ZeLan значительно снизило массу тела до 245.25 ± 10.21 g (P < 0.05 по сравнению с группой Model). Уровни тестостерона в сыворотке крови были заметно повышены у крыс с моделью СПКЯ (1.85 ± 0.21 ng/mL) по сравнению с контролем (0.51 ± 0.05 ng/mL), а применение ZeLan снизило уровень тестостерона до 0.92 ± 0.12 ng/mL. Соотношение LH/FSH было значительно увеличено в группе Model (3.28 ± 0.25) относительно группы Control (1.25 ± 0.11) и частично нормализовалось при лечении ZeLan (1.85 ± 0.15). Уровни инсулина натощак были повышены у животных с моделью (28.95 ± 2.35 mIU/L против 12.55 ± 1.12 mIU/L в контроле) и значительно снизились после введения ZeLan (18.82 ± 1.55 mIU/L) (Рисунок 2). Эти результаты подтвердили успешное создание эндокринно-метаболического фенотипа, подобного СПКЯ; однако гистопатология яичников, подсчет фолликулов, анализ желтого тела и мониторинг эстрального цикла в данном исследовании не проводились.
Экстракт ZeLan восстановил альфа-разнообразие микробиоты кишечника
Анализ показателей альфа-разнообразия выявил существенные изменения в структуре микробного сообщества кишечника, связанные с СПКЯ и его лечением. Как показано в Таблице 2 и на Рисунке 3, индекс разнообразия Шеннона был значительно ниже у крыс с моделью СПКЯ (4,19 ± 0,35), чем в группе здорового контроля (6,51 ± 0,28; P < 0,05), что указывает на снижение микробного альфа-разнообразия при данном заболевании. Лечение ZeLan частично восстановило микробное разнообразие: индекс Шеннона увеличился до 5,79 ± 0,26 (P < 0,05 по сравнению с группой Model). Аналогичные результаты наблюдались для индекса Симпсона, который снизился с 0,98 ± 0,01 в контроле до 0,82 ± 0,03 у животных с моделью заболевания и восстановился до 0,93 ± 0,02 после применения ZeLan. Оценщик Chao1, отражающий видовое богатство, продемонстрировал схожую динамику: индукция СПКЯ существенно снизила значение Chao1 с 1215,3 ± 45,4 до 665,8 ± 52,1, в то время как лечение ZeLan увеличило богатство до 963,5 ± 38,6. В совокупности эти данные указывают на то, что СПКЯ сопровождается дисбиозом кишечника, характеризующимся снижением альфа-разнообразия и видового богатства, и что экстракт ZeLan может частично восстановить структуру микробного сообщества до профиля, близкого к контрольному.
Изменения в составе микробиоты кишечника
Таксономическое профилирование на уровне типа выявило отчетливые различия в составе между экспериментальными группами. Как показано на рисунке 4, Firmicutes и Bacteroidetes были доминирующими типами во всех группах, в совокупности составляя более 85% всего бактериального сообщества. В группе Model наблюдалось существенно повышенное содержание Firmicutes (примерно 75%) в сочетании с пониженной долей Bacteroidetes (примерно 15%) по сравнению с контрольной группой (Firmicutes примерно 40%, Bacteroidetes примерно 45%), что привело к заметному увеличению соотношения Firmicutes к Bacteroidetes (F/B), характерного для метаболического дисбиоза. Терапия ZeLan модулировала этот дисбаланс, снизив содержание Firmicutes примерно до 52% и увеличив долю Bacteroidetes примерно до 35%, тем самым частично нормализовав соотношение F/B до уровней, близких к контрольным.
Для выявления бактериальных таксонов, которые отличали группу контроля от модельной группы и, таким образом, определяли связанную с заболеванием микробную сигнатуру, был использован анализ LEfSe. Как показано на рисунке 5, на уровне рода в группе модели СПКЯ наблюдалось значительное повышение численности Bacteroides (показатель LDA > 3.5), Prevotella (показатель LDA > 3.0) и Escherichia (показатель LDA > 2.5), которые в целом ранее ассоциировались с метаболической дисфункцией и воспалением. Напротив, в контрольной группе наблюдалось обогащение полезными родами, включая Lactobacillus (показатель LDA > 3.0) и Ruminococcus (показатель LDA > 2.5), которые признаны за их роль в поддержании целостности кишечного барьера и выработке полезных метаболитов, таких как короткоцепочечные жирные кислоты. Группа ZeLan не была представлена в виде отдельного класса LEfSe на рисунке 5, поскольку данный анализ был сосредоточен на таксонах, отличающих болезнь от здоровья; эффекты, связанные с ZeLan, интерпретировались на основе сдвигов численности в сторону профиля контрольной группы и корреляций между микробиомом и метаболомом.
Метаболомное профилирование и идентификация дифференциальных метаболитов
Нетаргетный метаболомный анализ выявил значительные метаболические нарушения, связанные с СПКЯ и его лечением экстрактом ZeLan. График «вулкан» на рисунке 6 демонстрирует распределение признаков метаболитов между группами Model и Control, где повышенные и пониженные уровни признаков выделены по направлению кратности изменения (fold-change) и статистической значимости. В общей таблице отчетности по метаболомике для сравнения групп Model и Control было сохранено в общей сложности 52 аннотированных признака метаболитов. Полный список, включающий название метаболита, идентификатор HMDB, биохимический класс, log2 кратности изменения, значение P и направление регуляции, представлен в Дополнительной таблице 1. В таблице 3 приведены репрезентативные аннотированные метаболиты, имеющие высокую биологическую значимость для СПКЯ.
В таблице 3 обобщены репрезентативные ключевые дифференциальные метаболиты с высокими значениями VIP и биологической значимостью для патофизиологии СПКЯ. Стеридные гормоны, включая тестостерон (VIP = 2.56, P < 0.001) и андростендион (VIP = 2.34, P < 0.001), были значительно повышены у животных с моделью СПКЯ, что согласуется с гиперандрогенным состоянием, характерным для данного заболевания. Метаболизм жирных кислот также был нарушен: наблюдалось значимое увеличение уровней пальмитиновой кислоты (VIP = 2.12) и арахидоновой кислоты (VIP = 1.89), при этом провоспалительный липидный медиатор простагландин E2 также был повышен (VIP = 2.05). Напротив, метаболиты, связанные с полезной активностью кишечной микробиоты, были снижены у животных с СПКЯ: значительно decreased литохолевая кислота, вторичная желчная кислота, образующаяся в результате микробной биотрансформации (VIP = 2.45), так же как и короткоцепочечная жирная кислота масляная кислота (VIP = 2.21). Кроме того, в группе Model наблюдалось снижение уровней янтарной кислоты и незаменимой аминокислоты L-триптофана, что указывает на нарушение микробной ферментации и изменение метаболизма аминокислот.
Анализ обогащения путей KEGG
Анализ обогащения путей с использованием базы данных KEGG выявил несколько метаболических путей в сыворотке крови, которые были значительно нарушены при СПКЯ и модулировались лечением ZeLan. Как показано на Рисунке 7, наиболее значимым обогащенным путем оказался биосинтез стероидных гормонов (Rich Factor = 0.80, P < 0.01), что согласуется с гиперандрогенным фенотипом СПКЯ. Путь стероидогенеза в яичниках также продемонстрировал высокую степень обогащения (Rich Factor = 0.75, P < 0.01), что отражает роль измененного синтеза андрогенов в дисфункции яичников. Биосинтез первичных желчных кислот показал значительное обогащение (Rich Factor = 0.62, P < 0.02), что указывает на нарушение энтерогепатической циркуляции желчных кислот, которое может быть связано с изменениями в микробиоте кишечника. Метаболизм арахидоновой кислоты (Rich Factor = 0.56, P < 0.03) и путь инсулинорезистентности (Rich Factor = 0.40, P < 0.04) также были значительно обогащены, что подтверждает наличие воспалительных и метаболических нарушений, характерных для СПКЯ. Путь биосинтеза жирных кислот показал умеренное обогащение (Rich Factor = 0.30), что предполагает участие дисрегуляции липидного обмена.
Корреляционный анализ микробиома и метаболома
Для оценки функциональных взаимосвязей между составом микробиоты кишечника и метаболическими изменениями был проведен корреляционный анализ Спирмена с контролем частоты ложноположительных результатов (FDR) между бактериальными родами с дифференциальным обилием и ключевыми метаболитами. Тепловая карта корреляций с иерархической кластеризацией, представленная на рисунке 8 , выявляет отчетливые паттерны ассоциаций между микробиотой и метаболомом. Полезные бактерии, включая Lactobacillus и Ruminococcus, продемонстрировали сильную положительную корреляцию с литохолевой кислотой (r = 0.72 и 0.68 соответственно) и масляной кислотой (r = 0.65 и 0.60 соответственно), в то время как с тестостероном (r = -0.75 и -0.80) и андростендионом (r = -0.68 и -0.72) наблюдалась отрицательная корреляция. Эти результаты позволяют предположить, что полезные бактерии, выявленные в ходе таксономического анализа, были связаны с метаболитами андрогенов и метаболической активностью, относящейся к SCFA.
Напротив, роды Bacteroides, Prevotella и Escherichia, ассоциированные с СПКЯ, продемонстрировали противоположные паттерны корреляции. Эти бактерии положительно коррелировали с тестостероном (r = 0.85, 0.82 и 0.60 соответственно), андростендионом (r = 0.78, 0.75 и 0.55) и пальмитиновой кислотой (r = 0.65, 0.60 и 0.45), при этом наблюдалась отрицательная корреляция с полезными метаболитами, включая литохолевую и масляную кислоты. Такие паттерны корреляции подтверждают функциональные связи между конкретными таксонами кишечной микробиоты и метаболическими нарушениями, характерными для СПКЯ, однако они не устанавливают прямой причинно-следственной связи.
Доступность данных:
Наборы данных, полученные и проанализированные в ходе данного исследования, включают метаданные образцов, исходные данные по фенотипу, показатели альфа-разнообразия 16S, сводные данные по обилию на уровне типов, результаты дифференциального анализа бактериальных таксонов, таблицы дифференциального анализа метаболома, результаты по репрезентативным метаболитам, результаты обогащения путей KEGG и матрицу корреляции микробиоты и метаболитов. Эти исходные данные представлены в прилагаемом Дополнительном файле 1. Обработанный набор данных по дифференциальным метаболитам представлен в Дополнительной таблице 1.

Рисунок 1: Дизайн эксперимента и график лечения. Схематическая иллюстрация рабочего процесса эксперимента, включающая 7-дневный период акклиматизации, 21-дневный период инъекций DHEA или плацебо, 28-дневное лечение экстрактом ZeLan или плацебо и итоговый сбор образцов сыворотки крови и фекалий на 56-й день протокола. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 2: Влияние экстракта ZeLan на эндокринные и метаболические показатели. Диаграммы размаха, демонстрирующие (A) концентрацию тестостерона в сыворотке крови, (B) соотношение ЛГ/ФСГ и (C) массу тела в контрольной, модельной и опытной группах (ZeLan) после периода вмешательства. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 3: Альфа-разнообразие микробиоты кишечника. Сравнение индекса разнообразия Шеннона в группах Control, Model и ZeLan, иллюстрирующее различия в альфа-разнообразии микробиоты кишечника. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 4: Состав микробиоты кишечника на уровне типов. Стековая столбчатая диаграмма, показывающая относительное обилие преобладающих типов бактерий в микробиоте кишечника групп Control, Model и группы, получавшей ZeLan. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 5: Дифференциальные бактериальные таксоны, выявленные с помощью анализа LEfSe. Линейный дискриминантный анализ размера эффекта (LEfSe) для идентификации родов бактерий, различающих контрольную группу (Control) и группу модели (Model). Показатели LDA указывают на размер эффекта таксонов с дифференциальной численностью. Изменения, связанные с ZeLan, описаны в разделе «Результаты» на основе сдвигов численности относительно группы модели. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть этот рисунок в большем размере.

Рисунок 6: Дифференциальный профиль метаболитов. График-вулкан, демонстрирующий дифференциальные признаки метаболитов между группами Model и Control. Красные и синие точки представляют собой статистически значимо повышенные и пониженные уровни соответствующих признаков метаболитов на основе кратности изменения и статистической значимости. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 7: Анализ обогащения путей KEGG. Пузырьковый график, показывающий статистически значимо обогащенные метаболические пути, выявленные на основе дифференциальных метаболитов. Размер пузырька соответствует количеству картированных метаболитов, а цвет пузырька указывает на статистическую значимость (P-value) обогащения пути. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 8: Корреляция между микробиотой кишечника и метаболитами сыворотки крови. Тепловая карта с иерархической кластеризацией, отображающая коэффициенты корреляции Спирмена между бактериальными родами с дифференциальной численностью и репрезентативными метаболитами сыворотки крови. Красный цвет указывает на положительную корреляцию, синий — на отрицательную. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
| Группа | N | Масса тела (г) | Тестостерон (нг/мл) | Соотношение ЛГ/ФСГ | Инсулин (мЕД/л) |
| Контроль | 8 | 227.45 ± 10.12 | 0.51 ± 0.05 | 1.25 ± 0.11 | 12.55 ± 1.12 |
| Модель | 8 | 291.12 ± 15.35a | 1.85 ± 0.21a | 3.28 ± 0.25a | 28.95 ± 2.35a |
| ZeLan | 8 | 245.25 ± 10.21b | 0.92 ± 0.12b | 1.85 ± 0.15b | 18.82 ± 1.55b |
| Примечание: данные представлены как среднее значение ± стандартное отклонение (SD). a = p < 0,05 по сравнению с контрольной группой; b = p < 0,05 по сравнению с группой Model. |
Таблица 1: Эндокринные и метаболические показатели у крыс с СПКЯ. Масса тела, уровень тестостерона в сыворотке крови, соотношение LH/FSH и уровень инсулина натощак были измерены в контрольной группе, группе модели и группе, получавшей ZeLan. Данные представлены как среднее значение ± SD.
| Группа | Индекс Шеннона | Индекс Симпсона | Оценщик Chao1 |
| Контроль | 6.51 ± 0.28 | 0.98 ± 0.01 | 1215.3 ± 45.4 |
| Модель | 4.19 ± 0.35a | 0.82 ± 0.03a | 665.8 ± 52.1a |
| ZeLan | 5.79 ± 0.26b | 0.93 ± 0.02b | 963.5 ± 38.6b |
| Примечание: данные представлены как среднее значение ± стандартное отклонение (SD). a = p < 0,05 по сравнению с контрольной группой; b = p < 0,05 по сравнению с группой модели. |
Таблица 2: Индексы альфа-разнообразия микробиоты кишечника. Сравнение индекса Шеннона, индекса Симпсона и оценки Chao1 в группах контроля, модели и терапии ZeLan. Данные представлены как среднее значение ± SD.
| Название метаболита | ID HMDB | Класс | Тенденция (модель в сравнении с контролем) | значение p | Показатель VIP |
| Тестостерон | HMDB0000286 | Стероид | Вверх ↑ | < 0.001 | 2.56 |
| Андростендион | HMDB0000055 | Стероид | Вверх ↑ | < 0.001 | 2.34 |
| Пальмитиновая кислота | HMDB0000220 | Жирная кислота | Вверх ↑ | < 0.001 | 2.12 |
| Арахидоновая кислота | HMDB0001043 | Жирная кислота | Вверх ↑ | 0.003 | 1.89 |
| Простагландин E2 | HMDB0001036 | Липид | Вверх ↑ | < 0.001 | 2.05 |
| Литохолевая кислота | HMDB0000752 | Желчная кислота | Вниз ↓ | < 0.001 | 2.45 |
| Масляная кислота | HMDB0000039 | КЦЖК | Вниз ↓ | < 0.001 | 2.21 |
| Янтарная кислота | HMDB0000254 | Органическая кислота | Вниз ↓ | 0.021 | 1.65 |
| L-триптофан | HMDB0000929 | Аминокислота | Вниз ↓ | 0.015 | 1.58 |
| Примечание: VIP = Variable Importance in Projection (переменная важности в проекции) > 1 считается значимым). | | |
Таблица 3: Репрезентативные дифференциальные метаболиты сыворотки крови. Репрезентативные аннотированные метаболиты, связанные с СПКЯ и регулируемые экстрактом ZeLan, включая идентификаторы HMDB, класс метаболитов, тенденцию регуляции, значение P и показатель VIP. Полный список из 52 аннотированных признаков метаболитов представлен в Дополнительной таблице 1.
Дополнительная таблица 1: Полный аннотированный набор данных по метаболитам. Полный список из 52 аннотированных признаков метаболитов, отобранных для отчетности по метаболомике, включая название метаболита, идентификатор HMDB, биохимический класс, кратность изменения (fold change), P-значение и направление регуляции.Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительный файл 1: Исходные данные, подтверждающие результаты экспериментального анализа, анализа микробиома и метаболомики. Эта рабочая книга содержит информацию об образцах, показатели клинического фенотипа, индексы разнообразия секвенирования 16S рРНК, относительное обилие микроорганизмов на уровне типа, анализ дифференциальных таксонов LEfSe, дифференциальный метаболомный анализ, репрезентативные метаболиты, анализ обогащения путей KEGG, данные матрицы корреляции и сводку верификации данных, использованные для построения рисунков и таблиц, представленных в рукописи.Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.