История развития и таксономия
Демонстрация рака кожи у кроликов, вызванного канцерогенами, проведенная Ямагивой и Итикавой в 1915 году, заложила концепцию экспериментальных моделей опухолей24. В середине двадцатого века появились сингенные модели с фундаментальными линиями, такими как карцинома легкого Lewis, карцинома молочной железы 4T1, колоректальная карцинома CT26 и меланома B16, которые сохраняют свою полезность и в современную эпоху иммуноонкологии25. Открытие Флэнаганом в 1966 году атимических «голых» мышей предоставило первого иммунокомпрометированного реципиента, способного переносить ксеногенные ткани26, что позволило Ригаарду и Повлсену в 1969 году впервые успешно осуществить трансплантацию колоректальной опухоли человека27. Последующая разработка линий на базе SCID, NOD/SCID и дефицитных по общей гамма-цепи рецептора IL-2 (Il2rg) постепенно устранила барьеры в виде Т-клеток, В-клеток и NK-клеток28, что привело к формированию современной таксономии: CDX, PDX, ортотопических и диссеминированных вариантов, ксенографтов на основе органоидов и гуманизированных ксенографтов6.
Панель NCI-60, созданная в конце 1980-х годов для скрининга in vitro 60 линий раковых клеток человека из девяти типов тканей, институционализировала систематическую оценку лекарственных средств и на несколько десятилетий заложила основу доклинической фармакологии на базе клеточных линий; при этом перспективные соединения переходили к исследованиям подкожных CDX-моделей на атимических голых мышах с использованием стандартизированных конечных точек, таких как %T/C (процентное отношение объема опухоли в опытной группе к контрольной), задержка роста опухоли и летальность, вызванная действием препарата, что позволяло проводить сравнение между исследованиями29. CDX-модели остаются наиболее широко используемой и экономически эффективной платформой для доклинического тестирования эффективности; результаты исследований подкожных CDX-моделей получаются в течение 5–7 недель (Рисунок 1), и они играют центральную роль в рабочем процессе разработки лекарств для оптимизации дозы, характеристики фармакокинетики/фармакодинамики (PK/PD), количественной оценки ингибирования роста опухоли (TGI) и оценки показателей выживаемости (Рисунок 2).
С практической точки зрения таксономия моделей ксенографтов определяется тремя переменными: источником опухоли, местом имплантации и генетическим фоном реципиента. Модели CDX основываются на установленных клеточных линиях рака со стабильными поставками и обширной молекулярной и фармакологической аннотацией в таких ресурсах, как Cancer Cell Line Encyclopedia30. В моделях PDX используются свежепересаженные фрагменты опухолей пациентов для сохранения гистологии донора, геномной архитектуры и внутриопухолевой гетерогенности, хотя при серийном пассировании человеческая строма постепенно замещается мышиной стромой10. Место имплантации определяет биологический контекст: подкожная трансплантация обеспечивает техническую простоту, воспроизводимость и возможность серийного измерения штангенциркулем; ортотопическая имплантация восстанавливает органоспецифическое микроокружение и поддерживает клинически значимые паттерны спонтанного метастазирования; внутрисосудистое введение (в хвостовую вену, внутрисердечное, внутриселезеночное) позволяет создавать экспериментальные модели метастазирования для изучения более поздних этапов метастатического каскада, таких как экстравазация и колонизация14; а имплантация под капсулу почки использует высоко васкуляризированный участок, что значительно повышает приживаемость опухолей, трудно поддающихся трансплантации31.
CDX и PDX: взаимодополняющие роли в доклинической онкологии
Накапливающиеся данные свидетельствуют о том, что модели CDX обладают ограниченной способностью предсказывать клинический ответ на препараты, что послужило стимулом для пересмотра методологии доклинической онкологии. Установленные линии раковых клеток, содержащиеся неопределенно долго в искусственной культуре, подвергаются прогрессивному клональному отбору, транскрипционной дивергенции и потере стромального и иммунного контекста по сравнению с первичными опухолями, из которых они были получены. Модели PDX сохраняют гистологию донора, геномную архитектуру и внутриопухолевую гетерогенность в течение последовательных пассажей10. В 2006 году платформа PDX для рака поджелудочной железы впервые продемонстрировала возможность прогнозирования ответа на препарат на основе биомаркеров32. В 2011 году платформа «xenopatient» объединила 85 молекулярно аннотированных моделей PDX колоректального рака, воспроизвела паттерны клинического ответа на цетуксимаб и идентифицировала амплификацию HER2 как таргетный механизм резистентности, что было впоследствии подтверждено в исследованиях HERACLES33,34. В знаковом исследовании 2015 года был применен дизайн клинического испытания PDX (PCT) по схеме 1 × 1 × 1 на ~1 000 моделях и 62 режимах лечения, что позволило воспроизвести ассоциации между генотипом и ответом, а также выявить новые механизмы резистентности, утвердив фармакологию в масштабе PDX как надежный связующий этап для разработки дизайна клинических исследований12.
Несмотря на эти достижения, модели CDX остаются «золотым стандартом» для ранней доклинической оценки потенциальных терапевтических препаратов in vivo, поскольку они позволяют быстро, в контролируемых условиях и с минимальными затратами получать результаты: аутентифицированные клеточные линии могут быть подвергнуты генетическим манипуляциям, масштабированы и имплантированы в большие согласованные когорты с сравнительно низким уровнем биологического шума. Это обеспечивает интерпретируемые показатели эффективности, фармакодинамики и переносимости в сроки, которые непрактичны для PDX или гуманизированных систем. Канонические линии, такие как HCT116, A549 и U8735, опираются на многолетнюю литературу по механизмам действия и общедоступные омиксные ресурсы, а ортотопические или диссеминированные варианты CDX расширяют их применение для изучения тканевого тропизма, метастатической колонизации и сайт-специфической терапии без потери операционных преимуществ10. Для проверки гипотез, касающихся зависимости от мишени, оптимизации режима дозирования, сравнительной эффективности или подтверждения механизма действия, CDX остается подходящей первичной платформой in vivo. Признанные ограничения данной модели, включая клональный дрейф, отсутствие стромы и иммунных компонентов человека, а также ограниченную прогностическую ценность на популяционном уровне, определяют ее правильное использование в качестве платформы для быстрого скрининга и изучения механизмов, а не как суррогата клинического исхода.
Создание модели PDX: источники опухолей, имплантация и биология приживления
Жизнеспособный опухолевый материал чаще всего получают при хирургической резекции, а также при трепан-биопсии, заборе злокачественных выпотов или аспирации костного мозга при гематологических новообразованиях31. Радикальная резекция позволяет получить большие объемы жизнеспособной ткани с сохраненной архитектурой; тем не менее, биопсия дает достаточное количество материала, если она направлена на метастатические или нерезектабельные очаги заболевания31,36. Ткань необходимо транспортировать в холодном буферном растворе и обработать в течение ~24 h; теплая ишемия более 2 h и интервалы ex vivo более 8–10 h прогрессивно снижают эффективность приживления. Одобрение институционального наблюдательного совета и письменное информированное согласие являются обязательными.
Опухолевый материал измельчают до фрагментов размером 1–3 мм3, чтобы сохранить архитектуру внеклеточного матрикса и пространственную гетерогенность, либо диссоциируют в суспензии одиночных клеток для последующей сортировки и инокуляции с нормализацией дозы. Для поддержки ранней васкуляризации часто используют совместную имплантацию с Matrigel; его эффект вариабелен и должен быть указан в отчете, так как он изменяет контекст микроокружения31. Гормональная поддержка — пеллеты эстрадиола для ER-положительных опухолей молочной железы и дигидротестостерон для опухолей простаты — улучшает приживаемость гормонозависимых злокачественных новообразований. Подкожная имплантация в область спинного фланка позволяет проводить мониторинг с помощью штангенциркуля и отличается операционной простотой; ортотопическая имплантация восстанавливает органоспецифическое микроокружение; а имплантация под почечную капсулу максимизирует показатели приживаемости для труднотрансплантируемых типов опухолей, включая немелкоклеточный рак легкого (NSCLC) и рак простаты31.
Приживление опухолевых клеток сильно зависит от типа опухоли. Агрессивные, низкодифференцированные, резистентные к терапии или метастатические опухоли приживаются легче, чем индолентные или высокодифференцированные; трижды негативный рак молочной железы, протоковая аденокарцинома поджелудочной железы, серозный рак яичников высокой степени злокачественности и острые лейкозы демонстрируют более стабильное приживление по сравнению с люминальным раком молочной железы типа A и другими сущностями с низким процентом приживления, при этом сам факт успешного приживления предсказывает неблагоприятный прогноз для пациентов с трижды негативным раком молочной железы и панкреатобилиарными злокачественными новообразованиями10. Вторым важным определяющим фактором является линия хозяина: высокоиммунодефицитные линии, такие как NSG и NOG, вытеснили мышей nude и SCID при работе со сложными или гематологическими случаями благодаря их более широкой восприимчивости9.
По общепринятому соглашению, первичная имплантация пациенту обозначается как F0 (или P0), а последующие серийные пассажи — как F1, F2 и так далее. Кинетика роста обычно стабилизируется после первых пассажей, и в большинстве программ для проведения формальных фармакологических исследований используют материал F2 или F3, чтобы снизить межиндивидуальную вариабельность между мышами, хотя универсального порога не существует; большинство программ определяют ранний пассаж как F2–F4, при этом материал после F5 несет в себе возрастающий риск субклонального разрастания и транскрипционного дрифта со скоростью, зависящей от типа опухоли. Поскольку номер пассажа влияет как на воспроизводимость, так и на биологический дрифт, история пассажей, линия хозяина, место имплантации и происхождение должны фиксироваться для каждого исследования в соответствии со стандартом отчетности PDX-MI19.
Иммунодефицитные линии хозяев
Атимические голые (Foxn1nu) мыши лишены зрелых T-клеток, но сохраняют B-клетки, NK-клетки и врожденный иммунитет. Мыши CB-17 scid, имеющие мутацию с потерей функции в гене Prkdc, лишены T- и B-клеток из-за дефекта V(D)J-рекомбинации, но сохраняют NK-клетки и с возрастом развивают "leaky" лимфоциты9. Мутация scid на генетическом фоне NOD/ShiLtJ (NOD/SCID) добавила дефекты врожденного иммунитета, включая дефицит комплемента, нарушение функций макрофагов и дендритных клеток, а также снижение активности NK-клеток. Добавление нуль-мутации в общей гамма-цепи рецептора IL-2 (Il2rg), необходимой для передачи сигналов IL-2, IL-4, IL-7, IL-9, IL-15 и IL-21, устраняет функциональные NK-клетки и подавляет остаточный врожденный иммунитет, что приводит к созданию линий NSG (NOD.Cg-Prkdcscid Il2rgtm1wjI/SzJ) и NOG (NODShi.Cg-Prkdcscid Il2rgtm1sug); NSG несет полный нокаут Il2rg, тогда как NOG экспрессирует усеченный рецептор, который связывает лиганды, но не может передавать сигнал. NSG и NOG поддерживают приживление солидных и гематологических злокачественных новообразований и являются стандартными реципиентами для работы с PDX-моделями. В линии NRG (NOD.Cg-Rag1tm1Mom Il2rgtm1wjI) Prkdc заменен нокаутом Rag1, что сохраняет способность к репарации ДНК. Линия BRG (BALB/c-Rag2null Il2rgnull) представляет собой радиационно-толерантную альтернативу на фоне BALB/c, позволяющую избежать специфического для NOD аллеля Sirpa. Крысы SRG (двойной нокаут Rag2/Il2rg линии Sprague-Dawley) поддерживают клеточные линии и PDX-модели, которые плохо растут у NSG, включая рак простаты VCaP с приживаемостью >90%, и позволяют проводить серийный забор крови и тканей, ортотопические операции и изучение физиологически значимой фармакокинетики37.
Системы гуманизированных ксенографтов позволяют восстанавливать иммунные компоненты человека у тяжело иммунодефицитных мышей до или одновременно с трансплантацией опухоли38. Существует три основных формата: hu-PBMC (инъекция мононуклеарных клеток периферической крови взрослого человека), hu-CD34 (внутривенное введение человеческих гемопоэтических стволовых клеток (HSCs) CD34⁺ после сублетального облучения или кондиционирования бусульфаном) и BLT (совместная имплантация плодовой печени и тимуса с клетками CD34⁺, что обеспечивает наиболее полное развитие лимфоидной системы). Эти модели позволяют оценивать ингибиторы иммунных контрольных точек, биспецифические антитела, методы клеточной терапии и механизмы иммуноопосредованной резистентности38. Аутологичные или HLA-совместимые схемы предполагают использование опухолевого и иммунного компонентов от одного и того же донора. Эффективность восстановления зависит от источника донорского материала, линии реципиента, режима кондиционирования и продолжительности исследования; миелоидный, стромальный и лимфоидный отделы обычно представлены не полностью или несбалансированно: моделям hu-PBMC не хватает NK-клеток, B-клеток и миелоидных линий, несмотря на активное приживление T-клеток; модели hu-CD34 поддерживают многолинейный выход клеток, но в них недостаточно представлены обычные дендритные клетки и тканевые макрофаги; модели BLT обеспечивают более качественное тимусное обучение T-клеток, но остаются субоптимальными для восстановления миелоидного звена. У мышей hu-PBMC наблюдается быстрое восстановление T-клеток, однако в течение 3–6 недель развивается ксеногенная реакция «трансплантат против хозяина» (GvHD) из-за распознавания человеческими T-клетками мышиного MHC; варианты NSG-MHC-I/II-null частично нивелируют этот эффект22. Мыши hu-CD34 позволяют проводить более длительные исследования, но требуют более продолжительного периода восстановления и не полностью воспроизводят биологию миелоидных клеток, NK-клеток или стромы человека.
Ортотопические и метастатические модели
Подкожные ксенографты, несмотря на то что они являются стандартной платформой первого выбора для доклинических исследований, помещают ткань опухоли человека в биологический контекст, который отличается от микроокружения нативного органа. Состав внеклеточного матрикса, архитектура сосудов, парциальное давление кислорода, популяции стромальных клеток и паракринная сигнализация в подкожном пространстве спины отличаются от таковых в молочной железе, поджелудочной железе, брюшине, толстой кишке или легких10. Ортотопическая имплантация восстанавливает органоспецифическое микроокружение и обычно способствует усиленной васкуляризации и спонтанному метастазированию, что более точно воспроизводит естественное прогрессирование рака, однако это сопряжено с большей сложностью хирургического вмешательства и необходимостью мониторинга с помощью методов визуализации39.
Методы ортотопического PDX были расширены и применены для различных типов опухолей. PDX рака молочной железы создается в жировой клетчатке молочной железы, что способствует спонтанному метастазированию в легкие и лимфатические узлы40. PDX колоректального рака, имплантированный в стенку слепой или ободочной кишки, воспроизводит локальную инвазию и метастазирование в печень39. PDX рака яичников, введенный внутрибрюшинно, воспроизводит перитонеальное распространение, характерное для серозных карцином высокой степени злокачественности41. PDX протоковой аденокарциномы поджелудочной железы, имплантированный в поджелудочную железу, воспроизводит десмопластическую стромальную реакцию и раннюю локальную инвазию32. Используются две основные стратегии моделирования метастазирования: модели экспериментального метастазирования, при которых опухолевые клетки вводятся внутрисосудисто для оценки более поздних этапов метастатического каскада, таких как экстравазация и колонизация; и модели спонтанного метастазирования, при которых ортотопические первичные опухоли распространяются через полный каскад14.
Стандартизация, аутентификация и дизайн исследования
Эксперименты с ксенотрансплантатами определяются четырьмя руководствами по отчетности и дизайну исследований. PDX-MI устанавливает минимальный набор метаданных для моделей, полученных от пациентов, включая информацию о доноре, источник опухоли, линию хозяина, место имплантации, номер пассажа, приживаемость, а также гистологическую и молекулярную характеристику; аутентификация с помощью коротких тандемных повторов (STR) включена в контроль качества модели для подтверждения происхождения и обнаружения перекрестного загрязнения19. MISHUM распространяет аналогичные требования на гуманизированные системы, охватывая источник человеческих гемопоэтических стволовых клеток или PBMC, режим кондиционирования, линию хозяина, эффективность восстановления, подтвержденную методом проточной цитометрии, и мониторинг РТПХ20. OBSERVE (Oncology Best-practices: Signs, Endpoints and Refinements for In Vivo Experiments), консенсус EurOPDX/INFRAFRONTIER 2024 года, предоставляет рекомендации по совершенствованию методов и обеспечению благополучия животных специально для моделей рака у грызунов, дополняя более широкие руководства PREPARE и ARRIVE 2.023,42. Рекомендации консенсуса NCI PDXNet 2024 года касаются дизайна исследования, анализа роста опухоли и категоризации ответа для фармакологических экспериментов с PDX, а также предоставляют общедоступный набор аналитических инструментов43.
Данные концепции не полностью гармонизированы, и современное исследование ксенографтов может потребовать одновременного соблюдения рекомендаций PDX-MI, MISHUM, OBSERVE и PDXNet. На практике такие параметры, как номер пассажа, формула измерения опухоли, источник реципиента, метод аутентификации и заранее определенная аналитическая стратегия, часто опускаются43. Единая схема отчетности, охватывающая CDX, PDX и гуманизированные системы, по-прежнему остается актуальной потребностью. Общедоступные репозитории PDX включают Репозиторий моделей, производных от пациентов NCI (PDMR), портал данных EurOPDX и PDX Finder, которые в совокупности каталогизируют несколько тысяч моделей с соответствующими геномными, гистологическими и фармакологическими данными для облегчения идентификации и получения моделей18. Исследования CDX требуют рутинного STR-профилирования и контроля контаминации, тогда как исследования PDX требуют связи с случаем донора, молекулярного подтверждения драйверных признаков (где это возможно) и документирования содержания человеческих и мышиных клеток в разных пассажах19. Оценка объема опухоли остается противоречивой в разных исследованиях: применение различных формул без явного указания искажает оценки эффекта лечения и затрудняет сравнение результатов разных исследований; поэтому стандартизация метрик роста, порогов ответа, правил цензурирования и форматов визуализации столь же важна, как и стандартизация методов приживления43.
Геномная точность, клональная эволюция и трансляционная интерпретация
Модели PDX сохраняют драйверные мутации и ландшафты вариации числа копий на ранних пассажах более точно, чем CDX, что подтверждает целесообразность их использования для разработки биомаркеров, изучения резистентности и коклинического моделирования44. Однако в процессе пассирования происходят специфическая для мыши эволюция опухоли, замещение стромы и эпигенетическое перепрограммирование, а некоторые явные расхождения отражают субклональную выборку из пространственно гетерогенных опухолей, а не дрейф, вызванный моделью45. Ранние пассажи обеспечивают более сильное биологическое соответствие, чем материал после многократного пассирования, хотя на оба этих состояния влияют селективное давление места имплантации, иммунитет хозяина и предшествующее лечение45. Из этого следуют два практических принципа: модели PDX следует характеризовать лонгитюдно, а не считать статичными, а при выборе модели, имеющем серьезные последующие последствия, рекомендуется интегрировать данные секвенирования, гистопатологии, транскрипционного профилирования и ответа на лечение44.
Гуманизированные мышиные модели и их применение в иммуноонкологии
Гуманизированные системы, реконструированные с помощью человеческих PBMC, CD34⁺ HSC или ткани BLT, позволяют решить проблему невозможности моделирования полноценного иммунного микроокружения человека в обычных PDX-хозяевах. Модели hu-PBMC обеспечивают быструю реконституцию T-клеток, однако ограничены развитием ксеногенной РТХР в течение трех-шести недель; моделям hu-CD34 требуется 8–16 недель для мультилинейной реконституции, но они позволяют проводить более длительные исследования9. Внедрение трансгенов человеческих цитокинов дополнительно улучшило реконституцию специфических иммунных линий. Мыши NSG-SGM3 (трансгенные по человеческим IL-3, GM-CSF и SCF) поддерживают развитие миелоидных клеток и тучных клеток46. Мыши MISTRG (гуманизированные по M-CSF, IL-3, GM-CSF, SIRPα и тромбопоэтину) и мыши MISTRG6 (дополнительно гуманизированные по IL-6) на фоне Rag2⁻/⁻ Il2rg⁻/⁻ обеспечивают наиболее полную из доступных на данный момент реконституцию человеческих миелоидных клеток, NK-клеток и тканевых макрофагов, а также поддерживают приживление гемопоэтических стволовых клеток и клеток-предшественников костного мозга взрослых, которые не приживаются у других линий47. Мыши NOG-EXL (трансгенные по человеческим IL-3 и GM-CSF на фоне NOG) поддерживают реконституцию миелоидных и тучных клеток при более низких уровнях цитокинов, чем NSG-SGM3, что приводит к повышению долгосрочной выживаемости и менее выраженному синдрому активации макрофагов, делая их более подходящими для длительных исследований гуманизации и опухолей. Гуманизированные мыши, имплантированные человеческими T-клетками, позволяют моделировать синдром выброса цитокинов (CRS), что дает возможность проводить доклиническую характеристику профиля безопасности биспецифических активаторов T-клеток, антител, таргетирующих CD3, и родственных биологических препаратов, активирующих T-клетки. Ни одна линия не является универсально превосходящей; выбор зависит от интересующей иммунной линии и продолжительности исследования.
Конфигурацией с наивысшей степенью достоверности является аутологичная гуманизированная PDX-модель, в которой совместно приживляются гемопоэтические клетки и опухолевая ткань одного и того же пациента, что исключает несоответствие MHC между иммунным и опухолевым компартментами47. В 2023 году Chiorazzi и коллеги продемонстрировали, что аутологичные MISTRG6 PDX-модели формируют популяции врожденного и адаптивного иммунитета человека, которые инфильтрируют микроокружение опухоли, воспроизводят программы активации и истощения в CD8⁺ T-клетках и создают стимулируемый VEGF-A проопухолевый миелоидный профиль, ингибирование которого прекращает усиленный рост опухоли, что подтверждает пригодность данной конфигурации в качестве платформы для оценки иммунотерапии47. Phoon и коллеги применили этот подход к меланоме, показав, что аутологичные PBMC-гуманизированные PDX-модели отражают межпациентную вариабельность ответа на блокаду контрольных точек и модифицированные цитокины IL-248,49. Параллельный аутологичный подход, основанный на адоптивном переносе экспандированных ex vivo опухоль-инфильтрирующих лимфоцитов (TIL), полученных от пациента, мышам с соответствующими PDX-опухолями, использовался для моделирования эффективности TIL-терапии при меланоме и других солидных опухолях50. Тем не менее, интерпретация результатов исследований иммунотерапии в гуманизированных системах требует осторожности: некоторые антитела к иммунным контрольным точкам (например, анти-CTLA4, анти-PD1) обладают видоспецифичной перекрестной реактивностью, функция дендритных клеток и презентация антигена остаются неполными в большинстве гуманизированных линий, а такие структуры, как третичные лимфоидные органы и полностью функциональные герминативные центры, восстанавливаются редко51.
CAR-T клеточная терапия и ксенотрансплантационные модели
Терапия CAR-T клетками получила множество регуляторных одобрений для лечения гематологических злокачественных новообразований, и оценка на ксенотрансплантатах у иммунодефицитных мышей, несущих CDX- или PDX-опухоли, является стандартной доклинической платформой для человеческих препаратов CAR-T перед их клиническим внедрением52. Иммунологический дефицит хозяев класса NSG исключает из экспериментальной системы активацию макрофагов, кросс-презентацию дендритных клеток и супрессию, опосредованную регуляторными T-клетками, а мышиные ксенотрансплантаты не позволили предсказать системную токсичность, вызванную цитокинами, которая в дальнейшем наблюдалась у пациентов52. Систематический обзор и метаанализ 422 клинических исследований и 3157 доклинических работ, опубликованные в 2025 году, показали, что сигналы доклинической эффективности в ксенотрансплантационных моделях CAR-T в значительной степени гомогенны, не зависят от антигена и не позволяют разграничить конструкции CAR, которые впоследствии оказываются успешными или неудачными в клинических испытаниях53. Fløe и коллеги в 2025 году документально подтвердили, что межвидовые различия в цитокиновой сигнализации, плотности антигена, репертуаре T-клеточных рецепторов и взаимодействии опухоли с иммунной системой ограничивают трансляционный потенциал данных, полученных на ксенотрансплантатах CAR-T, и что сингенные модели используются примерно в 4% опубликованных доклинических исследований CAR-T52,53. Синдром выброса цитокинов (CRS) и синдром нейротоксичности, связанный с иммунными эффекторными клетками (ICANS), не воспроизводятся на стандартных ксенотрансплантатах NSG. Механистические исследования на хозяевах NSG-SGM3 показали, что CRS обусловлен преимущественно IL-1 и IL-6, вырабатываемыми моноцитами, при этом IL-1 и IL-6 в разной степени необходимы для развития CRS и нейротоксичности. Кроме того, нейтрализация GM-CSF снижает выраженность CRS и нейровоспаления, сохраняя при этом противоопухолевую активность CAR-T. Эти пути отражаются в цитокин-трансгенных и аутологичных гуманизированных конфигурациях, а не в обычных ксенотрансплантатах на базе NSG. Сингенные мышиные модели CAR-T предоставляют дополнительную платформу, позволяющую оценить взаимодействие CAR-T с полноценной иммунной системой хозяина, ценой зависимости от биологии мышиных, а не человеческих мишеней. Оценка на основе ксенотрансплантатов поддержала клиническое внедрение терапии CAR-T, направленной против CD19, где активность против моделей B-ALL и B-NHL у хозяев NSG соответствовала стойким клиническим ответам54.
Разработка лекарственных препаратов, поиск биомаркеров и трансляция на основе ИИ
Модели PDX направлены на предсказание клинического ответа на лекарственные препараты с большей точностью, чем модели CDX или GEMM. В клиническом исследовании PDX (PCT) компании Novartis 2015 года, проведенном Гао и коллегами, был применен дизайн 1 × 1 × 1 на ~1 000 моделях PDX, 62 режимах лечения и шести показаниях, что позволило выявить ассоциации между генотипом и ответом, а также установить известные и новые механизмы резистентности12. Применение концепции 1 × 1 × 1 на уровне отдельного пациента ограничено сроками создания модели (3–6 месяцев), из-за чего решения на основе PDX обычно принимаются при назначении терапии второй или третьей линии10. Исследования PDX способствовали валидации клинических биомаркеров, включая мутацию KRAS как предиктор резистентности к анти-EGFR терапии при колоректальном раке, активирующие мутации EGFR и мутации T790M для выбора ингибиторов тирозинкиназы при НМРЛ, амплификацию HER2 при раке молочной железы и желудка, а также платинорезистентность при раке яичников10.
Объемные наборы данных о ответе PDX-моделей на лекарственные препараты позволили применять методы машинного обучения для прогнозирования терапевтического ответа. В 2025 году Yang и коллеги описали TRANSPIRE-DRP — платформу глубокого обучения, использующую ненаправленную адаптацию домена для преобразования транскриптомных данных PDX в прогнозы ответа на уровне пациента; оценка проводилась для цетуксимаба, паклитаксела и гемцитабина55. В 2024 году Tosca и коллеги опубликовали систему трансляционного моделирования, в которой скорость роста опухолей PDX масштабировалась аллометрически для прогнозирования времени удвоения объема опухоли и выживаемости без прогрессирования в популяциях нелеченных пациентов с одиннадцатью типами солидных раков, при этом 91% прогнозируемых медиан времени удвоения объема опухоли находились в пределах 1,5-кратного отклонения от клинических наблюдений56. Остаются нерешенные проблемы: систематическая ошибка при отборе образцов в биобанки в пользу опухолей, склонных к приживлению, ограниченная проспективная клиническая валидация и отсутствие определенного нормативного пути для доклинических доказательств, полученных с помощью ИИ33,55.
Платформы ксенографтов не конкурируют за одну и ту же роль, а отвечают на разные трансляционные вопросы на различных стадиях разработки. Модели CDX остаются ключевыми для ранних механистических исследований и высокопроизводительного скрининга; модели PDX обеспечивают геномную точность и межпациентную гетерогенность, необходимые для валидации биомаркеров и моделирования клинического ответа; гуманизированные и аутологичные гуманизированные конфигурации позволяют решать специфические вопросы иммунотерапии, которые недоступны для обычных ксенографтов; а платформы на основе органоидов расширяют возможности высокопроизводительного анализа ex vivo в условиях ограниченного количества ткани; в совокупности эти платформы обеспечивают доклиническую оценку новых, установленных и альтернативных методов терапии рака57,58,59. Системы искусственного интеллекта и машинного обучения, такие как TRANSPIRE-DRP, а также трансляционные PK/PD модели теперь позволяют связать данные об ответе PDX на препарат с прогнозами ответа на уровне пациента, однако их клиническая полезность зависит от качества и стандартизации аннотации лежащих в их основе моделей. Основными нерешенными проблемами остаются прогностическая значимость, воспроизводимость отчетности, репрезентативность биобанков и регуляторный статус доклинических доказательств, полученных с помощью ИИ. Прогресс будет зависеть не столько от внедрения новых категорий моделей, сколько от дисциплинированного использования существующих, подкрепленного гармонизированными метаданными, продольной оценкой точности и прозрачной интеграцией данных между различными платформами.