YTHDC1 способствует цитоплазматическому экспорту M6A-модифицированного Rab27A, тогда как IGF2BP2 стабилизирует Rab27A в цитоплазме, тем самым усиливая дифференцировку остеокластов и способствуя остеопорозу.
Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.
Исследовательская статья
* These authors contributed equally
YTHDC1 способствует цитоплазматическому экспорту M6A-модифицированного Rab27A, тогда как IGF2BP2 стабилизирует Rab27A в цитоплазме, тем самым усиливая дифференцировку остеокластов и способствуя остеопорозу.
Разработка новых методов лечения остеопороза привлекает всё большее внимание. Rab27A повышается во время дифференцировки остеокластов, и модификация N6-метиладенозина (m6A) стала важным эпигенетическим регулятором в ортопедических заболеваниях. Биоинформатические анализы предсказали, что Rab27A содержит несколько сайтов модификации m6A и взаимодействует с несколькими белками, ассоциированными с m6A. Были проведены эксперименты с нокдауном для оценки роли Rab27A в дифференциации остеокластов и остеопорозе с использованием овариэктомизированной (OVX) мышиной модели. Истощение Rab27A ослабило остеопороз и увеличило процент образования костей с 14,73% до 28,13% (P < 0,05) у мышей OVX. Вестерн блоттинг и количественное ПЦР показали, что нокдаун Rab27A снижает экспрессию белков и мРНК маркеров остеокластов TRAP, NFATc1 и c-FOS, тем самым подавляя дифференциацию остеокластов макрофагов, полученных из костного мозга (BMM), индуцированных макрофагами, стимулирующими колонии (M-CSF) и активатором рецепторов лиганда ядерного фактора κB (RANKL). Окрашивание TRAP также показало, что истощение Rab27A значительно снижало активность TRAP с 24,1% до 12,9% (P < 0,01) после индукции M-CSF и RANKL. Иммунопреципитационные анализы РНК подтвердили взаимодействия между Rab27A и белками-ридерами m6A YTHDC1 и IGF2BP2. Ядерное и цитоплазматическое фракционирование показало, что YTHDC1 способствует цитоплазматическому экспорту M6A-модифицированного Rab27A. Кроме того, анализы q-PCR и western blot показали, что снижение YTHDC1 или IGF2BP2 снижает экспрессию Rab27A и снижает экспрессию TRAP, NFATc1 и c-FOS, тем самым подавляя дифференцировку остеокластов, вызванную M-CSF и RANKL. В совокупности эти результаты показывают, что экспорт цитоплазматыки, опосредованный YTHDC1, и стабилизация IGF2BP2-опосредованной M6A-модифицированного Rab27A способствуют дифференцировки остеокластов и способствуют потере костной ткани в модели мышей OVX.
Остеопороз (ОП) — это распространённое скелетное заболевание, характеризующееся ухудшением микроархитектуры костей и снижением минеральной плотности костей, что приводит к повышенному риску переломов вовсём мире 1,2,3. Остеопоротические переломы чаще всего встречаются в предплечье, плечевой кости, бедре и позвоночнике и особенно распространены среди пожилых людей. Эти переломы существенно ухудшают качество жизни и накладывают значительные физические, психологические и социально-экономические нагрузки на пациентов, их семьи и системыздравоохранения 3. Таким образом, профилактика, лечение и лечение остеопороза остаются основными приоритетами в области клинической и общественной общественной сферы.
Разработано множество терапевтических стратегий для остеопороза, которые обычно можно классифицировать на две категории: костнообразующие средства и антиресорбционныетерапии 4,5. Традиционные антиресорбные препараты включают бисфосфонаты, ралоксифен и стронций ранелат, тогда как более новые препараты включают деносумаб, оданакатиб и саракатиниб. Терапии, формирующие кости, включают паратиреоидный гормон (PTH 1–84), а несколько дополнительных кандидатов, таких как MK-5442, AMG 785 и BHQ 880, находятся в стадии клиническойразработки 5. Хотя эти методы могут быть эффективными, многие из них связаны со значительными побочными эффектами, ограниченной долгосрочной эффективностью или ограничениями длительногоприменения 4,6,7,8,9. Например, длительное введение аминобисфосфонатов и деносумаба может ухудшить нормальное ремоделированиекостей 5. Поэтому выявление более безопасных и эффективных терапевтических целей остаётся важной задачей в исследованиях остеопороза.
Белки Rab являются ключевыми регуляторами внутриклеточного движения везикул и клеточной сигнализации, участвуя в различных биологических процессах, включая вирусные инфекции, аутофагию и организациюцитоскелета 10. В последние годы всё больше внимания уделяется роли белков семейства Rab в метаболизме костей и остеопорозе. Сообщается, что Rab44 регулирует дифференциацию остеокластов, модулируя внутриклеточную сигнализацию Ca2⁺ и активируя ядерный фактор активированных Т-клеток 1 (NFATc1) в рецепторном активаторе макрофагов с ядерным фактором κB (RANKL), обработанного с помощьюмакрофагов 11. Остеокласты — это многоядерные клетки, происходящие из предшественников линии макрофагов, которые играют важную роль в резорбции костей и скелетном гомеостазе 12,13,14,15,16,17,18,19. Поэтому понимание молекулярных механизмов, управляющих дифференциацией остеокластов, крайне важно для разработки новых терапевтических подходов при остеопорозе.
Rab27A является важным представителем семейства Rab GTPase и широко экспрессируется в секреторных и иммунных клетках. Он играет ключевую роль в транспорте везикул, экзоцитозе и внутриклеточной сигнализации 20,21,22,23,24,25,26,27. Предыдущие исследования показали, что Rab27A регулирует дегрануляцию эозинофилов при воспалении дыхательных путей и контролирует везикулярную мобилизацию, связанную с активностью оксидазы NADPH у активированныхмакрофагов 20.23. Примечательно, что накопленные данные свидетельствуют о значительном повышении экспрессии Rab27A во время дифференцировки остеокластов. Шимада-Сугавара и др. сообщили, что экспрессия Rab27A увеличивается во время дифференцировки макрофагов, полученных из костного мозга (BMM), в остеокласты, что указывает на потенциальную роль востеокластогенезе 28. В совокупности эти данные свидетельствуют о том, что Rab27A может влиять на формирование и функцию остеокластов, регулируя везикулярную транспортировку и внутриклеточные сигнальныепути 28,29.
N6-метиладенозин (m6A) является самой распространённой внутренней модификацией РНК в эукариотических мессенджерных РНК и некодирующих РНК и служит важным регулятором метаболизма РНК и экспрессии генов. Будучи первой выявленной модификацией мРНК у млекопитающих, m6A участвовал во множестве биологических процессов, включая стабильность РНК, сплайсинг, транспорт и трансляцию. Ванг и др. показали, что модификации m6A, часто встречающиеся в консервативных последовательностях мотивов, распознаются белками, содержащими домен YTH, и способствуют регуляции стабильности и метаболизмамРНК 30. Кроме того, модификация m6A участвует в различных биологических функциях, включая стабильность генома, регуляцию транскрипции, организацию хроматина, прогрессирование рака и иммунныеответы 31. Недавние исследования также подчеркнули важную роль сигнализации m6A при костных заболеваниях иостеопорозе 32.
Среди белков, считывающих m6A, YTHDC1 выполняет функции ядерного считывателя, регулирующего обработку РНК и ядерный экспорт, тогда как инсулиноподобный фактор роста 2, мРНК-связывающий белок 2 (IGF2BP2), стабилизирует m6A-модифицированные транскрипты в цитоплазме. Чен и др. показали, что YTHDC1 способствует ядерному экспорту m6A-модифицированного circNSUN2, который затем взаимодействует с IGF2BP2 для стабилизации мРНК HMGA2 и стимулирования метастазирования колоректального рака33. Эти результаты свидетельствуют о том, что координированная регуляция YTHDC1 и IGF2BP2 может представлять собой общий механизм, контролирующий судьбу транскриптов, модифицированных m6A.
В данном исследовании рассматривались предсказаемые участки модификации m6A в мРНК Rab27A и изучены их взаимодействия с YTHDC1 и IGF2BP2. Было установлено, что YTHDC1 способствует ядерному экспорту транскриптов Rab27A, модифицированных m6A, тогда как IGF2BP2 взаимодействует с Rab27A в цитоплазме и повышает его стабильность. Благодаря этому регуляторному механизму Rab27A способствовал дифференцированию остеокластов и способствовал прогрессированию остеопороза. В совокупности результаты выявляют ранее не распознанный m6A-зависимый регуляторный путь, включающий YTHDC1, IGF2BP2 и Rab27A в дифференциации остеокластов. Эти результаты дают новые знания о молекулярном патогенезе остеопороза и могут способствовать разработке новых терапевтических стратегий, направленных на регуляцию Rab27A, опосредованную m6A.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Все процедуры на животных были одобрены Комитетом по защите и использованию животных аффилированной больницы Юго-Западного медицинского университета (Одобрение No 2024-Ethics-042). Все эксперименты проводились в соответствии с руководящими принципами ARRIVE, Законом Великобритании о животных (научные процедуры) 1986 года и соответствующими рекомендациями, Директивой ЕС 2010/63/EU и Руководством Национальных институтов здоровья по уходу и использованию лабораторных животных (публикация NIH No 8023, пересмотренная 1978 год). Мыши случайным образом распределялись по экспериментальным группам, а последовательность распределения была скрыта от исследователя. Все сборы и анализ данных, включая гистологическую оценку, микрокомпьютерную томографию (микро-КТ) и статистический анализ, проводились исследователями, не обращая внимания на распределение групп. Из анализа не было исключено ни животные, ни образцы. Все реагенты, оборудование, программное обеспечение и другие ресурсы, используемые в этом протоколе, перечислены в Таблице материалов.
1. Построение модели овариэктомии (OVX)
Для создания модели остеопороза использовали двадцать четыре мыши дикого типа C57BL/6 в возрасте 8 недель. После 1-недельного периода акклиматизации мышей случайным образом распределяли либо в группу Sham, либо OVX. Модель OVX была установлена с помощью двусторонней овариэктомии, как описаноранее 34,35. Мыши, оперированные с имитацией, подверглись хирургическому воздействию яичников без удаления.
Для внутрибедренной доставки лентивирусных векторов, экспрессирующих sh-Rab27A или sh-NC, были введены через 7 дней после операции OVX, как ранеесообщалось 36,37. Кратко, концентрированные лентивирусные частицы (1 × 106 трансдукционных единиц/мл) вводились в бедренную кость через надколенник с помощью 22-гейджной иглы под анестезией. Каждая мышь получала 20 мкл лентивирусной суспензии. Затем разрез был зашит, а животные находились под наблюдением на протяжении всего восстановления.
Все эксперименты на животных проводились в определённых условиях, свободных от патогенов. Образцы бедренной кости были собраны через 8 недель после операции. Для гистологического анализа и экстракции РНК или белка использовалось не менее шести мышей в группе.
2. Микро-КТ в организме
Для оценки морфологии трабекулярной кости была проведена микрокомпьютерная томография (микро-КТ). Правая большеберцовая кость каждой мыши была сканирована in vivo перед операцией OVX в возрасте 14 недель. Повторные обследования проводились еженедельно до 22 недель. В микро-КТ-анализ было включено не менее шести мышей в группу.
Мышей анестезиировали внутрибрюшническим раствором пентобарбитала натрия (50 мг/кг массы тела). Адекватная анестезия подтверждалась отсутствием рефлекса сжатия пальцев и постоянным контролем частоты дыхания, которая сохранялась на протяжении всей процедуры визуализации. Все процедуры эвтаназии проводились в соответствии с утверждённым протоколом для животных, институциональными рекомендациями по благополучию животных и национальными правилами эвтаназии лабораторных животных.
В возрасте 24 недель мышей эвтаназировали путем вывиха шейки матки после глубокой анестезии, а обе большеберцовые кости были взяты для ex vivo сканирования с использованием того же протокола визуализации. Параметры сканирования включали размер вокселей 10,4 мкм, напряжение 55 кВ, ток 145 мА, поле зрения 32 мм, 1500/750 образцов на проекцию и время интеграции 100 мс.
Изображения обрабатывались с использованием алгоритма коррекции полимерного усиления пучка третьего порядка, калиброванного против фантома 1200 мг HA/см³ 3 . Фракция костного объёма (BV/TV), толщина трабекуляров (Tb.Th) и трабекулярное число (Tb.N) были количественно измерены в дистальной бедренной метафизе, расположенной в 1,0 мм проксимально от пластины роста.
3. Плазмидная трансфекция
Плазмиды sh-Rab27A и sh-NC были созданы и использованы для производства лентивирусов. Лентивирусные упаковочные плазмиды и шРНК-конструкции были котрансфектированы в HEK293T клетки согласно инструкциям производителя. Титры вируса определялись до внутрибедренного введения, как было описаноранее 36. Были проведены три независимые биологические реплики.
4. Окрашивание гематоксилином и эозином (HE)
Бедренные образцы фиксировались в 4% параформальдегида в течение 24 часов, декальцифицированы в 10% ЭДТА в течение 4 недель, криопротектированы 30% сахарозой/PBS, вложены в парафин и секциированы толщиной 5 мкм. Срезы ткани были окрашены гематоксилином и эозином и исследованы под световым микроскопом. В каждой группе было проанализировано не менее шести мышей.
5. Окрашивание кислотной фосфатазы, устойчивой к тартратам (TRAP)
Окрашивание бедренных срезов с помощью TRAP проводилось согласно инструкции производителя38. Активность TRAP в макрофагах костного мозга (BMM) была оценена с помощью окрашивающего теста TRAP. Зрелые остеокласты были определены как TRAP-положительные многоядерные клетки, содержащие не менее трёх ядер. Были проведены три независимые биологические реплики, каждая с тремя техническими репликами.
6. q-PCR
Общая РНК была выделена с помощью реагента TRIzol согласно инструкциям производителя. Комплементарная ДНК была синтезирована с помощью обратной транскриптазы и подвергнута количественной ПЦР в реальном времени с использованием химии SYBR Green. Были проведены три независимые биологические реплики, каждая с тремя техническими репликами.
Последовательности праймеров были следующими:
Rab27A: F, TTCCTGCTTCTGTTCGACCT; R, GGCAGCACTGGTTTCAAAT
TRAP: F, TGTTGACAGCGGTCCATCTA; R, CCTCCTTCTTAACCCGAAGC
NFATc1: F, GGTGCTCTCTGGCCATAACT; R, GCGGAAAGGTGTGTATCTCAA
c-FOS: F, TACTACCATTCCCCAGCCGA; R, GCTGTCACCGTGGGGATAAA
YTHDC1: F, GAAGTGGAAGCTCTGCATCAG; R, TTGATCTTTTCGGACAGCACG
IGF2BP2: F, GACTACCCCGACCAGAACTG; R, GAGGCGGGGGGTTCCGAATC
β-актин: F, GGGAAATCGTGCGTGACATTAAG; R, TGTGTTGGCGTACAGGTCTTTG
7. Вестерн-блоттинг
Клетки или ткани лизировали с помощью буфера RIPA с дополнением ингибиторов протеаз. Концентрации белка определялись с помощью брадфордского анализа. Равные количества белка (20 мкг) отделялись SDS-PAGE и переносились на мембраны поливинилиденфторида (PVDF) или нитроцеллюлозы. Мембраны блокировались 5% обезжиренным молоком в течение 1 часа при комнатной температуре и инкубировали ночью при 4 °C первичными антителами против TRAP, NFATc1, c-FOS, Rab27A, YTHDC1, IGF2BP2 или β-актина. После промывки мембраны инкубировали соответствующими вторичными антителами в течение 1 часа при комнатной температуре. Белковые диапазоны визуализировались с использованием стандартных процедур обнаружения. Были проведены три независимые биологические реплики.
8. Клеточная культура
Макрофаги, полученные из костного мозга (BMM), были выделены, как описаноранее 39. Клетки костного мозга, взятые с бедренных мышей, были выращены за ночь в α минимально необходимой среде с добавлением сыворотки плода с 10% плодовой сывороткой, 30 нг/мл макрофага, колонистимулирующего фактор (M-CSF) и 1% пенициллина/стрептомицина при 37 °C в увлажнённой атмосфере с содержанием 5% CO₂. Неадгерентные клетки были собраны и культивированы в стромально-свободной клеточной системе с содержанием 30 нг/мл M-CSF. Через 3 дня адгерирующие клетки были собраны в виде BMM и дополнительно культивировались в присутствии активатора рецепторов с концентрацией 30 нг/мл M-CSF и 50 нг/мл рецепторов ядерного фактора-κB лиганда (RANKL) в течение 72 часов для индуцирования дифференцировки остеокластов.
9. Интерференция РНК (РНКи)
Малые интерферирующие РНК (siRNA) синтезировались и трансфектировались с помощью липидного трансфекционного реагента согласно инструкциям производителя. Клетки засеивались с плотностью 2 × 104 клеток на каждую скважину в пластинах с шестью колодцями до трансфекции. Были проведены три независимые биологические реплики.
Целевые последовательности были следующими:
si-Rab27A: GGACUUAAUCAUCTAAGAAUGGAA
si-YTHDC1: GCAAGGAGUGUUAUAUCUUAATT
si-IGF2BP2: CCGUUAACCAACAAGCCAATT
10. Иммунофлуоресценция
Клетки фиксировались с помощью 4% параформальдегида в течение 20 минут и проницаемы с помощью 0,1% тритона X-100 в течение 10 минут. После блокировки 5% бычьей сывороткой альбумина в течение 30 минут клетки инкубировали с первичными антителами ночью при 4 °C.
После стирки на 30 минут при комнатной температуре применялись вторичные антитела, конъюгированные с фторофором. Ядра были контрокрашены DAPI, а изображения получены с помощью конфокальной микроскопии. Были проведены три независимые биологические реплики.
11. Ядерное и цитоплазматическое разделение
Ядерные и цитоплазматические фракции были выделены согласно инструкциям производителя. Клетки лизировали на льду в течение 10 минут и центрифугировали при 500 × г в течение 3 минут при 4 °C. Супернатант, содержащий цитоплазматические компоненты, был собран, а ядра с гранулами промывались и обрабатывались отдельно.
12. Иммунопреципитация белков, связывающих РНК (RIP)
Иммунопреципитационные анализы РНК (RIP) проводились согласно инструкциям производителя. Кратковременно клетки находились на льду в течение 30 минут. После центрифугирования супернатанты инкубировали за ночь с помощью антител и агарозных шариков белка A/G. После промывания иммунопреципитанные белки анализировались методом западного блоттинга, а коиммунопреципитанная РНК — с помощью количественной ПЦР в реальном времени. Были проведены три независимые биологические реплики.
13. Анализ стабильности мРНК Rab27A
Общая РНК была извлечена в указанные моменты времени после IGF2BP2 нокдауна. Впоследствии были проведены обратная транскрипция и количественная ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК Rab27A были нормализованы до соответствующей группы si-NC в 0 часа. Были проведены три независимые биологические реплики.
14. Статистический анализ
Все эксперименты проводились независимо с использованием как минимум трёх биологических репликат. Для q-PCR, РНК-интерференции, TRAP-окрашивания, западного блотинга и других клеточных анализов каждая биологическая реплика включала три технических реплики, если не указано иное. Данные представлены как среднее ± стандартного отклонения (SD).
Статистический анализ проводился с использованием программного обеспечения GraphPad Prism версии 9.0 и SPSS. Сравнения между двумя группами проводились с помощью двухстороннего t-теста Student. Сравнения между несколькими группами анализировались с помощью двустороннего анализа дисперсии (ANOVA), а затем последовал пост-хок тест Тьюки с множественным сравнением для корректировки множественных сравнений. Значение P < 0,05 считалось статистически значимым.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Снижение Rab27A снизило остеопороз in vivo.
Для изучения роли Rab27A в остеопорозе был проведен knockdown Rab27A на овариэктомизированной (OVX) мышиной модели, установленной с использованием ранее описанныхметодов 34,40. Общий дизайн исследования изложен на рисунке 1. Микрокомпьютерная томография показала, что у мышей OVX минеральная плотность, об...
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Дифференциация остеокластов играет важную роль в ремоделировании костей, резорбции костей, восстановлении переломов и гомеостазескелета 12˒15˒17˒18˒42˒43. Чрезмерная активность остеокластов является одним из основных факторов остеопороза, что делает выявление регуляторных путей, контролирующих дифференцировку остеокластов, важной целью исследован...
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Авторы не заявляют о конкурирующих финансовых интересах или конфликтах интересов.
Эта работа была финансово поддержана Научно-технологическим стратегическим проектом сотрудничества между Пэнчжоуской народной больницей и Юго-Западным медицинским университетом (грант No 2023PZXNYD01) Лян Тан.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| 4% Paraformaldehyde | Thermo Fisher Scientific | A5818101 | Tissue and cell fixation |
| Alexa Fluor 488 secondary antibody | Thermo Fisher Scientific | A-11001 | Fluorescent secondary antibody for immunofluorescence; RRID: AB_2534069 |
| Alexa Fluor 546 secondary antibody | Thermo Fisher Scientific | A-11035 | Fluorescent secondary antibody for immunofluorescence; RRID: AB_2534093 |
| Bovine serum albumin (BSA) | Merck | A2153 | Blocking reagent |
| Bradford Protein Assay | Merck | B6916 | Protein quantification |
| C57BL/6JSlac mice | Shanghai SLAC Laboratory Animal Co., Ltd. | — | Female, 8 weeks old; RRID: MGI:2159769 |
| c-FOS antibody | Abcam | ab222699 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_2891049 |
| Confocal laser scanning microscope (SP8) | Leica Microsystems | SP8 | Immunofluorescence image acquisition; RRID: SCR_018169 |
| DAPI | Thermo Fisher Scientific | D3571 | Nuclear counterstain for immunofluorescence; RRID: AB_2307445 |
| EDTA | Merck | V900081-500G | Tissue decalcification reagent |
| Eosin | Solarbio | G1100 | Histological cytoplasmic stain |
| Fetal bovine serum (FBS) | Thermo Fisher Scientific | A5669701 | Cell culture supplement |
| GraphPad Prism | GraphPad Software | Version 9.0 | Statistical analysis software; RRID: SCR_002798 |
| Hematoxylin | Cell Signaling Technology | #14166 | Histological nuclear stain |
| IBM SPSS Statistics | IBM | Windows version | Statistical analysis software; RRID: SCR_016479 |
| IGF2BP2 antibody | Proteintech | 11601-1-AP | Primary antibody for western blotting and immunofluorescence; RRID: AB_2122672 |
| Inverted light microscope (DMi8) | Leica Microsystems | DMi8 | Histological image acquisition; RRID: SCR_026672 |
| Lentiviral titer quantification kit | Takara Bio | 631235 | Lentiviral titer determination |
| Lipofectamine 3000 | Thermo Fisher Scientific | L3000015 | Plasmid transfection reagent |
| Lipofectamine RNAiMAX | Thermo Fisher Scientific | 13778150 | siRNA transfection reagent |
| M-CSF | MedChemExpress | HY-P7085 | Osteoclast differentiation factor |
| Micro-computed tomography system | Scanco Medical | VivaCT80 | Bone morphometric analysis |
| M-MLV Reverse Transcriptase | Promega | M1701 | cDNA synthesis |
| NFATc1 antibody | Santa Cruz Biotechnology | sc-7294 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_2152503 |
| PARIS Kit | Thermo Fisher Scientific | AM1556 | Nuclear and cytoplasmic fractionation |
| Penicillin/Streptomycin | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | Antibiotic supplement for cell culture |
| Power SYBR Green Master Mix | Thermo Fisher Scientific | 4367659 | Quantitative real-time PCR |
| Protease inhibitor cocktail | Thermo Fisher Scientific | 78429 | Prevention of protein degradation |
| Protein A/G agarose beads | Merck | IP05 | Immunoprecipitation |
| PVDF membrane | Thermo Fisher Scientific | 88520 | Protein transfer membrane for western blotting |
| Rab27A antibody | Abcam | ab55667 | Primary antibody for western blotting and immunofluorescence; RRID: AB_945112 |
| RANKL | MedChemExpress | HY-P7425 | Osteoclast differentiation factor |
| Real-time PCR system | Applied Biosystems | ABI7900HT | Quantitative real-time PCR instrument |
| RIPA buffer | Thermo Fisher Scientific | 78501 | Protein extraction buffer |
| RNA Immunoprecipitation (RIP) Kit | Millipore | RIP-12RXN | RNA immunoprecipitation assay |
| SDS-PAGE reagents | Thermo Fisher Scientific | BT041210BOX | Protein electrophoresis |
| shRNA plasmids | RiboBio | — | Gene silencing by RNA interference |
| Small interfering RNAs (siRNAs) | GenePharma | — | Gene silencing by RNA interference |
| SRAMP | Online resource | — | Prediction of m6A modification sites; RRID: SCR_024500 |
| StarBase (ENCORI) | Online resource | — | RNA interaction prediction database; RRID: SCR_016303 |
| TRAP antibody | Abcam | ab2391 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_303034 |
| TRAP staining kit | Merck | 387A | Detection of osteoclast activity |
| Triton X-100 | Thermo Fisher Scientific | 85111 | Cell permeabilization reagent |
| TRIzol Reagent | Thermo Fisher Scientific | 15596026CN | Total RNA isolation |
| YTHDC1 antibody | Abcam | ab122340 | Primary antibody for western blotting; RRID: AB_11128253 |
| α-MEM | FUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation | 139-15651 | Cell culture medium |
| β-Actin antibody | Merck | A5441 | Loading control for western blotting; RRID: AB_476744 |
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.