Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.

Исследовательская статья

Модификация Rab27A на основе N6-метиладенозина способствует остеопорозу, влияя на дифференцировку остеокластов в модели овариэктомизированной мыши

88 просмотров

⸱

DOI:

10.3791/71964

⸱

11 августа 2026 г.

 ,  ,  ,  ,  ,  ,  , 

* These authors contributed equally

В этой статье

Краткое содержание

YTHDC1 способствует цитоплазматическому экспорту M6A-модифицированного Rab27A, тогда как IGF2BP2 стабилизирует Rab27A в цитоплазме, тем самым усиливая дифференцировку остеокластов и способствуя остеопорозу.

Аннотация

Разработка новых методов лечения остеопороза привлекает всё большее внимание. Rab27A повышается во время дифференцировки остеокластов, и модификация N6-метиладенозина (m6A) стала важным эпигенетическим регулятором в ортопедических заболеваниях. Биоинформатические анализы предсказали, что Rab27A содержит несколько сайтов модификации m6A и взаимодействует с несколькими белками, ассоциированными с m6A. Были проведены эксперименты с нокдауном для оценки роли Rab27A в дифференциации остеокластов и остеопорозе с использованием овариэктомизированной (OVX) мышиной модели. Истощение Rab27A ослабило остеопороз и увеличило процент образования костей с 14,73% до 28,13% (P < 0,05) у мышей OVX. Вестерн блоттинг и количественное ПЦР показали, что нокдаун Rab27A снижает экспрессию белков и мРНК маркеров остеокластов TRAP, NFATc1 и c-FOS, тем самым подавляя дифференциацию остеокластов макрофагов, полученных из костного мозга (BMM), индуцированных макрофагами, стимулирующими колонии (M-CSF) и активатором рецепторов лиганда ядерного фактора κB (RANKL). Окрашивание TRAP также показало, что истощение Rab27A значительно снижало активность TRAP с 24,1% до 12,9% (P < 0,01) после индукции M-CSF и RANKL. Иммунопреципитационные анализы РНК подтвердили взаимодействия между Rab27A и белками-ридерами m6A YTHDC1 и IGF2BP2. Ядерное и цитоплазматическое фракционирование показало, что YTHDC1 способствует цитоплазматическому экспорту M6A-модифицированного Rab27A. Кроме того, анализы q-PCR и western blot показали, что снижение YTHDC1 или IGF2BP2 снижает экспрессию Rab27A и снижает экспрессию TRAP, NFATc1 и c-FOS, тем самым подавляя дифференцировку остеокластов, вызванную M-CSF и RANKL. В совокупности эти результаты показывают, что экспорт цитоплазматыки, опосредованный YTHDC1, и стабилизация IGF2BP2-опосредованной M6A-модифицированного Rab27A способствуют дифференцировки остеокластов и способствуют потере костной ткани в модели мышей OVX.

Введение

Остеопороз (ОП) — это распространённое скелетное заболевание, характеризующееся ухудшением микроархитектуры костей и снижением минеральной плотности костей, что приводит к повышенному риску переломов вовсём мире 1,2,3. Остеопоротические переломы чаще всего встречаются в предплечье, плечевой кости, бедре и позвоночнике и особенно распространены среди пожилых людей. Эти переломы существенно ухудшают качество жизни и накладывают значительные физические, психологические и социально-экономические нагрузки на пациентов, их семьи и системыздравоохранения 3. Таким образом, профилактика, лечение и лечение остеопороза остаются основными приоритетами в области клинической и общественной общественной сферы.

Разработано множество терапевтических стратегий для остеопороза, которые обычно можно классифицировать на две категории: костнообразующие средства и антиресорбционныетерапии 4,5. Традиционные антиресорбные препараты включают бисфосфонаты, ралоксифен и стронций ранелат, тогда как более новые препараты включают деносумаб, оданакатиб и саракатиниб. Терапии, формирующие кости, включают паратиреоидный гормон (PTH 1–84), а несколько дополнительных кандидатов, таких как MK-5442, AMG 785 и BHQ 880, находятся в стадии клиническойразработки 5. Хотя эти методы могут быть эффективными, многие из них связаны со значительными побочными эффектами, ограниченной долгосрочной эффективностью или ограничениями длительногоприменения 4,6,7,8,9. Например, длительное введение аминобисфосфонатов и деносумаба может ухудшить нормальное ремоделированиекостей 5. Поэтому выявление более безопасных и эффективных терапевтических целей остаётся важной задачей в исследованиях остеопороза.

Белки Rab являются ключевыми регуляторами внутриклеточного движения везикул и клеточной сигнализации, участвуя в различных биологических процессах, включая вирусные инфекции, аутофагию и организациюцитоскелета 10. В последние годы всё больше внимания уделяется роли белков семейства Rab в метаболизме костей и остеопорозе. Сообщается, что Rab44 регулирует дифференциацию остеокластов, модулируя внутриклеточную сигнализацию Ca2⁺ и активируя ядерный фактор активированных Т-клеток 1 (NFATc1) в рецепторном активаторе макрофагов с ядерным фактором κB (RANKL), обработанного с помощьюмакрофагов 11. Остеокласты — это многоядерные клетки, происходящие из предшественников линии макрофагов, которые играют важную роль в резорбции костей и скелетном гомеостазе 12,13,14,15,16,17,18,19. Поэтому понимание молекулярных механизмов, управляющих дифференциацией остеокластов, крайне важно для разработки новых терапевтических подходов при остеопорозе.

Rab27A является важным представителем семейства Rab GTPase и широко экспрессируется в секреторных и иммунных клетках. Он играет ключевую роль в транспорте везикул, экзоцитозе и внутриклеточной сигнализации 20,21,22,23,24,25,26,27. Предыдущие исследования показали, что Rab27A регулирует дегрануляцию эозинофилов при воспалении дыхательных путей и контролирует везикулярную мобилизацию, связанную с активностью оксидазы NADPH у активированныхмакрофагов 20.23. Примечательно, что накопленные данные свидетельствуют о значительном повышении экспрессии Rab27A во время дифференцировки остеокластов. Шимада-Сугавара и др. сообщили, что экспрессия Rab27A увеличивается во время дифференцировки макрофагов, полученных из костного мозга (BMM), в остеокласты, что указывает на потенциальную роль востеокластогенезе 28. В совокупности эти данные свидетельствуют о том, что Rab27A может влиять на формирование и функцию остеокластов, регулируя везикулярную транспортировку и внутриклеточные сигнальныепути 28,29.

N6-метиладенозин (m6A) является самой распространённой внутренней модификацией РНК в эукариотических мессенджерных РНК и некодирующих РНК и служит важным регулятором метаболизма РНК и экспрессии генов. Будучи первой выявленной модификацией мРНК у млекопитающих, m6A участвовал во множестве биологических процессов, включая стабильность РНК, сплайсинг, транспорт и трансляцию. Ванг и др. показали, что модификации m6A, часто встречающиеся в консервативных последовательностях мотивов, распознаются белками, содержащими домен YTH, и способствуют регуляции стабильности и метаболизмамРНК 30. Кроме того, модификация m6A участвует в различных биологических функциях, включая стабильность генома, регуляцию транскрипции, организацию хроматина, прогрессирование рака и иммунныеответы 31. Недавние исследования также подчеркнули важную роль сигнализации m6A при костных заболеваниях иостеопорозе 32.

Среди белков, считывающих m6A, YTHDC1 выполняет функции ядерного считывателя, регулирующего обработку РНК и ядерный экспорт, тогда как инсулиноподобный фактор роста 2, мРНК-связывающий белок 2 (IGF2BP2), стабилизирует m6A-модифицированные транскрипты в цитоплазме. Чен и др. показали, что YTHDC1 способствует ядерному экспорту m6A-модифицированного circNSUN2, который затем взаимодействует с IGF2BP2 для стабилизации мРНК HMGA2 и стимулирования метастазирования колоректального рака33. Эти результаты свидетельствуют о том, что координированная регуляция YTHDC1 и IGF2BP2 может представлять собой общий механизм, контролирующий судьбу транскриптов, модифицированных m6A.

В данном исследовании рассматривались предсказаемые участки модификации m6A в мРНК Rab27A и изучены их взаимодействия с YTHDC1 и IGF2BP2. Было установлено, что YTHDC1 способствует ядерному экспорту транскриптов Rab27A, модифицированных m6A, тогда как IGF2BP2 взаимодействует с Rab27A в цитоплазме и повышает его стабильность. Благодаря этому регуляторному механизму Rab27A способствовал дифференцированию остеокластов и способствовал прогрессированию остеопороза. В совокупности результаты выявляют ранее не распознанный m6A-зависимый регуляторный путь, включающий YTHDC1, IGF2BP2 и Rab27A в дифференциации остеокластов. Эти результаты дают новые знания о молекулярном патогенезе остеопороза и могут способствовать разработке новых терапевтических стратегий, направленных на регуляцию Rab27A, опосредованную m6A.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Протокол

Все процедуры на животных были одобрены Комитетом по защите и использованию животных аффилированной больницы Юго-Западного медицинского университета (Одобрение No 2024-Ethics-042). Все эксперименты проводились в соответствии с руководящими принципами ARRIVE, Законом Великобритании о животных (научные процедуры) 1986 года и соответствующими рекомендациями, Директивой ЕС 2010/63/EU и Руководством Национальных институтов здоровья по уходу и использованию лабораторных животных (публикация NIH No 8023, пересмотренная 1978 год). Мыши случайным образом распределялись по экспериментальным группам, а последовательность распределения была скрыта от исследователя. Все сборы и анализ данных, включая гистологическую оценку, микрокомпьютерную томографию (микро-КТ) и статистический анализ, проводились исследователями, не обращая внимания на распределение групп. Из анализа не было исключено ни животные, ни образцы. Все реагенты, оборудование, программное обеспечение и другие ресурсы, используемые в этом протоколе, перечислены в Таблице материалов.

1. Построение модели овариэктомии (OVX)

Для создания модели остеопороза использовали двадцать четыре мыши дикого типа C57BL/6 в возрасте 8 недель. После 1-недельного периода акклиматизации мышей случайным образом распределяли либо в группу Sham, либо OVX. Модель OVX была установлена с помощью двусторонней овариэктомии, как описаноранее 34,35. Мыши, оперированные с имитацией, подверглись хирургическому воздействию яичников без удаления.

Для внутрибедренной доставки лентивирусных векторов, экспрессирующих sh-Rab27A или sh-NC, были введены через 7 дней после операции OVX, как ранеесообщалось 36,37. Кратко, концентрированные лентивирусные частицы (1 × 106 трансдукционных единиц/мл) вводились в бедренную кость через надколенник с помощью 22-гейджной иглы под анестезией. Каждая мышь получала 20 мкл лентивирусной суспензии. Затем разрез был зашит, а животные находились под наблюдением на протяжении всего восстановления.

Все эксперименты на животных проводились в определённых условиях, свободных от патогенов. Образцы бедренной кости были собраны через 8 недель после операции. Для гистологического анализа и экстракции РНК или белка использовалось не менее шести мышей в группе.

2. Микро-КТ в организме

Для оценки морфологии трабекулярной кости была проведена микрокомпьютерная томография (микро-КТ). Правая большеберцовая кость каждой мыши была сканирована in vivo перед операцией OVX в возрасте 14 недель. Повторные обследования проводились еженедельно до 22 недель. В микро-КТ-анализ было включено не менее шести мышей в группу.

Мышей анестезиировали внутрибрюшническим раствором пентобарбитала натрия (50 мг/кг массы тела). Адекватная анестезия подтверждалась отсутствием рефлекса сжатия пальцев и постоянным контролем частоты дыхания, которая сохранялась на протяжении всей процедуры визуализации. Все процедуры эвтаназии проводились в соответствии с утверждённым протоколом для животных, институциональными рекомендациями по благополучию животных и национальными правилами эвтаназии лабораторных животных.

В возрасте 24 недель мышей эвтаназировали путем вывиха шейки матки после глубокой анестезии, а обе большеберцовые кости были взяты для ex vivo сканирования с использованием того же протокола визуализации. Параметры сканирования включали размер вокселей 10,4 мкм, напряжение 55 кВ, ток 145 мА, поле зрения 32 мм, 1500/750 образцов на проекцию и время интеграции 100 мс.

Изображения обрабатывались с использованием алгоритма коррекции полимерного усиления пучка третьего порядка, калиброванного против фантома 1200 мг HA/см³ 3 . Фракция костного объёма (BV/TV), толщина трабекуляров (Tb.Th) и трабекулярное число (Tb.N) были количественно измерены в дистальной бедренной метафизе, расположенной в 1,0 мм проксимально от пластины роста.

3. Плазмидная трансфекция

Плазмиды sh-Rab27A и sh-NC были созданы и использованы для производства лентивирусов. Лентивирусные упаковочные плазмиды и шРНК-конструкции были котрансфектированы в HEK293T клетки согласно инструкциям производителя. Титры вируса определялись до внутрибедренного введения, как было описаноранее 36. Были проведены три независимые биологические реплики.

4. Окрашивание гематоксилином и эозином (HE)

Бедренные образцы фиксировались в 4% параформальдегида в течение 24 часов, декальцифицированы в 10% ЭДТА в течение 4 недель, криопротектированы 30% сахарозой/PBS, вложены в парафин и секциированы толщиной 5 мкм. Срезы ткани были окрашены гематоксилином и эозином и исследованы под световым микроскопом. В каждой группе было проанализировано не менее шести мышей.

5. Окрашивание кислотной фосфатазы, устойчивой к тартратам (TRAP)

Окрашивание бедренных срезов с помощью TRAP проводилось согласно инструкции производителя38. Активность TRAP в макрофагах костного мозга (BMM) была оценена с помощью окрашивающего теста TRAP. Зрелые остеокласты были определены как TRAP-положительные многоядерные клетки, содержащие не менее трёх ядер. Были проведены три независимые биологические реплики, каждая с тремя техническими репликами.

6. q-PCR

Общая РНК была выделена с помощью реагента TRIzol согласно инструкциям производителя. Комплементарная ДНК была синтезирована с помощью обратной транскриптазы и подвергнута количественной ПЦР в реальном времени с использованием химии SYBR Green. Были проведены три независимые биологические реплики, каждая с тремя техническими репликами.

Последовательности праймеров были следующими:

Rab27A: F, TTCCTGCTTCTGTTCGACCT; R, GGCAGCACTGGTTTCAAAT

TRAP: F, TGTTGACAGCGGTCCATCTA; R, CCTCCTTCTTAACCCGAAGC

NFATc1: F, GGTGCTCTCTGGCCATAACT; R, GCGGAAAGGTGTGTATCTCAA

c-FOS: F, TACTACCATTCCCCAGCCGA; R, GCTGTCACCGTGGGGATAAA

YTHDC1: F, GAAGTGGAAGCTCTGCATCAG; R, TTGATCTTTTCGGACAGCACG

IGF2BP2: F, GACTACCCCGACCAGAACTG; R, GAGGCGGGGGGTTCCGAATC

β-актин: F, GGGAAATCGTGCGTGACATTAAG; R, TGTGTTGGCGTACAGGTCTTTG

7. Вестерн-блоттинг

Клетки или ткани лизировали с помощью буфера RIPA с дополнением ингибиторов протеаз. Концентрации белка определялись с помощью брадфордского анализа. Равные количества белка (20 мкг) отделялись SDS-PAGE и переносились на мембраны поливинилиденфторида (PVDF) или нитроцеллюлозы. Мембраны блокировались 5% обезжиренным молоком в течение 1 часа при комнатной температуре и инкубировали ночью при 4 °C первичными антителами против TRAP, NFATc1, c-FOS, Rab27A, YTHDC1, IGF2BP2 или β-актина. После промывки мембраны инкубировали соответствующими вторичными антителами в течение 1 часа при комнатной температуре. Белковые диапазоны визуализировались с использованием стандартных процедур обнаружения. Были проведены три независимые биологические реплики.

8. Клеточная культура

Макрофаги, полученные из костного мозга (BMM), были выделены, как описаноранее 39. Клетки костного мозга, взятые с бедренных мышей, были выращены за ночь в α минимально необходимой среде с добавлением сыворотки плода с 10% плодовой сывороткой, 30 нг/мл макрофага, колонистимулирующего фактор (M-CSF) и 1% пенициллина/стрептомицина при 37 °C в увлажнённой атмосфере с содержанием 5% CO₂. Неадгерентные клетки были собраны и культивированы в стромально-свободной клеточной системе с содержанием 30 нг/мл M-CSF. Через 3 дня адгерирующие клетки были собраны в виде BMM и дополнительно культивировались в присутствии активатора рецепторов с концентрацией 30 нг/мл M-CSF и 50 нг/мл рецепторов ядерного фактора-κB лиганда (RANKL) в течение 72 часов для индуцирования дифференцировки остеокластов.

9. Интерференция РНК (РНКи)

Малые интерферирующие РНК (siRNA) синтезировались и трансфектировались с помощью липидного трансфекционного реагента согласно инструкциям производителя. Клетки засеивались с плотностью 2 × 104 клеток на каждую скважину в пластинах с шестью колодцями до трансфекции. Были проведены три независимые биологические реплики.

Целевые последовательности были следующими:

si-Rab27A: GGACUUAAUCAUCTAAGAAUGGAA

si-YTHDC1: GCAAGGAGUGUUAUAUCUUAATT

si-IGF2BP2: CCGUUAACCAACAAGCCAATT

10. Иммунофлуоресценция

Клетки фиксировались с помощью 4% параформальдегида в течение 20 минут и проницаемы с помощью 0,1% тритона X-100 в течение 10 минут. После блокировки 5% бычьей сывороткой альбумина в течение 30 минут клетки инкубировали с первичными антителами ночью при 4 °C.

После стирки на 30 минут при комнатной температуре применялись вторичные антитела, конъюгированные с фторофором. Ядра были контрокрашены DAPI, а изображения получены с помощью конфокальной микроскопии. Были проведены три независимые биологические реплики.

11. Ядерное и цитоплазматическое разделение

Ядерные и цитоплазматические фракции были выделены согласно инструкциям производителя. Клетки лизировали на льду в течение 10 минут и центрифугировали при 500 × г в течение 3 минут при 4 °C. Супернатант, содержащий цитоплазматические компоненты, был собран, а ядра с гранулами промывались и обрабатывались отдельно.

12. Иммунопреципитация белков, связывающих РНК (RIP)

Иммунопреципитационные анализы РНК (RIP) проводились согласно инструкциям производителя. Кратковременно клетки находились на льду в течение 30 минут. После центрифугирования супернатанты инкубировали за ночь с помощью антител и агарозных шариков белка A/G. После промывания иммунопреципитанные белки анализировались методом западного блоттинга, а коиммунопреципитанная РНК — с помощью количественной ПЦР в реальном времени. Были проведены три независимые биологические реплики.

13. Анализ стабильности мРНК Rab27A

Общая РНК была извлечена в указанные моменты времени после IGF2BP2 нокдауна. Впоследствии были проведены обратная транскрипция и количественная ПЦР в реальном времени. Уровни мРНК Rab27A были нормализованы до соответствующей группы si-NC в 0 часа. Были проведены три независимые биологические реплики.

14. Статистический анализ

Все эксперименты проводились независимо с использованием как минимум трёх биологических репликат. Для q-PCR, РНК-интерференции, TRAP-окрашивания, западного блотинга и других клеточных анализов каждая биологическая реплика включала три технических реплики, если не указано иное. Данные представлены как среднее ± стандартного отклонения (SD).

Статистический анализ проводился с использованием программного обеспечения GraphPad Prism версии 9.0 и SPSS. Сравнения между двумя группами проводились с помощью двухстороннего t-теста Student. Сравнения между несколькими группами анализировались с помощью двустороннего анализа дисперсии (ANOVA), а затем последовал пост-хок тест Тьюки с множественным сравнением для корректировки множественных сравнений. Значение P < 0,05 считалось статистически значимым.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Результаты

Снижение Rab27A снизило остеопороз in vivo.

Для изучения роли Rab27A в остеопорозе был проведен knockdown Rab27A на овариэктомизированной (OVX) мышиной модели, установленной с использованием ранее описанныхметодов 34,40. Общий дизайн исследования изложен на рисунке 1. Микрокомпьютерная томография показала, что у мышей OVX минеральная плотность, об...

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Обсуждение

Дифференциация остеокластов играет важную роль в ремоделировании костей, резорбции костей, восстановлении переломов и гомеостазескелета 12˒15˒17˒18˒42˒43. Чрезмерная активность остеокластов является одним из основных факторов остеопороза, что делает выявление регуляторных путей, контролирующих дифференцировку остеокластов, важной целью исследован...

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Раскрытие информации

Авторы не заявляют о конкурирующих финансовых интересах или конфликтах интересов.

Благодарности

Эта работа была финансово поддержана Научно-технологическим стратегическим проектом сотрудничества между Пэнчжоуской народной больницей и Юго-Западным медицинским университетом (грант No 2023PZXNYD01) Лян Тан.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье
ИмяКомпанияКаталожный номерКомментарии
4% ParaformaldehydeThermo Fisher ScientificA5818101Tissue and cell fixation
Alexa Fluor 488 secondary antibodyThermo Fisher ScientificA-11001Fluorescent secondary antibody for immunofluorescence; RRID: AB_2534069
Alexa Fluor 546 secondary antibodyThermo Fisher ScientificA-11035Fluorescent secondary antibody for immunofluorescence; RRID: AB_2534093
Bovine serum albumin (BSA)MerckA2153Blocking reagent
Bradford Protein AssayMerckB6916Protein quantification
C57BL/6JSlac miceShanghai SLAC Laboratory Animal Co., Ltd.—Female, 8 weeks old; RRID: MGI:2159769
c-FOS antibodyAbcamab222699Primary antibody for western blotting; RRID: AB_2891049
Confocal laser scanning microscope (SP8)Leica MicrosystemsSP8Immunofluorescence image acquisition; RRID: SCR_018169
DAPIThermo Fisher ScientificD3571Nuclear counterstain for immunofluorescence; RRID: AB_2307445
EDTAMerckV900081-500GTissue decalcification reagent
EosinSolarbioG1100Histological cytoplasmic stain
Fetal bovine serum (FBS)Thermo Fisher ScientificA5669701Cell culture supplement
GraphPad PrismGraphPad SoftwareVersion 9.0Statistical analysis software; RRID: SCR_002798
HematoxylinCell Signaling Technology#14166Histological nuclear stain
IBM SPSS StatisticsIBMWindows versionStatistical analysis software; RRID: SCR_016479
IGF2BP2 antibodyProteintech11601-1-APPrimary antibody for western blotting and immunofluorescence; RRID: AB_2122672
Inverted light microscope (DMi8)Leica MicrosystemsDMi8Histological image acquisition; RRID: SCR_026672
Lentiviral titer quantification kitTakara Bio631235Lentiviral titer determination
Lipofectamine 3000Thermo Fisher ScientificL3000015Plasmid transfection reagent
Lipofectamine RNAiMAXThermo Fisher Scientific13778150siRNA transfection reagent
M-CSFMedChemExpressHY-P7085Osteoclast differentiation factor
Micro-computed tomography systemScanco MedicalVivaCT80Bone morphometric analysis
M-MLV Reverse TranscriptasePromegaM1701cDNA synthesis
NFATc1 antibodySanta Cruz Biotechnologysc-7294Primary antibody for western blotting; RRID: AB_2152503
PARIS KitThermo Fisher ScientificAM1556Nuclear and cytoplasmic fractionation
Penicillin/StreptomycinThermo Fisher Scientific15140122Antibiotic supplement for cell culture
Power SYBR Green Master MixThermo Fisher Scientific4367659Quantitative real-time PCR
Protease inhibitor cocktailThermo Fisher Scientific78429Prevention of protein degradation
Protein A/G agarose beadsMerckIP05Immunoprecipitation
PVDF membraneThermo Fisher Scientific88520Protein transfer membrane for western blotting
Rab27A antibodyAbcamab55667Primary antibody for western blotting and immunofluorescence; RRID: AB_945112
RANKLMedChemExpressHY-P7425Osteoclast differentiation factor
Real-time PCR systemApplied BiosystemsABI7900HTQuantitative real-time PCR instrument
RIPA bufferThermo Fisher Scientific78501Protein extraction buffer
RNA Immunoprecipitation (RIP) KitMilliporeRIP-12RXNRNA immunoprecipitation assay
SDS-PAGE reagentsThermo Fisher ScientificBT041210BOXProtein electrophoresis
shRNA plasmidsRiboBio—Gene silencing by RNA interference
Small interfering RNAs (siRNAs)GenePharma—Gene silencing by RNA interference
SRAMPOnline resource—Prediction of m6A modification sites; RRID: SCR_024500
StarBase (ENCORI)Online resource—RNA interaction prediction database; RRID: SCR_016303
TRAP antibodyAbcamab2391Primary antibody for western blotting; RRID: AB_303034
TRAP staining kitMerck387ADetection of osteoclast activity
Triton X-100Thermo Fisher Scientific85111Cell permeabilization reagent
TRIzol ReagentThermo Fisher Scientific15596026CNTotal RNA isolation
YTHDC1 antibodyAbcamab122340Primary antibody for western blotting; RRID: AB_11128253
α-MEMFUJIFILM Wako Pure Chemical Corporation139-15651Cell culture medium
β-Actin antibodyMerckA5441Loading control for western blotting; RRID: AB_476744

Ссылки

  1. Kanis JA. Assessment of fracture risk and its application to screening for postmenopausal osteoporosis: synopsis of a WHO report. WHO Study Group. Osteoporos Int. 1994;4(6):368-81.
  2. Leslie WD, Morin SN. Osteoporosis epidemiology 2013: implications for diagnosis, risk assessment, and treatment. Curr Opin Rheumatol. 2014;26(4):440-6.
  3. Chen P, Li Z, Hu Y. Prevalence of osteoporosis in China: a meta-analysis and systematic review. BMC Public Health. 2016;16(1):1039. doi: 10.1186/s12889-016-3712-7.
  4. Sambrook P, Cooper C. Osteoporosis. Lancet. 2006;367(9527):2010-8.
  5. Rachner TD, Khosla S, Hofbauer LC. Osteoporosis: now and the future. Lancet. 2011;377(9773):1276-87.
  6. Bone HG, et al. 10 years of denosumab treatment in postmenopausal women with osteoporosis: results from the phase 3 randomised FREEDOM trial and open-label extension. Lancet Diabetes Endocrinol. 2017;5(7):513-23.
  7. Siris ES, et al. Impact of osteoporosis treatment adherence on fracture rates in North America and Europe. Am J Med. 2009;122(2 Suppl):S3-13.
  8. Cheung EYN, Tan KCB, Cheung CL, Kung AWC. Osteoporosis in East Asia: Current issues in assessment and management. Osteoporos Sarcopenia. 2016;2(3):118-33.
  9. Kohno N, et al. Zoledronic acid significantly reduces skeletal complications compared with placebo in Japanese women with bone metastases from breast cancer: a randomized, placebo-controlled trial. J Clin Oncol. 2005;23(15):3314-21.
  10. Stenmark H. Rab GTPases as coordinators of vesicle traffic. Nat Rev Mol Cell Biol. 2009;10(8):513-25.
  11. Yamaguchi Y, et al. Rab44, a novel large Rab GTPase, negatively regulates osteoclast differentiation by modulating intracellular calcium levels followed by NFATc1 activation. Cell Mol Life Sci. 2018;75(1):33-48.
  12. Xiang Q, et al. Beyond resorption: osteoclasts as drivers of bone formation. Cell Regen. 2024;13(1):22. doi: 10.1186/s13619-024-00205-0.
  13. Teitelbaum SL. Bone resorption by osteoclasts. Science. 2000;289(5484):1504-8.
  14. Suda T, Takahashi N, Martin TJ. Modulation of osteoclast differentiation. Endocr Rev. 1992;13(1):66-80.
  15. Durdan MM, Azaria RD, Weivoda MM. Novel insights into the coupling of osteoclasts and resorption to bone formation. Semin Cell Dev Biol. 2022;123:4-13.
  16. Boyle WJ, Simonet WS, Lacey DL. Osteoclast differentiation and activation. Nature. 2003;423(6937):337-42.
  17. Tosun B, et al. Osteoclasts and Macrophages-Their Role in Bone Marrow Cavity Formation During Mouse Embryonic Development. J Bone Miner Res. 2022;37(9):1761-74.
  18. Xie H, et al. PDGF-BB secreted by preosteoclasts induces angiogenesis during coupling with osteogenesis. Nat Med. 2014;20(11):1270-8.
  19. Hattner R, Epker BN, Frost HM. Suggested sequential mode of control of changes in cell behaviour in adult bone remodelling. Nature. 1965;206(983):489-90.
  20. Kim JD, et al. An essential role for Rab27a GTPase in eosinophil exocytosis. J Leukoc Biol. 2013;94(6):1265-74.
  21. Goishi K, Mizuno K, Nakanishi H, Sasaki T. Involvement of Rab27 in antigen-induced histamine release from rat basophilic leukemia 2H3 cells. Biochem Biophys Res Commun. 2004;324(1):294-301.
  22. Johnson JL, et al. Munc13-4 restricts motility of Rab27a-expressing vesicles to facilitate lipopolysaccharide-induced priming of exocytosis in neutrophils. J Biol Chem. 2011;286(7):5647-56.
  23. Ejlerskov P, et al. NADPH oxidase is internalized by clathrin-coated pits and localizes to a Rab27A/B GTPase-regulated secretory compartment in activated macrophages. J Biol Chem. 2012;287(7):4835-52.
  24. Kariya Y, et al. Rab27a and Rab27b are involved in stimulation-dependent RANKL release from secretory lysosomes in osteoblastic cells. J Bone Miner Res. 2011;26(4):689-703.
  25. Johnson JL, et al. Rab27a and Rab27b regulate neutrophil azurophilic granule exocytosis and NADPH oxidase activity by independent mechanisms. Traffic. 2010;11(4):533-47.
  26. Yokoyama K, et al. Rab27a negatively regulates phagocytosis by prolongation of the actin-coating stage around phagosomes. J Biol Chem. 2011;286(7):5375-82.
  27. Jancic C, et al. Rab27a regulates phagosomal pH and NADPH oxidase recruitment to dendritic cell phagosomes. Nat Cell Biol. 2007;9(4):367-78.
  28. Shimada-Sugawara M, et al. Rab27A regulates transport of cell surface receptors modulating multinucleation and lysosome-related organelles in osteoclasts. Sci Rep. 2015;5:9620. doi: 10.1038/srep09620.
  29. Johnson JL, et al. Vesicular trafficking through cortical actin during exocytosis is regulated by the Rab27a effector JFC1/Slp1 and the RhoA-GTPase-activating protein Gem-interacting protein. Mol Biol Cell. 2012;23(10):1902-16.
  30. Wang X, et al. N6-methyladenosine-dependent regulation of messenger RNA stability. Nature. 2014;505(7481):117-20.
  31. Boulias K, Greer EL. Biological roles of adenine methylation in RNA. Nat Rev Genet. 2023;24(3):143-60.
  32. Wu Y, et al. Mettl3-mediated m(6)A RNA methylation regulates the fate of bone marrow mesenchymal stem cells and osteoporosis. Nat Commun. 2018;9(1):4772. doi: 10.1038/s41467-018-06898-4.
  33. Chen RX, et al. N(6)-methyladenosine modification of circNSUN2 facilitates cytoplasmic export and stabilizes HMGA2 to promote colorectal liver metastasis. Nat Commun. 2019;10(1):4695. doi: 10.1038/s41467-019-12651-2.
  34. Wu X, et al. Caffeic acid 3,4-dihydroxy-phenethyl ester suppresses receptor activator of NF-kappaB ligand-induced osteoclastogenesis and prevents ovariectomy-induced bone loss through inhibition of mitogen-activated protein kinase/activator protein 1 and Ca2+-nuclear factor of activated T-cells cytoplasmic 1 signaling pathways. J Bone Miner Res. 2012;27(6):1298-308.
  35. Luo J, et al. Regulation of bone formation and remodeling by G-protein-coupled receptor 48. Development. 2009;136(16):2747-56.
  36. Jing H, et al. Epigenetic inhibition of Wnt pathway suppresses osteogenic differentiation of BMSCs during osteoporosis. Cell Death Dis. 2018;9(2):176. doi: 10.1038/s41419-017-0231-0.
  37. Yang C, et al. TET2 regulates osteoclastogenesis by modulating autophagy in OVX-induced bone loss. Autophagy. 2022;18(12):2817-29.
  38. Blumer MJ, et al. Role of tartrate-resistant acid phosphatase (TRAP) in long bone development. Mech Dev. 2012;129(5-8):162-76.
  39. Sakai E, et al. Suppression of RANKL-dependent heme oxygenase-1 is required for high mobility group box 1 release and osteoclastogenesis. J Cell Biochem. 2012;113(2):486-98.
  40. Roberts BC, et al. PTH(1-34) treatment and/or mechanical loading have different osteogenic effects on the trabecular and cortical bone in the ovariectomized C57BL/6 mouse. Sci Rep. 2020;10(1):8889. doi: 10.1038/s41598-020-65921-1.
  41. Roundtree IA, et al. YTHDC1 mediates nuclear export of N(6)-methyladenosine methylated mRNAs. Elife. 2017;6. doi: 10.7554/eLife.31311.
  42. Flick LM, et al. Effects of receptor activator of NFkappaB (RANK) signaling blockade on fracture healing. J Orthop Res. 2003;21(4):676-84.
  43. Takeyama K, Chatani M, Takano Y, Kudo A. In-vivo. imaging of the fracture healing in medaka revealed two types of osteoclasts before and after the callus formation by osteoblasts. Dev Biol. 2014;394(2):292-304.
  44. Yamada H, et al. Effects of 16-month treatment with the cathepsin K inhibitor ONO-5334 on bone markers, mineral density, strength and histomorphometry in ovariectomized cynomolgus monkeys. Bone. 2016;86:43-52.
  45. McClung MR, et al. Odanacatib for the treatment of postmenopausal osteoporosis: results of the LOFT multicentre, randomised, double-blind, placebo-controlled trial and LOFT Extension study. Lancet Diabetes Endocrinol. 2019;7(12):899-911.
  46. Tao R, et al. Advances in immune mechanisms and developing immune-targeted therapies for osteoporosis: A systematic review. Pharmacol Res. 2025;218:107835. doi: 10.1016/j.phrs.2025.107835.
  47. Qi Z, Luo J, Xiao Z, Yang D. Functional roles of immune cells in osteoporosis. Front Immunol. 2025;16:1698283. doi: 10.3389/fimmu.2025.1698283.
  48. Krzewski K, Cullinane AR. Evidence for defective Rab GTPase-dependent cargo traffic in immune disorders. Exp Cell Res. 2013;319(15):2360-7.
  49. Adnani L, et al. Immune cell infiltration into brain tumor microenvironment is mediated by Rab27-regulated vascular wall integrity. Sci Adv. 2025;11(21):eadr6940. doi: 10.1126/sciadv.adr6940.
  50. Brauer N, et al. Immunodeficiency with susceptibility to lymphoma with complex genotype affecting energy metabolism (FBP1, ACAD9) and vesicle trafficking (RAB27A). Front Immunol. 2023;14:1151166. doi: 10.3389/fimmu.2023.1151166.
  51. Ramadass M, Catz SD. Molecular mechanisms regulating secretory organelles and endosomes in neutrophils and their implications for inflammation. Immunol Rev. 2016;273(1):249-65.
  52. Menasche G, et al. Mutations in RAB27A cause Griscelli syndrome associated with haemophagocytic syndrome. Nat Genet. 2000;25(2):173-6.
  53. Prashar A, Schnettger L, Bernard EM, Gutierrez MG. Rab GTPases in Immunity and Inflammation. Front Cell Infect Microbiol. 2017;7:435. doi: 10.3389/fcimb.2017.00435.
  54. Stinchcombe JC, et al. Rab27a is required for regulated secretion in cytotoxic T lymphocytes. J Cell Biol. 2001;152(4):825-34.
  55. Catz SD. The role of Rab27a in the regulation of neutrophil function. Cell Microbiol. 2014;16(9):1301-10.

Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.

Перепечатки и разрешения

Больше статей

Макрофаги костного мозгаокрашивание на TRAPвестерн-блоттингYTHDC1IGF2BP2