Картирование знаний о клинических доказательствах и механистические исследования по Тунсе Яофан при язвенном колите: библиометрический анализ

Краткое содержание

Это библиометрическое исследование отражает данные Web of Science Core Collection на английском языке о Тунсе Яофан (TXYF) язвенного колита и различает клинические, механистические и трансляционные направления исследований. Анализ выявляет быстро расширяющуюся область, возглавляемую Китаем, где сетевая фармакология, животные модели, микробиота и воспалительные сигнальные исследования опережают стандартизированные клинические конечные исследования.

Аннотация

Для систематического картирования ландшафта знаний о клинических доказательствах и механистических исследованиях по Тунсе Яофан (TXYF) при язвенном колите (UC) мы провели библиометрический и графический анализ англоязычных статей и обзоров, полученных из Web of Science Core Collection до 31 декабря 2025 года. После скрининга было проанализировано 133 записи на тенденции публикаций, сети сотрудничества, распространение журналов, кластеры совместного цитирования, совместное распространение ключевых слов и клиническую и механистическую тематическую структуру. Операционные критерии использовались для классификации записей как клинических доказательств, механистических исследований или трансляционных/мостовых исследований. После 2020 года поле значительно расширилось, при этом китайские учреждения доминировали, но международное и межкомандное сотрудничество оставалось ограниченным. Механистические исследования показали сильную активность вокруг ядерного фактора каппа B (NF-κB)/NOD-подобного рецепторного белка 3 (NLRP3), митоген-активированной протеинкиназы (MAPK)/AKT (протеинкиназа B), кишечной микробиоты, короткоцепочечного метаболизма жирных кислот, восстановления кишечного барьера, поляризации макрофагов и вычислительной фармакологии. Клинические данные в англоязычном корпусе WoSCC были сравнительно скудными и часто опирались на общие результаты симптомов или активности заболевания, а не на стандартизированные пациенты, отчитываемые пациентами, эндоскопические, гистологические и биомаркерные конечные показатели. Эти результаты указывают на трансляционный разрыв между механистическими открытиями и клинической оценкой, а также поддерживают разработку многоцентровых клинических исследований, основанных на механизмах, с заранее определёнными биологическими показаниями.

Введение

Язвенный колит (UC) — это хроническое воспалительное заболевание толстой кишки, формируемое факторами окружающей среды, генетики, микробов, эпителиального барьера и^{иммунных факторов.} Текущее руководство вышло за рамки облегчения симптомов к стратегиям «лечение до цели», которые делают упор на заживление слизисты, устойчивую ремиссию и профилактику осложнений. Хотя 5-аминосалициловая кислота, кортикостероиды, иммуномодуляторы, биологические препараты, ингибиторы малых молекул и интерлейкино-таргетированные терапии улучшили исходы для многих пациентов, первичная потеря ответа, вторичная потеря ответа, риск инфекции, стоимость и нагрузка на лечение остаются клинически важными ^{проблемами 2,3,4}. Эти неудовлетворённые потребности вызывают устойчивый интерес к многокомпонентным адъюнктивным подходам, которые могут регулировать воспаление, повреждение барьера, нарушения микробиоты и иммунный дисбаланс с помощью скоординированных механизмов.

Тунсе Яофан (TXYF), классическая формула традиционной китайской медицины (ТКМ), ассоциирующая с принципом удерживания древесины и опоры земли, часто обсуждается при диарее и болях в животе, связанных с застоями печени и дефицитом^{селезёнки 5}. В современной клинической практике он стал часто назначенным средством лечения язвенного колита и связанных с ним воспалительных заболеваний кишечника. Недавние научные исследования формулы Тунсяяо прошли путь от клинической эмпирической валидации к глубокому анализу молекулярных^{механизмов 6,7}. Современные фармакологические исследования показывают, что эта формула не действует как единое противовоспалительное средство, а действует через несколько путей⁸. Что касается регуляции воспаления, исследования демонстрируют значительную способность подавлять гиперактивацию соответствующих сигнальных путей и воспалительных микросом. Что касается восстановления слизистого барьера кишечника, формула повышает экспрессию белков в плотных соединениях и снижает проницаемость^{кишечника 9}. Кроме того, восстановление баланса микробиоты кишечника и модуляция нейроэндокринно-иммунной сети оси кишечник-мозг становятся новыми центрами для прояснения терапевтических механизмов формулы Тунсяяо. Последние базовые эксперименты показывают, что формула улучшает иммунную дисрегуляцию, регулируя метаболизм и активность рецепторов триптофана, предоставляя убедительные доказательства в пользу научной эффективности её терапевтической эффективности при язвенном^{колите 10}.

Несмотря на растущую публикационную активность, ландшафт доказательств остаётся фрагментированным. Текущие исследования преимущественно применяют подходы, основанные на одной перспективе: либо сосредотачиваясь на клинических показателях эффективности через рандомизированные контролируемые испытания с небольшой выборкой, либо проводя чисто базовые эксперименты по специфическим вмешательствам по^{сигнальным путям 11,12.} Существует значительный разрыв между клиническими данными и механистическими исследованиями, из-за недостаточной интеграции их взаимосвязей. Кроме того, систематический анализ распределения основных исследовательских команд, интенсивности межинституционального сотрудничества, фундаментальной роли основополагающей литературы и временных эволюционных моделей исследовательских тем. Например, хотя ключевые элементы, такие как сетевая фармакология, кишечная микробиота и сигнальные пути, часто демонстрируют высокую частоту в кластеризации ключевых слов, количественный анализ больших данных по-прежнему не способен объяснить, как эти горячие точки эволюционировали от традиционных методов оценки симптомов и определить их будущие траектории^{развития 13}. В исследованиях, связанных с UC, TXYF изучался через обзоры, сетевую фармакологию, молекулярное докингование, модели заболеваний, анализ микробиоты, транскриптомику, эксперименты по поляризации макрофагов и валидацию трансплантации фекальных^{микробиот} 2,14,15,16,17,18,19,20 . Современные данные свидетельствуют о том, что исследования TXYF сместились от эмпирической симптомо-ориентированной интерпретации к гипотезам, связанным с ядерным фактором каппа B (NF-κB)/рецепторным белком 3 (NLRP3), митоген-активированной протеинкиназой (MAPK)/AKT (протеинкиназа B), сигнальной передачей IL-10RA/NF-kB, защитой эпителиального барьера, микробной ремоделировкой и митофагией. Клинические исследования и протоколы, как правило, делают акцент на облегчении симптомов, активности заболевания, рецидиве, безопасности и дифференцировке синдрома ТКМ, тогда как механистические исследования часто изучают вычислительное прогнозирование мишеней, воспалительные сигналы, валидацию животных или клеток, модуляцию микробиоты и восстановление эпителиального^{барьера} 2,14,15,16,17,18,19 ^,20. Эти потоки пока не полностью интегрированы: механистические результаты редко перспективно внедряются в конечные точки клинических испытаний, а клинические исследования редко включают стандартизированные панели биомаркеров, способные проверять биологические пути, предложенные доклиническими исследованиями.

Целью этого исследования было картографирование англоязычного исследовательского ландшафта WoSCC на TXYF для UC, выявление ключевых участников и структур знаний, а также сравнение зрелости и трансляционной связности клинических доказательств и механистических исследований. Цель заключалась не в том, чтобы утверждать исчерпывающее покрытие всех китайских и международных исследований TXYF, а в том, чтобы охарактеризовать международно индексированный англоязычный корпус и определить, где будущие исследования должны укреплять воспроизводимость, сотрудничество, стандартизацию конечной точки и дизайн исследований от механизма до клиники.

Протокол

Дизайн исследования

В этом исследовании использовался библиометрический и графический дизайн, ориентированный на клинические данные и механистические исследования по TXYF для UC. Рабочий процесс показан на рисунке 1 и включает шесть связанных этапов: поиск базы данных, удаление дубликатов, отбор заголовков/аннотации, полнотекстовая оценка соответствия, извлечение структурированных данных и визуализация/синтез. Итоговая аналитическая выборка состояла из 133 англоязычных статей и обзоров. Таблица 1 суммирует стратегию поиска и критерии допуска, а таблица материалов содержит библиографическую платформу, тип экспортируемых данных, программные инструменты и заметки по воспроизводимости.

Дизайн интегрирует библиографические метаданные, информацию об авторах и учреждениях, страны/регионы, исходные журналы, цитируемые источники, ключевые слова, аннотации и ручно закодированные тематические атрибуты. Такой подход позволяет рукописи описывать тенденции роста публикаций и сотрудничества, а также анализировать, развиваются ли клинические данные и механистические исследования как связанные трансляционные потоки или как параллельные, слабо связанные серии работ.

Источники данных и стратегия поиска

Источником данных была Web of Science Core Collection (WoSCC), выбранная за то, что она предоставляет стандартизированные цитаты, ключевые слова автора, институциональные аффилиации, поля стран/регионов, цитируемые ссылки и форматы экспорта, совместимые с VOSviewer и CiteSpace. Поиск охватывал документы, доступные до 31 декабря 2025 года. И поиск, и экспорт данных выполнялись в одну точку времени для снижения нестабильности, вызванной обновлениями базы данных.

Точный запрос по теме, выполняемый в WoSCC, был следующим:

TS=(("Tongxie Yaofang" ИЛИ "Tong Xie Yao Fang" ИЛИ "Tongxie-Yaofang" ИЛИ "формула Tongxie" ИЛИ "TXYF") и ("язвенный колит" ИЛИ "UC"))

Результаты поиска ограничивались англоязычными статьями и обзорами. Аннотации конференций, редакционные статьи, письма, исправления, рецензии на книги и записи без достаточной библиографической информации были исключены. Эти ограничения применялись для поддержания согласованности метаданных при построении сети; однако дизайн WoSCC только на английском языке признан в обсуждении как важное ограничение для поиска, а не как доказательство отсутствия клинической работы на китайском языке.

Для воспроизводимости все соответствующие записи WoSCC экспортировались как полные записи с указанными ссылками. Ограничительные описания, такие как клинический, механизмный, сетевой фармакология, сигнальный путь, микробиота или исследование, не были добавлены в первоначальный запрос. После извлечения записи вручную отбирались и кодировались по заголовку, аннотации и, при необходимости, полном тексту. Географические поля стандартизировались до визуализации: записи о аффилиации из Тайваня, Гонконга и Макао рассматривались как региональные записи Китая для подсчёта на уровне стран и не интерпретировались как отдельные суверенные страны.

Критерии отбора и отбор литературы

Для обеспечения высокой релевантности между включённой литературой и темой исследования, а также для повышения точности и интерпретируемости последующих результатов анализа графов знаний, в этом исследовании были установлены чёткие критерии включения и исключения до формального анализа и проведено поэтапный скрининг полученной литературы с использованием стандартизированных процедур. Общий процесс отбора включал четыре этапа: дедупликацию документов, первичный отбор заголовков и аннотации, повторный отбор полного текста и окончательное определение включения (см. Рисунок 1 для подробного рабочего процесса). После систематического анализа и прогрессирующего скрининга в библиометрический анализ этого исследования было включено всего 133 статьи.

Что касается критериев включения, это исследование в основном отобрало литературу, соответствующую следующим требованиям: во-первых, тема исследования должна явно включать Тунсе Яофан и язвенный колит, то есть и Тунсе Яофанг, и язвенный колит являются основными темами исследования, а не просто упоминаются в разделах предыстории или обсуждения. Во-вторых, тип литературы должен строго ограничиваться официально опубликованными статьями или обзорами для обеспечения полноты библиографической информации и цитируемых данных. В-третьих, язык литературы должен быть ограничен английским языком для повышения согласованности источников данных и соответствия фундаментальным требованиям международного библиометрического анализа. В-четвёртых, литературные записи должны содержать относительно полную информацию о метаданных, включая название, автора, журнал источников, аннотации, ключевые слова и детали цитирования, что позволяет проводить последующий совместный сетевой анализ, анализ совместного появления ключевых слов и анализ совместного цитирования.

Критерии исключения включают в первую очередь следующие категории: Во-первых, дублирующие литературные записи; Во-вторых, исследования, не связанные напрямую с темами Tongxie Yaofhang (Обезболивающая формула) или язвенного колита, например, те, которые рассматривают исключительно другие формулы традиционной китайской медицины или сосредоточены на общих воспалительных заболеваниях кишечника без явного упоминания Tongxie Yaofang; В-третьих, тезисы конференций, редакционные статьи, письма читателей, исправления, рецензии на книги и другие неформальные академические документы, не содержащие полной исследовательской структуры; В-четвёртых, записи с неполной библиографической информацией или недоступные действительные аннотации и основные сведения цитирования; В-пятых, литература, где Тунсе Яофан не является основным объектом исследования, несмотря на совпадение поисковых терминов, или язвенный колит не является основным объектом заболевания. С помощью этих критериев исследование стремится минимизировать помехи от нецелевой литературы и материалов с низким содержанием информации на результаты исследований.

Процесс отбора литературы проводился с использованием иерархического прогрессивного подхода. Во-первых, все оригинальные записи, импортированные из баз данных, были перенесены в программное обеспечение для управления литературой и электронные таблицы, где проверялись название, автор, год и журнал, а дублирующиеся записи удалялись. Впоследствии был инициирован первоначальный этап отбора заголовков и аннотации, при котором название и аннотация каждой записи независимо рассматривались по заранее установленным критериям включения/исключения, чтобы предварительно исключить документы, явно не соответствующие тематическим требованиям. После этого удержанные документы прошли полнотекстовое повторное рассмотрение, чтобы оценить, действительно ли их темы, содержание и основные темы сосредоточены на «Формуле облегчения боли для лечения язвенного колита», а также проверки соответствия требованиям классификации типов литературы и полноте метаданных.

Операционные определения применялись до кодирования. Клинические исследования определялись как записи, основная цель которых заключалась в оценке эффективности на уровне пациента, безопасности, рецидивов, изменения симптомов, активности заболевания, качества жизни, исходов синдрома ТКМ, воспалительных маркеров, эндоскопических исходов, гистологических исходов или других клинических целей. Механистические исследования определялись как записи, основная цель которых заключалась в объяснении действия TXYF с помощью сетевой фармакологии, молекулярного стыкинга, молекулярной динамики, прогнозирования мишеней, животных моделей, клеточной валидации, анализа микробиоты, мультиомики, воспалительных сигналов, иммунной регуляции, восстановления эпителиального барьера, окислительного стресса, апоптоза, митопагии или связанных путей. Трансляционные или мостовые исследования определялись как записи, связывающие клиническую оценку с механистическими измерениями, синтезом доказательств, картированием биомаркеров или экспериментальной валидацией таким образом, что могло бы повлиять на дизайн клинических испытаний.

Извлечение данных и тематическая классификация

После завершения отбора литературы и окончательного отбора 133 целевых публикаций в исследовании было проведено структурированное извлечение и организация релевантной библиографической информации для создания основы данных для последующего анализа графов знаний. Извлечение данных в основном включало три компонента: базовую литературную информацию, данные цитирования и тематические атрибуты. Основная литературная информация включала название, автора, год публикации, исходный журнал, страну/регион, учреждение, тип документа и аннотацию. Данные о цитировании включали частоту цитирования, ссылки, ключевые слова и ключевые слова автора. Тематическая информация о атрибутах использовалась для стратификации содержания исследований и сравнительного анализа, охватывая темы, методологии, модели и основные тематические направления.

Тематические атрибуты были выделены помимо стандартных библиометрических полей. Для каждой записи авторы кодировали доминирующий тип исследования, основную модель или метод, основной клинический или механистический фокус, а также связывало ли исследование результаты на уровне механизмов с клиническими конечными результатами. Неоднозначные записи классифицировались согласно основной цели, изложенной в заголовке, аннотации и методах, а не по кратким спекулятивным обсуждениям.

Клиническое кодирование конечных точек было уточнено до результатов, сообщаемых пациентами (PROs), и объективных конечных показателей. К ПРО относятся диарея, боль в животе, частота стула, общее улучшение симптомов, качество жизни и показатели синдрома ТКМ. Целевые конечные показатели включали индексы активности заболевания, воспалительные маркеры, эндоскопические или слизисто-заживляющие показатели, гистологию, рецидивы, события безопасности, профили микробиоты, индикаторы эпителиального барьера, цитокины, фенотипы иммунных клеток и биомаркеры путей.

Исследования, сочетающие прогнозирование сетевой фармакологии с валидацией животных, клеток, микробиоты или молекулярной валидации, кодировались как механистические исследования, если основной целью было выяснение механизмов. Исследования, сосредоточенные на наблюдении за эффективностью, но упоминание возможных механизмов только в обсуждении, кодировались как клинические исследования доказательств. Протоколы или записи синтеза доказательств, которые явно пытались интегрировать клиническую оценку эффекта с исследованием механизмов, кодировались как трансляционные/мостовые исследования.

Библиометрический анализ и визуализация

Библиометрический анализ проводился с помощью программного обеспечения для создания таблиц, VOSviewer и CiteSpace; Таблица материалов содержит поля версии/идентификатора и отмечает элементы, требующие подтверждения автором из оригинальных журналов анализа. Программное обеспечение для работы с электронными таблицами использовалось для проверки дублиратов, описательной статистики, ежегодного подсчёта публикаций, классификации типов исследований и подготовки исходных таблиц. VOSviewer использовался для создания сетей совместного взаимодействия между соавторством, институциональными, странными/региональными, журналами и сетями совместного появления ключевых слов. CiteSpace использовался для анализа социтирования, обнаружения кластеров, интерпретации временной шкалы и обнаружения по ключевым словам по взрывам.

Анализ социтирования использовался для выявления модулей базы знаний, неоднократно цитируемых в исследованиях TXYF-UC. Кластеры интерпретировались вручную, читая репрезентативные заголовки, аннотации и контексты цитируемых источников, с вниманием к механизмам воспалительных механизмов UC, доказательствам вмешательства соединений ТКМ, исследованиям микробиоты кишечника и слизистого барьера, а также методам вычислительной фармакологии.

Обработка ключевых слов включала консолидацию синонимов, стандартизацию орфографии, нормализацию падежей, удаление неинформативных терминов и гармонизацию эквивалентных биологических концепций. Затем были использованы анализы совместного появления ключевых слов и временной анализы для выявления основных горячих точек исследований и новых рубежей, включая воспалительную сигнализацию, клинические данные ТКМ, взаимодействия микробиоты и метаболизма, вычислительную фармакологию и регуляцию барьерного иммунитета.

Клиническое и механистическое отображение сочетало тематическую классификацию с кластерами ключевых слов и закодированными доменами конечных точек. Сравнение охватывало шесть областей: контроль симптомов, воспалительный ответ, восстановление кишечного барьера, микробиота кишечника, иммунная регуляция и прогрессирование заболевания.

Результаты

Отбор литературы и общие характеристики публикации

Основываясь на устоявшихся стратегиях поиска и критериях скрининга, в исследование в итоге было включено 133 англоязычных статей, связанных с использованием формулы Тунсяяо для лечения язвенного колита, что стало основой для последующего анализа графов знаний. В целом эта область эволюционировала от ранних спорадических исследований в исследовательское направление с значительным масштабом и не...

Обсуждение

Это исследование предоставляет структурированную карту англоязычной литературы WoSCC по TXYF для UC и показывает, что область быстро расширилась с 2020 года. Картографированный корпус возглавляется Китаем, институционально концентрирован и всё больше ориентирован на механизмы. Клинические данные остаются видимыми, но сравнительно менее стандартизированы, тогда как механистическая работа стала более сплотненной вокруг NF-kB/NLRP3, MAPK/AKT, IL-10RA/NF-kB, ремоделирования микробиоты, защит...

Материалы

Список материалов, использованных в этой статье

Имя	Компания	Каталожный номер	Комментарии
CiteSpace	Chaomei Chen, Drexel University	https://citespace.podia.com/	Ко-цитационный анализ, кластерный анализ, визуализация временных шкал и определение всплесков ключевых слов.
Microsoft Excel	Microsoft Corporation	https://www.microsoft.com/en-in/microsoft-365/Excel	Очистка данных, проверка на дубликаты, дескриптивная статистика, подсчет ежегодного количества публикаций, классификация типов исследований и подготовка таблиц.
VOSviewer	Centre for Science and Technology Studies, Leiden University	https://www.vosviewer.com/	Построение и визуализация сетей совместного упоминания авторов, учреждений, стран, журналов и ключевых слов.
Web of Science Core Collection	Clarivate Analytics	https://clarivate.com/academia-government/scientific-and-academic-research/research-discovery-and-referencing/web-of-science/web-of-science-core-collection/	Основная библиографическая база данных, использованная для поиска англоязычных статей и обзоров по теме Tongxie Yaofang и язвенного колита.