Этическое заявление:
Все участники были полностью проинформированы о целях нашего эксперимента и подписали форму информированного согласия. Данное исследование было одобрено комитетом по этике Первой аффилированной больницы Луньяня Фуцзяньского медицинского университета (номер одобрения LYREC2023-k007-01). Все процедуры проводились в соответствии с соответствующими рекомендациями, правилами и Хельсинкской декларацией.
Набор участников, критерии отбора и сбор образцов
В период с января 2023 г. по май 2025 г. на базе амбулаторного отделения отоларингологии Первого аффилированного госпиталя города Лунъянь при Медицинском университете провинции Фуцзянь были набраны 211 человек с диагнозом АР и 180 здоровых участников (без АР). Критерии диагностики АР были заимствованы из рекомендаций Китайского общества аллергиков по диагностике и лечению аллергического ринита17. Пациенты должны были проявлять не менее двух клинических симптомов АР, включая зуд в носу, чихание, заложенность носа или насморк. Кроме того, при осмотре слизистой оболочки носа должны были быть выявлены бледность и отек, а результат кожной прик-тесты (SPT) или анализ сыворотки на IgE должен быть положительным. SPT проводился специализированным персоналом в кабинете аллергологического тестирования для обеспечения точности и согласованности результатов. Все пациенты с АР прошли оценку по опроснику качества жизни при риноконъюнктивите (RQLQ) и расчет общего индекса выраженности назальных симптомов (TNSS) при помощи медицинского персонала; полученные баллы были зафиксированы для последующего анализа.
В качестве контрольной группы (без AR) были привлечены здоровые добровольцы, проходившие плановые медицинские осмотры в больнице. Соответствующими критериям были участники без личного или семейного анамнеза AR, без астмы или других аллергических заболеваний в анамнезе, без хронического синусита или других воспалительных заболеваний полости носа, а также без инфекций дыхательных путей в течение предыдущего месяца. Кроме того, из исследования были исключены лица с серьезными заболеваниями сердца, печени, легких или почек, а также с любыми злокачественными новообразованиями.
Были собраны образцы периферической венозной крови у двух групп добровольцев. Часть венозной крови с антикоагулянтом была использована для экстракции ДНК и выделения РНК плазмы. Другая часть венозной крови была разделена для получения сыворотки, которая использовалась для определения сывороточных факторов (иммуноглобулина E (IgE), интерлейкина-4 (IL-4), IL-6 и IL-10).
Экстракция ДНК:
ДНК экстрагировали из 200 µL образцов периферической венозной крови с использованием набора для экстракции геномной ДНК из цельной крови (см. Таблицу материалов). Образцы крови собирали в пробирки с литий-гепариновым антикоагулянтом, после чего разделяли на аликвоты и замораживали при -20 °C для хранения. Конкретные процедуры проведения операции должны строго соответствовать инструкциям к набору. В завершение для элюции ДНК использовали 100 µL элюирующего буфера. Чистоту экстрагированного образца ДНК определяли с помощью анализатора нуклеиновых кислот/белков (спектрофотометра) (отношение OD₂₆₀/OD₂₈₀ составляло от 1,8 до 2,0). После анализа образцы ДНК хранили при -20 °C для последующего использования в экспериментах по генотипированию.
Определение генотипа
Для определения распределения генотипов miR-146a rs2910164 использовался набор для генотипирования SNP TaqMan. Информация о наборе внесена в список расходных материалов. Общий объем реакционной смеси ПЦР составлял 10 µL, включая 5 µL Master Mix, 0,5 µL смеси праймеров и зондов для типирования, 10 ng матричной ДНК и воду, не содержащую РНказ. Амплификацию ДНК проводили с использованием прибора для количественной ПЦР в реальном времени с флуоресцентной детекцией Roche LightCycler 480 II. Условия реакции: предварительная денатурация при 95 °C в течение 10 мин; 40 циклов (95 °C в течение 15 секунд, 60 °C в течение 1 мин), считывание флуоресценции FAM/VIC проводилось при 60 °C. После завершения амплификации собранные сигналы двойной флуоресценции FAM/VIC анализировали с помощью программного обеспечения LightCycler 480, затем данные по генотипам подвергали статистической обработке. Одиночный сигнал FAM соответствует одному гомозиготному генотипу, одиночный сигнал VIC — другому гомозиготному генотипу, а наличие обоих сигналов указывает на гетерозиготный генотип. Образцы с аномальными сигналами или противоречивыми результатами при повторном анализе тестировались повторно. В каждом эксперименте для контроля качества использовали как безматричный контроль, так и положительный контроль. Все образцы анализировали в трех технических повторностях.
ОТ-кПЦР
Экстракцию общей микроРНК из 100 µL плазмы проводили с использованием специализированного набора для выделения микроРНК. Информация о наборе внесена в список расходных материалов. Концентрацию РНК определяли с помощью спектрофотометра. Оптическая плотность OD₂₆₀/OD₂₈₀ выделенных качественных образцов микроРНК находилась в диапазоне от 1,8 до 2,0. Для обратной транскрипции с целью синтеза кДНК использовали 200 ng РНК; процедуру реакции проводили согласно стандартной инструкции к набору. Обратную транскрипцию выполняли в общем объеме 20 µL, включая инкубацию при 42 °C в течение 60 мин и инактивацию при 85 °C в течение 5 мин. Реакцию кПЦР готовили по установленному протоколу в общем объеме 20 µL. Состав реакционной смеси был следующим: 10 µL готовой смеси (pre-mix) для кПЦР, 0,4 µL прямого праймера, 0,4 µL обратного праймера, 1 µL матрицы кДНК и 8,2 µL воды, свободной от РНКаз. Использовали специфические праймеры для miR-146a и внутреннего референсного гена U6. Амплификацию проводили на приборе для количественной ПЦР в реальном времени с флуоресцентной детекцией Roche LightCycler 480 II. Режим термоциклирования для кПЦР был следующим: предварительная денатурация при 95 °C в течение 30 с, затем 40 циклов денатурации при 95 °C в течение 5 с, а также отжига и элонгации при 60 °C в течение 30 с. Все образцы анализировали в трех технических повторностях. Экспериментальные данные анализировали с помощью программного обеспечения LightCycler 480 Software. Используя U6 в качестве внутреннего референса для коррекции межостровковой вариабельности, сначала рассчитывали ΔCt (значение Ct для miR-146a минус значение Ct для U6), затем вычисляли ΔΔCt (ΔCt опытной группы минус ΔCt контрольной группы), и, наконец, определяли относительный уровень экспрессии miR-146a по формуле 2⁻ΔΔCt.
ELISA
Уровни IgE, IL-4, IL-6 и IL-10 в сыворотке определяли с помощью наборов для ELISA. Экспериментальные процедуры проводили в соответствии с инструкцией по применению. Конкретные этапы были следующими: сначала концентрированный промывочный раствор разбавляли, а стандарты разводили градиентно для подготовки рабочих растворов для построения стандартной кривой. Затем в лунки добавляли по 50 µL разбавителя, стандартного раствора и исследуемого образца, после чего инкубировали при 37 °C в течение 60 min. После инкубации лунки трижды промывали промывочным буфером. Затем добавляли 50 µL рабочего раствора конъюгата антитела с ферментом и инкубировали планшеты при 37 °C в течение 30 min. По завершении инкубации жидкость удаляли, лунки повторно промывали, после чего добавляли хромогенный раствор и инкубировали в течение 15 min при 37 °C в темноте. После добавления стоп-реагента измеряли оптическую плотность при 450 nm с помощью микропланшетного ридера. Концентрации образцов рассчитывали по стандартной кривой. Каждый образец анализировали трижды. Данные с коэффициентом вариации менее 10% считали достоверными. В ходе эксперимента для контроля качества использовали холостые и контрольные лунки. Диапазон детектирования и чувствительность набора соответствовали требованиям, указанным в руководстве производителя.
Статистическая обработка данных
Экспериментальные данные анализировали с помощью программного обеспечения SPSS и GraphPad Prism 9. Данные представлены в виде среднего значения ± стандартного отклонения (mean ± SD). Для оценки нормальности распределения непрерывных переменных использовали критерий Шапиро-Уилка, а для оценки однородности дисперсии — критерий Ливена. Сравнение непрерывных переменных между двумя группами проводили с помощью t-критерия для независимых выборок. Для сравнения нескольких групп использовали однофакторный дисперсионный анализ (ANOVA) с последующим апостериорным тестом Тьюки, а двухфакторный ANOVA применяли для оценки основных эффектов двух независимых факторов и эффекта их взаимодействия. Выбросы определяли и исключали на основании правила трех стандартных отклонений. Пропущенные данные в данном исследовании не обнаружены. Для анализа диагностической эффективности miR-146a при AR использовали кривую рабочих характеристик приемника (ROC-кривую). Соответствующие параметры ROC и 95% доверительные интервалы рассчитывали с помощью встроенных статистических алгоритмов. Для измерения линейной корреляции между экспрессией miR-146a и уровнями сывороточных факторов использовали корреляционный анализ Пирсона. Для скрининга факторов риска AR проводили одномерный и многомерный логистические регрессионные анализы. Переменные с p < 0.05 при одномерном анализе включали в модель многомерной логистической регрессии. Значение p < 0.05 считали статистически значимым.