DMSO облегчает индуцированный диоксидом кремния легочный фиброз у мышей (Рисунок 2)
Для оценки влияния DMSO на патологические процессы и изменения в тканях легких в модели силикоза были сформированы четыре экспериментальные группы (Рисунок 2A). Изменения массы тела контролировались в течение 1 месяца.
Результаты показали, что у мышей в группе силикоза наблюдалось непрерывное снижение массы тела, тогда как в группе Silica+DMSO первоначальная потеря веса сменилась восстановлением после введения DMSO (Рисунок 2F). После 30 дней воздействия диоксида кремния были отобраны образцы тканей легких, в которых оценивали изменения, связанные с воспалением и фиброзом, с помощью окрашивания гематоксилином и эозином (HE) (Рисунок 2B) и окрашивания трихромом по Массону (Рисунок 2C). Степень легочного фиброза на срезах, окрашенных HE, оценивали по методу Эшкрофта24, что выявило более низкий балл фиброза в группе Silica+DMSO по сравнению с группой Silica (Рисунок 2D). Окрашивание по Массону дополнительно показало, что отложение коллагеновых волокон в группе Silica было обширным и плотным, занимая примерно 40% площади ткани легкого, что выше 10%, наблюдавшихся в контрольной группе (Рисунок 2E), что свидетельствует о том, что воздействие диоксида кремния вызывало тяжелый легочный фиброз. Напротив, отложение коллагена в группе Silica+DMSO сократилось до 20%, что указывает на то, что DMSO может облегчать индуцированный диоксидом кремния легочный фиброз путем ингибирования избыточного накопления коллагена.
Анализ транскриптома выявил дифференциально экспрессируемые гены, связанные с воздействием DMSO у мышей, подвергшихся воздействию диоксида кремния
Для изучения противовоспалительного и антифибротического действия диметилсульфоксида (DMSO) на модели силикоза было проведено транскриптомное секвенирование образцов легочной ткани, полученных от подопытных мышей (Рисунок 3). Дифференциально экспрессируемые гены (DEGs) были выявлены с помощью алгоритма limma; критериями отбора служили значения |log2(fold change)| > 1.5 и скорректированное значение P (ложноположительный результат [FDR]) < 0.05.
Анализ транскриптома показал, что по сравнению с контрольной группой в группе Silica наблюдалось 132 значимо дифференциально экспрессируемых гена (Рисунок 3A), из которых 117 были активированы и 15 — подавлены. Примечательно, что такие гены, как Saa3 и MMP12, были заметно активированы. Эта картина экспрессии была дополнительно подтверждена анализом тепловой карты с иерархической кластеризацией (Рисунок 3C), который продемонстрировал согласованные профили экспрессии генов в отдельных образцах.
При сравнении групп Silica+DMSO и Silica было выявлено в общей сложности 3 054 достоверно дифференциально экспрессируемых гена (Рисунок 3B), из которых 1 399 генов имели повышенную экспрессию, а 1 655 — пониженную. Соответствующая тепловая карта (Рисунок 3D) показала существенные транскриптомные изменения после обработки DMSO, с заметным снижением экспрессии ряда генов, включая Lcn2 и MMP12. В частности, ключевые гены, экспрессия которых была повышена в группе Silica, такие как MMP12, Saa3 и Spp1, продемонстрировали выраженное снижение экспрессии в группе Silica+DMSO. Эти результаты позволяют предположить, что DMSO может смягчать патологию, связанную с силикозом, путем подавления экспрессии провоспалительных и профибротических медиаторов.
Сигнальный путь IL-6/STAT3/MMP12 может быть задействован в защитном действии DMSO при силикатозном легочном фиброзе
Для исследования взаимосвязей между дифференциально экспрессируемыми генами (ДЭГ) на основе транскриптомных данных была построена сеть генных взаимодействий (Рисунок 4A). MMP12, по всей видимости, занимал центральное положение в этой сети. Для дальнейшего изучения возможных ассоциаций на белковом уровне с помощью базы данных STRING была создана предсказанная сеть белок-белковых взаимодействий (PPI) (Рисунок 4B). Анализ в STRING выявил потенциальные функциональные связи между MMP12 и несколькими ключевыми ДЭГ, включая IL-6, STAT3, SPP1 и MMP19. Поскольку STRING интегрирует данные из различных источников, эти ассоциации представляют собой предсказанные функциональные связи.
Для количественного определения уровней экспрессии белков IL-6, STAT3, p-STAT3 и MMP12 был проведен вестерн-блот-анализ (Рисунок 4C–F). Результаты показали, что по сравнению с контрольной группой уровни экспрессии белков IL-6 и p-STAT3 в группе Silica были значительно повышены, а экспрессия белка MMP12 также имела тенденцию к увеличению. После обработки DMSO уровни экспрессии этих трех белков значительно снизились. Примечательно, что экспрессия общего белка STAT3 оставалась относительно неизменной во всех экспериментальных группах.
ДОСТУПНОСТЬ ДАННЫХ:
Все исходные данные секвенирования, полученные в этом исследовании, были депонированы в базе данных Gene Expression Omnibus (GEO) под номером GSE311671. Исходные изображения исследования доступны в дополнительной папке (Дополнительный файл 1).

Рисунок 1: Схема дизайна исследования. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 2: DMSO облегчает легочный фиброз у мышей с силикозом. (A) Схематическая диаграмма плана эксперимента. Стрелки разных цветов представляют различные режимы введения. (B) Окрашивание легочной ткани гематоксилином и эозином. При увеличении 200× масштабный отрезок составляет 50 µm; при увеличении 400× масштабный отрезок составляет 20 µm. (C) Окрашивание легочной ткани по Массону (синий: коллагеновые волокна; красный: мышечные волокна). При увеличении 200× масштабный отрезок составляет 50 µm; при увеличении 400× масштабный отрезок составляет 20 µm. (D) Оценки степени фиброза в разных группах на основании результатов окрашивания HE. n = 8, P ≤ 0.0001. (E) Относительная площадь коллагена при окрашивании по Массону в легочной ткани разных групп. n = 8, P ≤ 0.0001. (F) Изменения массы тела мышей в течение 30 дней. Данные представлены как среднее ± SEM. Сравнение нескольких наборов данных проводилось с помощью однофакторного дисперсионного анализа (ANOVA), а апостериорные тесты выполнялись методом Тьюки. n = 8, P(time) ≤ 0.0001, P(group) ≤ 0.0001. N: контрольная группа; S: группа кремнезема; SD: группа кремнезема + DMSO; D: группа DMSO. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 3: Секвенирование транскриптома выявляет регуляцию генов под воздействием DMSO при облегчении силикоза. (A,B) График "вулкан" дифференциально экспрессируемых генов между группой с воздействием кремнезема (S) и контрольной группой (N), а также между группой с воздействием кремнезема + DMSO (SD) и группой с воздействием кремнезема (S). (C,D) Тепловая карта сравнения группы с воздействием кремнезема (S) с контрольной группой (N), и группы с воздействием кремнезема + DMSO (SD) с группой с воздействием кремнезема (S). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть этот рисунок в большем размере.

Рисунок 4: DMSO снижает экспрессию белков IL-6 и STAT3. (A) Диаграмма сети значительно дифференциально экспрессируемых генов. (B) Диаграмма сети взаимодействий STRING для MMP12 и связанных с ним генов. (C–F) Вестерн-блот-анализ экспрессии белков β-Actin, IL-6, MMP12, STAT3 и p-STAT3. Анализ серых значений белков β-Actin, IL-6 (*P = 0.0257, *P = 0.0195), MMP12 (**P = 0.0013, *P = 0.0318), STAT3 (P = 0.3205, P = 0.2347) и p-STAT3 (*P = 0.0123, **P = 0.0096) методом вестерн-блоттинга. Иммуноблоттинг выполняли в трех повторностях (n = 3). N: контрольная группа; S: группа диоксида кремния (Silica); SD: группа диоксида кремния + DMSO; D: группа DMSO. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Дополнительный файл 1: Исходные данные данного исследования.Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.