Для следующих экспериментов использовалось микрофлюидное устройство сжатия15 для моделирования взаимодействий между опухолью и иммунной системой в физиологически релевантной 3D-микросреде, позволяющее одновременно применять статическое и динамическое сжатие к опухолевым сфероидам (Рисунок 1). Компоненты устройства (Рисунок 1A1) и порядок их сборки (Рисунок 1A2) показаны на Рисунке 1A. Металлическая рама служит основанием устройства, внутри которой располагается слой с камерой для клеток (L1). Блок управления давлением, состоящий из плазменно-сплавленных слоев L2 и L3, размещается над L1, за ним следует коллектор (Рисунок 1A2). Вместе L1 и блок управления давлением образуют функциональное микрофлюидное устройство и зажимаются между металлической рамой и коллектором с помощью винтов. Коллектор содержит входные порты для жидкостных трубок, подающих давление в устройство, а также резервуары для среды, которые облегчают проведение экспериментов по длительной визуализации живых клеток.

Рисунок 1Микрофлюидное устройство для сжатия, предназначенное для изучения взаимодействий между иммунными клетками и опухолевыми сфероидами в условиях механического сжатия. (А1) Фотография компонентов, необходимых для сборки устройства; показаны слева направо: коллектор, блок регулировки давления (L2 + L3), слой с камерой ячейки (L1) и металлическая рама. (А2) 3D-схема компонентов устройства, показанных сверху вниз: коллектор, блок управления давлением (L2 + L3), слой камеры с клетками (L1) и металлическая рама. Слои ПДМС L2 и L3 соединены методом плазменной склейки для формирования блока управления давлением, который расположен над камерой с клетками. Коллектор и металлическая рама фиксируют собранное устройство. (B1Схематический разрез устройства сжатия до и после компрессии. Опухолевые сфероиды, встроенные в внеклеточный матрикс (ВКМ), и NK-клетки помещаются в камеру для клеток. Начальное расстояние между нижней частью L1 и нижней частью L2 до сжатия обозначено как h. При приложении давления к блоку управления давлением L2 отклоняется вниз, в результате чего поршень из ПДМС сжимает опухолевый сфероид. Перемещение L2 вниз после сжатия обозначено как Δh.B2) Совмещенные изображения MCF-7 опухолевого сфероида с NK-клетками, полученные в светлом поле и в канале GFP, до (слева) и после (справа) компрессии. Клетки MCF-7 мечены GFP, NK-клетки не мечены. Репрезентативные NK-клетки обведены синим цветом, желтые контуры обозначают периферию опухолевых сфероидов. Масштабная линейка = 50 µm. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
После сборки микрофлюидное устройство для компрессии может быть использовано для сжатия опухолевых сфероидов, как показано на Рисунке 1B. В данном случае опухолевые сфероиды с NK-клетками, иммобилизованные в коллагене, вводятся в камеру для клеток (L1). При подаче давления в камеру давления (L3) деформируемый мембранный слой (L2) прогибается вниз, в результате чего поршень из полидиметилсилоксана (PDMS) передает сжимающее усилие на сфероид. Камера давления контролируется внешним источником давления. Дополнительные сведения о конструкции, изготовлении и характеристиках микрофлюидного устройства для компрессии были ранее опубликованы в другом исследовании15.
Мы определяем расстояние между дном камеры для клеток (L1) и нижней стороной деформируемой мембраны (L2) как h (Рисунок 1B1, левая панель). До начала сжатия это расстояние составляет 20 µm. При подаче давления жидкости в блок управления давлением деформируемая мембрана прогибается вниз, уменьшая расстояние h на величину Δh (Δh; Рисунок 1B1, правая панель) и тем самым сжимая опухолевый сфероид, встроенный в коллаген. В данной системе деформация сжатия определяется как Δh/h, где h — начальное расстояние между L1 и L2 до сжатия, а Δh — смещение L2 вниз после сжатия. Смещение мембраны было предварительно откалибровано путем визуализации флуоресцентных микросфер, прикрепленных к нижней стороне L2. Подробное описание процедуры калибровки и расчетов деформации сжатия приведено в предыдущем исследовании17. Пример калибровочной кривой представлен на Дополнительном рисунке 2.
Рисунок 1B2 демонстрирует репрезентативные совмещенные изображения в светлом поле и в канале GFP сфероида MCF-7 с внедренными NK-клетками в коллагене с концентрацией 1.5 mg/mL до (левая панель) и после компрессии (правая панель). Границы опухолевого сфероида обведены желтым цветом. После компрессии наблюдалось увеличение проекционной площади сфероида, что указывает на его деформацию в ответ на успешное приложение механической нагрузки. Для всех экспериментов, представленных в данной работе, мы использовали степень сжатия Δh/h = 50%. Отметим, что диаметр сфероида варьируется от 140 µm до 20 µm. Это означает, что фактическая степень сжатия сфероида несколько меньше 50%. В Дополнительном видео 1 и Дополнительном видео 2 показаны репрезентативные Z-стеки в плоскости X-Y, полученные в канале GFP-флуоресценции для сфероида MCF-7, внедренного в коллаген 1.5 mg/mL, соответственно до и после приложения 50% сжимающей нагрузки.
Микрофлюидное устройство для компрессии использовали для исследования влияния NK-клеток, компрессии и их сочетания на гибель опухолевых сфероидов (Рисунок 2). Это стало возможным благодаря конструкции устройства, которое содержит 12 культуральных лунок. Из этих лунок шесть могут подвергаться компрессии, в то время как остальные шесть служат в качестве некомпрессионного контроля. Такая конфигурация позволяет реализовать четыре экспериментальных условия (Рисунок 2A): только сфероиды без компрессии (sp), сфероиды с NK-клетками без компрессии (+NK), сфероиды, подвергнутые компрессии (+comp), и сфероиды, подвергнутые одновременно компрессии и воздействию NK-клеток (+comp+NK).

Рисунок 2Механическое сжатие модулирует опосредованное NK-клетками уничтожение опухолевых сфероидов. (A) Флуоресцентные изображения MCF-7 сфероидов, имплантированных в коллаген (1,5 мг/мл), полученные методом тайм-лапс микроскопии при четырех условиях: контрольная группа только со сфероидами (sp), сфероиды с NK-клетками (+NK), сфероиды с компрессией (+comp) и сфероиды с компрессией и NK-клетками (+comp+NK). Флуоресценция GFP маркирует жизнеспособные опухолевые клетки MCF-7. Желтым контуром обозначена область интереса (ROI), определенная по изображению через 18 часов и примененная ко всем временным точкам для количественного анализа флуоресценции. Для последующего анализа измерялась общая интенсивность флуоресценции GFP внутри ROI. Масштабная линейка = 50 µm. (B) Общая интенсивность флуоресценции GFP одного сфероида в динамике при 4 условиях. Каждая цветная линия представляет общую интенсивность флуоресценции отдельного сфероида, нормированную по его начальной интенсивности при t = 0. Черная линия представляет собой полиномиальную аппроксимацию второго порядка данных об интенсивности флуоресценции, объединенных для 7 сфероидов, культивируемых в контрольных условиях; она использовалась в качестве эталона для расчета потери опухолевых клеток на графике (C).C) Нормализованная потеря ГФП для условий +comp, +NK и +comp+NK была рассчитана путем вычитания интенсивности ГФП в каждой сфероиде при t = 18 ч из контрольной линии только со сфероидами (sp). Таким образом, каждая точка данных представляет собой нормализованную потерю ГФП одного сфероида. Планки погрешностей соответствуют стандартной ошибке среднего (SEM). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Эффекты NK-клеток, компрессии и их комбинации на опухолевые сфероиды можно визуализировать на репрезентативных изображениях сфероидов MCF-7 в 1,5 mg/mL коллагена (Рисунок 2A). Поскольку клетки MCF-7, использованные для создания опухолевых сфероидов, были мечены GFP, жизнеспособность опухоли можно было контролировать по изменению флуоресценции GFP. Изображения в GFP-канале и в светлом поле получали каждые 10 min в течение 18 h с помощью инвертированного эпифлуоресцентного микроскопа. Примечательно, что сфероиды, подвергнутые компрессии, имели большую проекционную площадь, чем нескомпрессированные сфероиды, что подтверждает успешную передачу механической нагрузки от деформируемой мембраны к опухолевому сфероиду. Со временем в условиях +NK и +comp+NK наблюдалось прогрессирующее снижение флуоресценции GFP (Рисунок 2A), что указывает на опосредованное NK-клетками уничтожение опухолевых клеток.
Мы используем потерю флуоресценции GFP в качестве показателя гибели опухолевых клеток. Клетки MCF-7, меченные GFP и использованные в данном исследовании, были получены методом лентивирусной трансдукции. Вкратце, лентивирусный вектор использовался для введения экспрессионной кассеты усиленного зеленого флуоресцентного белка (eGFP) под управлением промотора фактора элонгации-1α (EF1α), а также гена устойчивости к пуромицину под управлением промотора вируса саркомы кур (RSV). После инфицирования лентивирусные экспрессионные кассеты интегрировались в геномную ДНК клеток MCF-7, что привело к стабильной экспрессии GFP. Последующий отбор пуромицином использовался для элиминации нетрансдуцированных клеток. Мечение клеток MCF-7 GFP позволило количественно оценивать жизнеспособность опухолевых клеток путем мониторинга изменений интенсивности флуоресценции GFP с течением времени (Рисунок 2B). Ранее была установлена сильная корреляция между потерей флуоресценции GFP и общепринятыми маркерами гибели клеток, включая маркер живых/мертвых клеток пропидий иодид (PI) и маркер апоптоза аннексин-V18, что подтверждает возможность использования потери флуоресценции GFP в качестве суррогатного показателя гибели опухолевых клеток.
Для количественной оценки влияния четырех экспериментальных условий на жизнеспособность опухоли в каждой временной точке измеряли общую интенсивность флуоресценции GFP каждого опухолевого сфероида, вычитали фоновый сигнал и нормировали полученные значения относительно исходного уровня (Рисунок 2B). Общая флуоресценция сфероида рассчитывалась в заранее определенной области интереса (ROI). Эта область ROI была получена путем ручного обведения границы опухолевого сфероида на изображении, сделанном через 18 ч (желтый контур на панели 18 ч, Рис. 2A), с использованием собственного скрипта MATLAB. Затем для каждой временной точки рассчитывали общую интенсивность флуоресценции внутри этой ROI и корректировали ее, вычитая среднюю интенсивность фоновой флуоресценции, измеренную в отдельной ROI, выбранной в другом месте изображения. Полученные значения флуоресценции с поправкой на фон впоследствии нормировали по начальной интенсивности флуоресценции сфероида.
Каждая цветная кривая на рисунке 2B представляет собой нормализованную интенсивность GFP отдельного сфероида при определенном экспериментальном условии. Кривая получена путем аппроксимации экспериментальных данных полиномом второй степени. Фиолетовые кривые соответствуют сфероидам, подвергнутым только компрессии (+comp, рисунок 2B), красные кривые — сфероидам с NK-клетками (+NK, рисунок 2B), а синие кривые — сфероидам, подвергнутым одновременно и компрессии, и воздействию NK-клеток (+comp+NK, рисунок 2B). Напротив, черная кривая представляет собой аппроксимацию данных семи сфероидов, культивируемых в контрольном условии (только сфероиды) полиномом второй степени (sp, рисунок 2B). Для наглядности на рисунке 2B представлены только данные аппроксимации полиномом, а не экспериментальные точки. Примечательно, что интенсивность флуоресценции GFP в условиях «только сфероиды» (sp) и «сфероиды + компрессия» (+comp) демонстрировала общую тенденцию к росту с течением времени (рисунок 2B), что соответствует продолжению роста опухоли или сохранению жизнеспособности. В отличие от них, в условиях +NK и +comp+NK наблюдалось прогрессирующее снижение интенсивности флуоресценции GFP (рисунок 2B), что указывает на гибель опухолевых клеток.
Кумулятивную потерю опухолевых клеток количественно определяли путем вычитания аппроксимированной нормализованной интенсивности флуоресценции GFP каждого сфероида при заданном условии (+comp, +NK или +comp+NK) из показателей контрольного условия через 18 ч (Рисунок 2C). В результате каждая точка данных представляет собой нормализованную потерю GFP отдельного сфероида относительно контроля (только сфероиды) (Рисунок 2C). Соответственно, условие +comp отражает потерю GFP, вызванную только компрессией (фиолетовый цвет, Рисунок 2C), условие +NK отражает потерю GFP, вызванную только NK-клетками (красный цвет, Рисунок 2C), а условие +comp+NK отражает потерю GFP, возникшую в результате комбинированного воздействия компрессии и NK-клеток (синий цвет, Рисунок 2C). В условии +comp наблюдалась наименьшая степень потери GFP (Рисунок 2C), что свидетельствует о минимальном влиянии одной лишь компрессии на жизнеспособность сфероидов. Напротив, в условиях +NK и +comp+NK наблюдалась значительно большая потеря GFP, чем в условии +comp (Рисунок 2C), что указывает на то, что NK-клетки являются основным фактором гибели опухолевых клеток. Хотя в условии +comp+NK средняя потеря GFP была выше, чем в условии +NK, эта разница не достигла статистической значимости (Рисунок 2C). Эти результаты позволяют предположить, что компрессия не препятствует опосредованному NK-клетками уничтожению опухолевых клеток. В совокупности данные результаты демонстрируют, что микрофлюидное устройство для компрессии может быть успешно использовано для количественной оценки независимого и комбинированного воздействия компрессии и NK-клеток на жизнеспособность опухолевых сфероидов в физиологически релевантной 3D-среде.
Напротив, субоптимальные результаты могут возникнуть, если (1) сфероиды расположены за пределами границы поршня, (2) сфероиды расположены слишком близко к границе поршня и (3) несколько сфероидов находятся на расстоянии менее одного диаметра сфероида друг от друга (Рисунок 3). В этих случаях соответствующие поля следует исключить из анализа.

Рисунок 3Репрезентативный пример последовательности изображений сфероидов, исключенных из анализа. Представлены таймлапс-изображения сфероидов MCF-7 с NK-клетками в коллагене (1,5 мг/мл), полученные в светлом поле (BF), в режиме флуоресценции GFP, а также совмещенные изображения до сжатия (левый столбец) и после сжатия (два правых столбца). Изображения до сжатия были получены за 20 минут до приложения давления и за 10 минут до начала таймлапс-съемки. В дальнейшем изображения собирались каждые 10 минут в течение 18 часов, где 0 ч соответствует первому изображению, полученному сразу после сжатия, а 18 ч — окончанию эксперимента. Синяя стрелка указывает на край поршня из ПДМС (L2). Данное поле обзора было исключено из анализа, так как в области сжатия находились два сфероида, расположенных слишком близко к границе поршня. В результате количественная оценка деформации сфероидов и интенсивности флуоресценции GFP в процессе сжатия не могла быть проведена достоверно. Масштабный отрезок = 50 µm. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
(1) Сфероиды, расположенные за пределами границы поршня, не подвергаются сжатию, так как давление прикладывается только в области поршня. Следовательно, такие сфероиды следует исключить как из группы сжатия, так и из контрольной группы. (2) Сфероиды, расположенные на границе поршня или вблизи неё (Рисунок 3, верхний сфероид), следует исключить, так как такой сфероид подвергается неоднородной механической нагрузке. (3) Сфероиды, находящиеся на расстоянии менее одного диаметра сфероида от соседних сфероидов, следует исключить (Рисунок 3). Близкое расположение сфероидов затрудняет количественную оценку интенсивности флуоресценции GFP, поскольку область интереса (ROI) определяется по конечной временной точке. Со временем границы сфероидов могут стать неразличимыми, что затруднит выделение ROI, которая точно охватывала бы только один сфероид. Эти проблемы можно минимизировать, обеспечив центрирование сфероидов в области сжатия во время загрузки устройства. Тщательный контроль распределения и позиционирования сфероидов, а также настройки устройства необходимы для достижения равномерного сжатия и получения надежных, воспроизводимых результатов эксперимента.
| Компоненты | Концентрация |
| Среда α-MEM | |
| Фетальная бычья сыворотка (FBS) | 10% |
| Пенициллин/стрептомицин | 1% |
Таблица 1: Полная среда для MCF-7.
| Компоненты | Концентрация |
| среда α-MEM | |
| Мио-инозитол | 0,2 мМ |
| 2-меркаптоэтанол | 0,1 мМ |
| Фетальная бычья сыворотка (ФБС) | 12.50% |
| Фолиевая кислота | 0,02 мМ |
| Сыворотка лошади (HS) | 12.50% |
| Пенициллин/стрептомицин | 1% |
Таблица 2: Полная среда для NK-клеток.
Дополнительная фигура 1: Схема системы контроля давления. Воздушный компрессор подает сжатый воздух (до 20 psi) в контроллер давления. Контроллер давления регулирует давление воздуха, подаваемого в резервуар давления, в соответствии с заданными пользователем настройками. Контроллер имеет максимальное рабочее давление 20 mbar, стабильность давления 0,05% от полной шкалы (FS), разрешение по давлению 0,03% FS и время отклика 9 ms, что обеспечивает точный и воспроизводимый контроль давления. Контроллер подключен к компьютеру через универсальную последовательную шину (USB), что позволяет пользователю программировать величину и профиль приложенного давления с помощью соответствующего программного обеспечения. ПО поддерживает несколько форм волны сжатия, включая постоянное, синусоидальное, треугольное и периодическое сжатие. На данной схеме давление установлено на уровне 120 mbar, и сжатый воздух при этом давлении подается в резервуар под давлением через пневматическую трубку. Резервуар под давлением содержит 50 mL деионизированной (DI) воды и служит для преобразования пневматического давления в гидравлическое давление. После создания давления резервуар вытесняет жидкость через трубку подачи жидкости в блок управления давлением микрофлюидного устройства сжатия (подробности об устройстве см. на Рисунке 1), где гидравлическое давление используется для создания сжатия опухолевого сфероида. Обратите внимание, что для предотвращения появления пузырьков воздуха в устройстве из PDMS используется давление жидкости. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительный рисунок 2: Калибровочная кривая для микрофлюидного устройства сжатия, показывающая зависимость между смещением поршня (, µm) и давлением, приложенным к камере управления давлением (KPa). Экспериментальные измерения представлены точками, а сплошная линия соответствует симуляции в COMSOL. Планки погрешностей указывают стандартную ошибку среднего (SEM) по восьми независимым экспериментальным измерениям, однако они слишком малы, чтобы быть видимыми. Этот рисунок воспроизведен из работы Suh et al.15 с разрешения Royal Society of Chemistry. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительное видео 1: X-Y z-стек GFP-маркированного сфероида MCF-7 перед сжатием. Сфероид был иммобилизован в коллагене с концентрацией 1,5 mg/mL внутри микрофлюидного устройства для сжатия; визуализация проводилась в канале флуоресценции GFP с шагом по оси z 1 µm. Затем для повышения контрастности был использован ImageJ. Масштабная линейка = 50 µm. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.
Дополнительное видео 2: Затем к сфероиду MCF-7, меченному GFP и погруженному в коллаген с концентрацией 1.5 mg/mL, была приложена компрессионная деформация 50% (Δh/h = 50%). После сжатия в канале флуоресценции GFP был получен z-стек в плоскости X–Y с шагом 1 µm, который затем был обработан в ImageJ для повышения контрастности. Масштабная линейка = 50 µm. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы скачать этот файл.