В качестве примера для иллюстрации выбора подходящего мутантного аллеля представлена страница отчета о гене spook (spo) из базы данных FlyBase. spo является одним из «хэллоуинских» генов, кодирующих ферменты, участвующие в биосинтезе стероидных гормонов21,22, и было показано, что он способствует слиянию миобластов23. В разделе «Alleles» (Аллели) на странице отчета FlyBase для гена spo перечислены 12 мутантных аллелей spo, описанных в литературе, четыре из которых были переданы в BDSC (Рисунок 2A) и доступны для заказа. Если желаемый аллель отсутствует в BDSC, его можно запросить напрямую у исследовательской группы, которая впервые описала данную мутантную линию.
Среди четырех мутантных аллелей, доступных из BDSC, spo1 несет миссенс-мутацию (G481E), в то время как spoMI06810 содержит инсерцию MiMIC в кодирующей последовательности, что приводит к сдвигу рамки считывания на аминокислоте Y341 (Рисунок 2B, C). Поскольку белок Spo состоит из 543 аминокислот, предполагается, что spoMI06810 (Y341fs) приводит к синтезу усеченного белка, лишенного примерно 40% своей общей длины, и, следовательно, вероятно, представляет собой аллель с выраженной потерей функции. Таким образом, для фенотипического анализа слияния миобластов предпочтительнее использовать spoMI06810, а не spo1 .
Слияние миобластов начинается на 12-й стадии эмбрионального развития (7,3−9,3 ч после откладки яиц [AEL]) и в значительной степени завершается к концу 15-й стадии (11,3−13,3 ч AEL)24. Поэтому фенотипы слияния обычно оценивают на поздней 15-й стадии развития эмбрионов, когда сформирован паттерн соматических мышц и завершилась большая часть процессов слияния.
Эмбрионы 15-й стадии можно идентифицировать по двум выраженным морфологическим признакам: завершению дорсального закрытия и приобретению характерной сердцевидной формы средней кишки (Рисунок 3A–C)19. Эмбрионы 14-й стадии отличаются продолжающейся инволюцией головы (Рисунок 3A), в то время как у эмбрионов 15-й стадии наблюдается характерная сердцевидная форма средней кишки (Рисунок 3B). Эмбрионы 16-й стадии можно определить по сужению средней кишки и формированию четырех камер (желудочные слепые отростки; Рисунок 3C)19. Кроме того, экспрессия белка MHC не обнаруживается на более ранних стадиях, включая 14-ю, но становится интенсивной на 15-й и последующих стадиях (Рисунок 3A–C).
На поздней 15-й стадии эмбрионального развития мускулатура стенки тела у эмбрионов дикого типа (w1118) полностью сформирована, и большинство брюшных полусегментов демонстрируют идентичный стереотипный рисунок мышц при виде сбоку (Рисунок 3B). Этот стереотипный рисунок мышц можно визуализировать с помощью антител к MHC, полученных от кролика или крысы (Рисунок 3B,D). Напротив, при визуализации эмбрионов в дорсальной или вентральной проекции видно меньше мышечных волокон (Рисунок 3E,F). Таким образом, визуализация эмбрионов в латеральной проекции позволяет увидеть всю мускулатуру стенки тела и облегчает оценку дефектов слияния миобластов.
Для изучения дефектов слияния миобластов проводится визуализация мускулатуры брюшной стенки гомозиготных мутантных эмбрионов в латеральной проекции. Гомозиготные мутанты идентифицируются по отсутствию флуоресцентного маркера балансера, такого как GFP или YFP. Например, гомозиготные эмбрионы-мутанты spo, полученные от родителей spoMI06810/TM3, twi>UAS-GFP, являются GFP-отрицательными, в то время как эмбрионы-сиблинги, несущие балансер, экспрессируют GFP в мезодерме (Рисунок 4B,C). По сравнению с эмбрионами дикого типа и GFP-положительными сиблингами, эмбрионы-мутанты spo демонстрируют дефект слияния миобластов, характеризующийся наличием многочисленных неслившихся миобластов, способных к слиянию (FCMs; Рисунок 4A–C).
Примечательно, что в более глубоких оптических срезах (Z3 и Z4) наблюдается больше несросшихся FCM, чем в поверхностном срезе (Z1) эмбрионов мутантов spo (Рисунок 4B). Такое распределение отражает пространственную организацию клеток-основателей и FCM в процессе слияния эмбриональных миобластов. Клетки-основатели и растущие миотрубки расположены преимущественно в поверхностном слое мезодермы, тогда как FCM находятся в более глубоких слоях до тех пор, пока не мигрируют к растущим миотрубкам и не сольются с ними25. Следовательно, несросшиеся миобласты более многочисленны в глубоких конфокальных срезах, особенно в эмбрионах с частичными дефектами слияния. Таким образом, получение z-стеков, охватывающих всю глубину мускулатуры брюшной стенки, необходимо во избежание недооценки выраженности фенотипа слияния.
Хотя визуализация общей мускулатуры стенки тела в латеральной проекции позволяет провести фенотипическую оценку дефектов слияния миобластов, количественный анализ может быть выполнен путем визуализации мышцы DA1 в дорсальной проекции. В эмбрионах дикого типа мышца DA1 полностью сформирована и содержит 13.03 ± 0.60 Eve-положительных ядер (Рисунок 5A,C). В эмбрионах мутантов spo число Eve-положительных ядер в мышце DA1 снижено до 8.16 ± 0.54 (Рисунок 5B,C), что указывает на дефект слияния, при котором меньшее количество FCM сливается с клеткой-основателем DA1. Для обеспечения согласованности и воспроизводимости количественных данных Eve-положительные ядра в мышцах DA1 одних и тех же брюшных полусегментов (A2−A5) подсчитывают и усредняют для каждого эмбриона, при этом среднее значение по каждому эмбриону используется как одна точка данных для статистического анализа (Рисунок 5C).

Рисунок 1: Алгоритм генетического, фенотипического и количественного анализа слияния миобластов в эмбрионах Drosophila. Алгоритм включает подбор соответствующих мутантных линий, сбор и фиксацию эмбрионов, иммуноокрашивание целого препарата и заключание в камеру, а также стадирование и визуализацию эмбрионов. Нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 2: Подбор мутантных аллелей с помощью FlyBase. (A) Скриншот страницы отчета о гене spo в базе данных FlyBase. Мутантные аллели перечислены в разделе «Alleles». Столбец Stocks (выделен рамкой) указывает количество доступных линий, в то время как столбец Refs (выделен рамкой) указывает количество связанных ссылок. (B,C) Молекулярные повреждения двух репрезентативных мутантных аллелей spo: spo1 (B) и spoMI06810 (C). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 3: Мышечная система эмбриона Drosophila. (A–C) Фазово-контрастные изображения, конфокальные изображения z-проекций с окрашиванием на MHC и совмещенные изображения эмбрионов дикого типа (WT) на стадиях 14, 15, 16. Инволюция головы отчетливо видна (наконечники стрелок) у эмбриона на стадии 14 (A). Характерная сердцевидная форма средней кишки (пунктирная линия) наблюдается у эмбриона на стадии 15 (B), тогда как у эмбриона на стадии 16 (C) средняя кишка разделена на четыре отчетливые камеры (пунктирные линии). Экспрессия белка MHC не обнаруживается на стадии 14 (A), но становится выраженной на стадиях 15 (B) и 16 (C). Эмбрионы показаны в латеральной проекции: передний конец слева, задний справа, дорсальная сторона сверху, вентральная снизу. Указаны грудные (T1–T3) и брюшные (A1–A8) полусегменты. (D) Конфокальное изображение мышечной системы эмбриона WT на стадии 15 в латеральной проекции, визуализированное с помощью антител к MHC из крысы. Для изображений на других панелях использовались антитела к MHC из кролика. (E,F) Конфокальные изображения z-проекций мышечной системы эмбрионов WT на стадии 15 в дорсальной (E) и вентральной (F) проекциях. В дорсальной и вентральной ориентациях видно меньше мышечных волокон, чем в латеральной. Масштабная линейка = 50 µm. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 4: Сравнение мускулатуры эмбрионов дикого типа и мутантов spo. (A) Репрезентативные изображения Z-стека, полученные с помощью конфокальной микроскопии, демонстрируют мускулатуру брюшной стенки в латеральной проекции эмбриона WT на поздней 15-й стадии. Слияние миобластов завершено, неслившиеся миобласты не наблюдаются. MHC показан зеленым цветом. (B) Репрезентативные изображения Z-стека, полученные с помощью конфокальной микроскопии, демонстрируют мускулатуру брюшной стенки в латеральной проекции GFP-отрицательного эмбриона-мутанта spo, полученного от родителей spoMI06810/TM3, twi>UAS-GFP. Отсутствие флуоресценции GFP (красный) указывает на то, что эмбрион гомозиготен по spoMI06810. Наконечники стрелок указывают на типичные неслившиеся миобласты. В более глубоких оптических срезах (Z3 и Z4) наблюдается больше неслившихся миобластов, чем вблизи поверхности эмбриона (Z1). MHC показан зеленым цветом. (C) Конфокальные изображения в латеральной проекции GFP-положительного сиблинга-эмбриона, полученного от тех же родителей spoMI06810/TM3, twi>UAS-GFP. Мезодермальная экспрессия GFP (красный), индуцированная трансгеном twi>UAS-GFP на балансере TM3, позволяет отличить GFP-положительных сиблингов-эмбрионов от GFP-отрицательных гомозиготных эмбрионов-мутантов spo. MHC показан зеленым цветом. Масштабная линейка = 20 µm. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.

Рисунок 5Репрезентативные изображения z-стека конфокальной микроскопии и количественный анализ мышц DA1. (A,B) Конфокальные Z-стек изображения дорсального вида диких типов (WT) на поздней стадии 15 (A) и спо мутант (B) эмбрионы, помеченные антителами к MHC (зеленый цвет) и к Eve (красный цвет). Конфокальные z-стеки были получены по всей глубине Eve-положительной мышцы DA1 для захвата всех ядер внутри мышцы. Eve-положительные ядра выглядят как неокрашенные области внутри сигнала MHC. Репрезентативная мышца DA1 обведена пунктирной линией, а Eve-положительные ядра внутри мышцы DA1 пронумерованы. (CКоличественное определение ядер, экспрессирующих Eve, в мышцах DA1 у особей дикого типа (WT) и спо эмбрионы-мутанты. Для каждого генотипа было количественно определено восемь эмбрионов. Каждая точка данных представляет собой среднее количество ядер в мышцах DA1 полусегментов A2–A5 одного эмбриона. Данные представлены в виде среднего значения ± SD (красные столбцы). Статистическая значимость определялась с использованием двухстороннего t-критерия Стьюдента t-тест; p < 0,0001. Масштабная линейка = 20 µm. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
| номер штамма BDSC | Генотип | Цель |
| 6873 | N1/FM7c, twi>UAS-GFP | Экспрессия GFP в мезодерме позволяет идентифицировать гомозиготные мутантные эмбрионы, которые являются GFP-отрицательными. |
| 6662 | wgGla-1/CyO, twi>UAS-GFP |
| 6663 | Д-рМио/TM3, twi>UAS-GFP |
| 23229 | баз4/FM7c, Dfd-YFP | Специфическая экспрессия YFP в области головы позволяет идентифицировать YFP-отрицательные гомозиготные мутантные эмбрионы. |
| 23230 | СНА (синаптическая активность)Sco/ CyO, Dfd-YFP |
| 23232 | Д-р1/TM6B, Dfd-YFP |
Таблица 1: Линии Drosophila, несущие ген флуоресцентного маркера на балансерных хромосомах.