Name: Холерный вибрион: Модель Организм по изучению бактериальных Патогенез - Интервью (Видео) | JoVE Journal
Uploaded: 2007-05-28T00:00:00.000+00:00
Duration: 6 min 44 s
Description: Изучите механизмы выживания Vibrio cholerae в водной среде с помощью геномных исследований и анализа биоплёнок. Этот метод помогает понять динамику передачи холеры и разработать стратегии общественного здравоохранения.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Авторы не имеют конфликтов интересов, подлежащих раскрытию.

Холерный вибрион: Модель Организм по изучению бактериальных Патогенез - Интервью

Vibrio cholerae: Model Organism to Study Bacterial Pathogenesis - Interview

Я — Эс. В MindUP мы изучаем биологию патогенов человека во внешней среде. Многим патогенам человека после выхода из организма хозяина необходимо выжить в окружающей среде, прежде чем они заразят следующего хозяина. Таким образом, наша цель — лучше понять процессы, которые контролируют выживание патогенов человека во внешней среде.Наша цель — лучше понять динамику передачи инфекционных агентов. Поэтому в качестве модельного организма мы используем Vibrio cholerae, возбудителя диарейного заболевания — холеры. Vibrio cholerae является факультативным патогеном человека и имеет водный жизненный цикл.Таким образом, это дает нам отличную возможность изучить выживаемость патогена человека в естественной среде. Существует множество инструментов для изучения этого организма. Его геном полностью секвенирован, и имеются микрочипы, представляющие каждый ген в геноме.Кроме того, существует множество инструментов, позволяющих манипулировать геномом этого организма. Моя исследовательская программа использует эти инструменты и интегрирует их для изучения водного жизненного цикла холеры. Таким образом, в наших экспериментах мы стремимся имитировать водную среду, в которой живет этот организм.Далее мы хотели бы выяснить, как этот организм воспринимает колебания параметров окружающей среды, такие как содержание питательных веществ, температура, соленость или другие биологические стрессоры, например, фаги и TZO? В водной среде V. cholerae встречается либо в свободноплавающей форме, либо в форме, прикрепленной к поверхности. Формы, прикрепленные к поверхности, известны как биопленки, которые состоят из микроорганизмов и вырабатываемых ими внеклеточных полимерных веществ, таких как экзополисахариды, белки, а иногда и ДНК.Эта матрица действует как клей, удерживающий организм вместе. При росте в режиме биопленки такие организмы фактически становятся устойчивыми к колебаниям параметров окружающей среды и могут быть лучше защищены, например, от воздействия фагов и протеасом. Именно эти факторы контролируют численность микроорганизмов в окружающей среде.Некоторые из последних технологических достижений, которые помогли нам в наших исследованиях, — это завершение секвенирования генома организма и развитие технологии микрочипов. Используя эти технологии, мы можем на уровне всего генома определить, как данный организм реагирует на значительные колебания условий окружающей среды, такие как дефицит питательных веществ или изменение температуры. Кроме того, одной из наших основных целей является интеграция данных исследований экспрессии всего генома в сетевой анализ.Таким образом, мы стремимся выявить генетическую регуляторную сеть, которая контролирует ответ на колебания параметров окружающей среды. Мы хотим иметь возможность моделировать поведение организма в окружающей среде. Кроме того, нам до сих пор неизвестно, с кем именно взаимодействует Vibrio cholerae в данной среде.Мы мало знаем об экологии этого организма, а также о том, насколько гены и процессы, которые мы определили как важные для выживания этого организма в лабораторных условиях, значимы в реальном мире. Нам также неизвестно, экспрессируются ли выявленные нами гены, когда Vibrio cholera находится в естественной среде. Кроме того, мы хотели бы иметь возможность идентифицировать и культивировать организмы, с которыми взаимодействует Vibrio cholera, поскольку в окружающей среде Vibrio cholera является частью сложного микробного сообщества.Поэтому я считаю, что понимание биологии Vibrio cholerae в естественной среде будет сложной, но крайне важной задачей для нас. В ближайшие пять лет я надеюсь, что мы сможем лучше охарактеризовать компоненты экзополисахаридов биопленок. Например, в случае с Vibrio cholerae мы до сих пор не знаем структуру экзополисахарида, который удерживает клетки вместе.Мы также не знаем всех компонентов показателей биопленки. В конечном итоге, я считаю, что было бы полезно иметь возможность количественно оценить компоненты показателей биопленок этих организмов в естественных условиях. Я полагаю, что еще одной серьезной проблемой является изучение OC в естественной среде.И я надеюсь, что мы сможем воспользоваться преимуществами сравнительных геномных исследований и объединить профилирование экспрессии всего генома со сравнительной геномикой, чтобы лучше понять эволюцию холеры IBR как патогена.

vibrio-cholerae-model-organism-to-study-bacterial-pathogenesis

Research

JoVE Journal

Biology

Биология

Быстрый способ изменить...

TransFLP - метод генетической модификации<em&gt; Холерный вибрион</em&gt; На основе природных преобразований и FLP-рекомбинации

Источник: Brumfield, K. D. и др., Лабораторные методы, используемые для поддержания и дифференцирования биотипов клинических и экологических изолятов Vibrio cholerae . J. Vis. Exp .(2017).В этом видео демонстрируется тест Вогеса-Проскауэра (VP) для различия между тремя биотипами холеры Vibrio: классический, дикий тип Эль Тор и вариант Эль Тор. Каждая культура инокуляется в глюкозосодержащую среду, инкубируется и обрабатывается α-нафтолом и гидроксидом калия для обнаружения наличия ацетоина.

Анализ Вогеса-Проскауэра для дифференцировки биотипов холеры Vibrio

Источник: Наг, Д. и др. Количественная оценка колонизации и диареи Vibrio cholerae в модели взрослой данио-рерио. J. Vis. Exp . (2018)В этом видео демонстрируется протокол количественной оценки кишечной бактериальной нагрузки у взрослых данио-рерио, инфицированных антибиотикорезистентным штаммом Vibrio cholerae. После эвтаназии и вскрытия кишечник изолируется, гомогенизируется стеклянными бусинами и обрабатывается для высвобождения бактерий. Полученный гомогенат наносится на селективную среду,...

Количественное определение кишечной бактериальной нагрузки у данио-рерио, инфицированных холерой Vibrio

Источник: Наг, Д., et.al. Количественная оценка колонизации и диареи Vibrio cholerae в модели взрослой данио-рерио. J. Vis. Exp . (2018)В этом видео демонстрируется прививка взрослой данио-рерио патогенным штаммом Vibrio cholerae для изучения колонизации кишечника и исходов заболеваний. Показано, как бактериальные токсины нарушают целостность кишечника, что приводит к протеканию жидкости, выделению слизи и водянистой диарее до того, как рыбы готовятся к дальнейшему анализу.

Колонизация кишечника и индукция диареи с помощью Vibrio cholerae у взрослых данио-рерио.

Мы решили определить допустимые концентрации трех жирных кислот (олеиновая, линолевая и линоленовая кислоты) и холерного токсина, который не значительно и отрицательно повлиять на выживаемость клеток путем растворения жирных кислот и токсинов и их использование в анализе выживаемости клеток.

Определение допустимого жирные кислоты и концентрации токсина холеры с использованием человеческих клеток эпителия кишечника и BALB / C макрофаги мыши

Выполнение анализа клеточной культуры для исследования бактериальной адгезии и инвазии в аэробных условиях, как правило, не...

Кишечные бактериальной инвазии эпителиальных клеток кишечника<em&gt; In Vitro</em&gt; Резко усиливается с помощью вертикальной модели диффузионной камере

В этой рукописи описываются правильные методы обслуживания Vibrio cholerae в дополнение к серии биохимических анализов, которые в совокупности используются для быстрой и надежной дифференциации между клиническим и экологическим V. Биотипы холеры в лабораторных условиях.

Лабораторные методы, используемые для поддержания и дифференциации биотипов<em&gt; Vibrio cholerae</em&gt; Клинические и экологические изоляты

Здесь мы представляем нематоды Caenorhabditis elegans как универсальный хост модель для изучения взаимодействия микроорганизмов.

Нематоды Caenorhabditis Elegans - универсальный в Vivo модель для изучения хост микробных взаимодействий

Данио рерио являются естественным Vibrio cholerae принимающей и могут быть использованы для пилки и изучить весь инфекционных цикл от колонизации до передачи. Здесь мы продемонстрируем оценить V. cholerae уровни колонизации и количественно понос в данио рерио.

Холерный вибрион колонизации и диарея в модели для взрослых рыбок данио

Бактерии кодируют различные механизмы для участия в межбактериальной конкуренции. Здесь мы представляем культурный протокол для характеристики конкурентных взаимодействий между бактериальными изолятами и того, как они влияют на пространственную структуру смешанной популяции.

Coincubation Асссе для количественной оценки конкурентных взаимодействий между Vibrio fischeri Изоляты

Изучите механизмы выживания Vibrio cholerae в водной среде с помощью геномных исследований и анализа биоплёнок. Этот метод помогает понять динамику передачи холеры и разработать стратегии общественного здравоохранения.

Холерный вибрион: Модель Организм по изучению бактериальных Патогенез - Интервью

Больше видео