Metabolic Pathway Confirmation and Discovery Through <sup>13</sup>C-labeling of Proteinogenic Amino Acids

Le You; Lawrence Page; Xueyang Feng; Bert Berla; Himadri B. Pakrasi; Yinjie J. Tang

doi:10.3791/3583

Метаболический Подтверждение пути и Discovery Через 13 C-маркировки протеиногенных Ами...

JoVE Journal
Biology

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Biology

Metabolic Pathway Confirmation and Discovery Through ¹³C-labeling of Proteinogenic Amino Acids

Метаболический Подтверждение пути и Discovery Через 13 C-маркировки протеиногенных Аминокислоты

Full Text

25,074 Views

07:26 min

January 26, 2012

DOI: 10.3791/3583-v

Le You¹, Lawrence Page², Xueyang Feng¹, Bert Berla¹, Himadri B. Pakrasi³, Yinjie J. Tang¹

¹Department of Energy, Environmental and Chemical Engineering,Washington University, ²Department of Biology,Washington University, ³Department of Energy, Environmental and Chemical Engineering and Department of Biology,Washington University

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

¹³ С-изотопом маркировки полезным методом для определения ячейки центрального метаболизма для различных видов микроорганизмов. После клетки были культивировали с конкретными меченого субстрата, GC-MS измерение может выявить функциональные процессы обмена веществ на основе уникальных моделей маркировки в протеиногенных аминокислот.

Целью данного протокола является изучение бактериального метаболизма с помощью анализа метаболизма углерода-13. Для начала, микробы выращиваются в присутствии меченых углеродных субстратов, которые включаются в микробные белки. Затем микробы собираются, а аминокислоты экстрагируются, гидролизуются и дериватизируются.

Образцы наносятся на газовый хроматограф и масс-спектрометр или GCMS. Отслеживая пути перехода атомов между метаболитами в биохимической сети, можно определить функциональные метаболические пути, используемые микробом. Меня зовут Берт Бурла.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Explore More Videos

Молекулярная биология выпуск 59 GC-MS новые пути обмена веществ маркировке фототрофных микроорганизмов