Выявление редких геномных вариантов с помощью секвенирования Объединенные SPLINTER

16.8K просмотров

Цитируется: 10

14:06 мин.

23 июня 2012 г.

10.3791/3943-v

23 июня 2012 г.

16.8K просмотров

Francesco Vallania¹ , Enrique Ramos¹ , Sharon Cresci² , Robi D. Mitra¹ , Todd E. Druley¹^,³

¹Center for Genome Sciences and Systems Biology, Department of Genetics, Washington University School of Medicine, ²Department of Internal Medicine, Washington University School of Medicine, ³Department of Pediatrics, Washington University School of Medicine

Объединенные секвенирования ДНК является быстрым и экономически эффективной стратегией для обнаружения редких вариантов, связанные с комплексными фенотипов в больших группах. Здесь мы опишем вычислительный анализ объединенных следующего поколения, последовательность из 32 связанных с раком генов с помощью пакета SPLINTER программного обеспечения. Этот метод является масштабируемым, и применимы к любой фенотип интерес.