Роман байесовского Изменение точки Алгоритм всему геному анализ различных типов данных ChIPseq

10.8K просмотров

Цитируется: 6

12:39 мин.

10 декабря 2012 г.

10.3791/4273-v

10 декабря 2012 г.

10.8K просмотров

Наши байесовского Точка изменения (BCP) алгоритм основывается на состоянии самой современной прогресс в области моделирования изменения точки через скрытых Марковских моделей и применяет их к иммунопреципитации хроматина секвенирования (ChIPseq) анализ данных. BCP хорошо работает как в широком и точечные типов данных, но превосходит точно идентифицировать надежные, воспроизводимые острова диффузного гистонов обогащения.

Больше видео

Анализ данных ChIP-seq

Chapters in this video

0:05

Название

2:43

Препроцессинг: подготовка входных файлов для анализа методом байесовских точек изменения (BCP) и расчет плотности ридов ChIP для обнаружения обогащенных островков в диффузных данных

4:48

Оценка апостериорного среднего значения плотности ридов для каждого блока с использованием аппроксимации BCMIX

6:24

Постпроцессинг апостериорных средних значений диффузных профилей плотности ридов

7:06

Результаты: сравнение BCP и SICER при анализе данных о модификациях гистонов

11:47

Заключение

Related Videos