VDJ-SEQ: Глубокий анализ последовательности перестроенных тяжелой цепи иммуноглобулина ген Reveal Клональный Evolution Узоры клеточной лимфомой

26.5K просмотров

Цитируется: 19

15:07 мин.

28 декабря 2015 г.

10.3791/53215-v

28 декабря 2015 г.

26.5K просмотров

Yanwen Jiang¹^,² , Kui Nie³ , David Redmond² , Ari M. Melnick¹ , Wayne Tam³ , Olivier Elemento²

¹Department of Medicine, Weill Cornell Medical College, ²Institute for Computational Biomedicine, Weill Cornell Medical College, ³Department of Pathology and Laboratory Medicine, Weill Cornell Medical College

Этот протокол описывает подход к исследованию рекомбинированных областей VDJ тяжелой цепи иммуноглобулина лимфом путем глубокого секвенирования и извлечения перестройки VDJ и статуса соматической гипермутации для определения клональной архитектуры отдельной опухоли. Сравнение клональной архитектуры между парной диагностикой и образцами рецидива выявляет режимы клональной эволюции рецидива лимфомы.