Генома Очистка экстрахромосомального кольцевой ДНК из эукариотических клеток

28.7K просмотров

Цитируется: 59

14:26 мин.

4 апреля 2016 г.

10.3791/54239-v

4 апреля 2016 г.

28.7K просмотров

Henrik D. Møller¹ , Rasmus K. Bojsen² , Chris Tachibana³ , Lance Parsons⁴ , David Botstein⁵ , Birgitte Regenberg¹

¹Department of Biology, University of Copenhagen, ²National Veterinary Institute, Technical University of Denmark, ³Group Health Research Institute, ⁴Lewis-Sigler Institute for Integrative Genomics, Princeton University, ⁵Calico Life Sciences LLC

В этой статье представлен чувствительный метод под названием Circle-Seq для очистки внехромосомной кольцевой ДНК (eccDNA). Метод включает в себя очистку колонок, удаление оставшейся линейной хромосомной ДНК, амплификацию по скользящему кругу и высокопроизводительное секвенирование. Circle-Seq применим для скрининга эукариотической эккДНК в масштабе генома и изучения нестабильности генома и вариации числа копий.