Экспериментальный дизайн для лазерных микродиссекция РНК-Seq: уроки из анализа развития листьев кукурузы

Многие важные для развития гены имеют специфические для клеток или тканей паттерны экспрессии. В этой статье описываются эксперименты LM RNA-seq для идентификации генов, которые дифференциально экспрессируются на границе пластинки листа кукурузы и влагалища и у мутантов lg1-R по сравнению с диким типом. Обсуждаемые здесь экспериментальные соображения применимы и к транскриптомному анализу других феноменов развития.