Horizontal Gel Electrophoresis for Enhanced Detection of Protein-RNA Complexes

Megan E. Dowdle; Susanne Blaser Imboden; Sookhee Park; Sean P. Ryder; Michael D. Sheets

doi:10.3791/56031

Горизонтальный гель-электрофорез для расширенного обнаружения комплексов протеин-РНК

JoVE Journal
Biochemistry

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Biochemistry

Horizontal Gel Electrophoresis for Enhanced Detection of Protein-RNA Complexes

Горизонтальный гель-электрофорез для расширенного обнаружения комплексов протеин-РНК

Full Text

12,557 Views

06:36 min

July 28, 2017

DOI: 10.3791/56031-v

Megan E. Dowdle¹, Susanne Blaser Imboden¹, Sookhee Park¹, Sean P. Ryder², Michael D. Sheets¹

¹Department of Biomolecular Chemistry,University of Wisconsin School of Medicine and Public Health, ²Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology,University of Massachusetts Medical School

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Родной полиакриламидный гель-электрофорез является фундаментальным инструментом для анализа взаимодействия РНК-белок. Традиционно в большинстве экспериментов использовались вертикальные гели. Однако горизонтальные гели обладают рядом преимуществ, таких как возможность мониторинга комплексов во время электрофореза. Мы предоставляем подробный протокол для генерации и использования горизонтального гель-электрофореза.

Суть этого протокола заключается в анализе взаимодействий белков РНК с помощью горизонтального нативного электрофореза. Этот метод может помочь ответить на ключевые вопросы биохимии РНК, такие как определение характеристик специфических взаимодействий белков РНК. Основное преимущество этой методики заключается в том, что она позволяет многократно контролировать сложное образование во время электрофореза.

Для горизонтального гелевого аппарата используют гелевый бокс с лотком для литья 27 на 21 сантиметр и емкостью на две 24 луночные гребни. Эта конфигурация обеспечивает в общей сложности 48 образцов, которые могут быть проанализированы одновременно. Приготовьте два литра рабочего буфера 1x TBE, разбавив 400 миллилитров 5x TBE с 1 600 миллилитрами воды и перемешав.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos

Explore More Videos

Biochemistry Issue 125 Электрофорез на родном геле взаимодействия РНК-белок анализы сдвига подвижности