Надежные ДНК изоляции и высокопроизводительного секвенирования строительство библиотеки для образцов гербария

10.4K просмотров

Цитируется: 13

13:03 мин.

8 марта 2018 г.

10.3791/56837-v

8 марта 2018 г.

10.4K просмотров

Saman Saeidi^*¹ , Michael R. McKain^*¹^,² , Elizabeth A. Kellogg¹

¹Donald Danforth Plant Science Center, ²Department of Biological Sciences, The University of Alabama

^* These authors contributed equally

Эта статья демонстрирует подробный протокол для изоляции ДНК и высокопроизводительного секвенирования библиотека строительство из материалов гербариев, включая спасение исключительно низкого качества ДНК.

Больше видео

Выделение ДНК из гербарных образцов

экстракция ДНК с помощью CTAB

очистка на магнитных частицах SPRI

фермент для фрагментации ДНК

селекция размеров библиотеки

опциональный этап реамптификации

анализ в агарозном геле

амплификация в термоциклере

разделение на магнитном штативе

Chapters in this video

0:04

Название

0:58

Экстракция ДНК

4:39

Шеринг ДНК

5:28

Очистка с помощью магнитных частиц

7:06

Подготовка библиотек

7:40

Лигирование адаптеров

8:46

ПЦР-амплификация

9:12

Отбор по размеру для получения библиотеки нужного размера и контроль качества

11:04

Результаты: выделение и высокопроизводительное секвенирование низкокачественной ДНК, выделенной из различных гербарных образцов

12:33

Заключение