June 9th, 2018
Обычные потери функции исследования генов с помощью маскирования животных часто были дорогостоящим и трудоемким. Электропорация основанный ТРИФОСФАТЫ опосредованной соматических мутагенеза является мощным инструментом, чтобы понять, что ген функционирует в естественных условиях. Здесь мы приводим метод для анализа нокаут Фенотипы пролиферирующих клеток мозжечка.
Общая цель этого подхода к переносу генов in vivo, основанного на электропорации, заключается в оценке роли генов, представляющих интерес, в дифференцировке гранулярных клеток мозжечка с использованием CRISPR-опосредованного анализа потери функции. Этот метод может помочь ответить на ключевые вопросы в нейронауках развития и нейроонкологии, такие как идентификация молекул, важных для нормального развития мозжечка и образования опухолей головного мозга. Процедуру внутриутробной электропорации продемонстрирует доктор Лена Хербст, постдок из лаборатории профессора Петера Лихтера, а затем следующая иммуногистохимия будет выполнена доктором Вэйцзюнь Фэном, постдоком из лаборатории доктора Хайкун Ди.
Основное преимущество этого метода заключается в том, что с помощью технологий CRISPR-cas9 можно попытаться практически нокаутировать гены, представляющие интерес в клетках мозжечка, вместо генерации комбинации нокаутированных животных. Хотя этот метод может дать представление о функциях генов во время нормального развития мозжечка, он также может быть применен к другим системам, таким как развитие других физических областей мозга и моделирование опухолей мозга. Начните с загрузки капилляра из боросиликатного стекла в пуллер для микропипеток и потяните, чтобы получить тонкий наконечник.
Пометьте кончик капилляра черными чернилами для лучшей визуализации во время инъекции, а на стекле нарисуйте шкалу. Работая под стереомикроскопом, используйте линейку и острый игольчатый пинцет, чтобы обрезать кончик до длины около шести миллиметров и создать острый, односторонний скошенный край. Отфильтруйте 1%-ный быстрый раствор зеленого материала через фильтр нулевой точки 22 микрона, чтобы удалить частицы красителя из раствора.
Смешайте однонаправляющие РНК-плазмиды в равных частях с репортерной плазмидой люциферазы до конечной концентрации не менее одного микрограмма на миллилитр для каждой плазмиды. Окрасьте плазмидный раствор быстрым зеленым цветом с конечной концентрацией 0,5%После обезболивания беременной мыши CD-1 изофлураном положите мышь на спину на грелку и введите обезболивающее. Наносите глазную мазь, чтобы предотвратить сухость глаз во время операции.
Зафиксируйте линзу скотчем и простерилизуйте брюшную полость дезинфицирующим средством. Накройте мышь марлей, оставив открытой только операционную область. После того, как вы сделаете разрез кожи длиной около двух сантиметров, найдите белую линию и с помощью ножниц с тупым концом ткани сделайте второй разрез немного меньшего размера через брюшину.
Смочите вскрытую брюшную полость предварительно подогретым стерильным ПБС. Далее с помощью кольцевых щипцов аккуратно извлекают рога матки из брюшной полости. Возьмитесь за стенку матки в промежутке между желточными мешочками двух соседних эмбрионов и слегка потяните.
Избегайте любого давления на эмбрион во время протягивания его через разрез. После извлечения рогов матки аспирируйте примерно от 10 до 15 микролитров цветного раствора плазмиды с подготовленным стеклянным капилляром. Избегайте попадания пузырьков воздуха во время этого процесса.
Аккуратно удерживайте эмбрион кольцевыми щипцами и найдите область шеи. Медленно проникайте в дорсальный задний мозг кончиком стеклянного капилляра и продвигайтесь в четвертый желудочек. Введите около одного микролитра плазмидной смеси.
Подтвердите, что окрашенная ДНК не утекла из мозга, а видна в виде ромбовидной структуры. Здесь наиболее важно заполнить всю область четвертого желудочка раствором плазмиды, доставить ДНК также в дистальную часть зачатка мозжечка. В то же время убедитесь, что во время этого процесса не возникает кровотечения.
Поместите платиновый пинцет, оснащенный электродными пластинами диаметром пять миллиметров, боково над головой эмбриона, причем отрицательный полюс закрывает ухо, а положительный полюс расположен в мозжечковом зачатке над стенкой матки, и подайте электрические квадратные импульсы. Когда все эмбрионы будут подвергнуты электропоре, осторожно поместите рога матки обратно в брюшную полость, и заполните их стерильным PBS. Дайте рогам матки сместиться в естественное положение.
Выключите анестезию и поместите животное животом вниз в новую клетку для восстановления. Перед криосекцией зафиксируйте мозжечок на ночь в пяти миллилитрах 4% PFA в PBS на мозг, при четырех градусах Цельсия. На следующий день перенесите неподвижный мозжечок в десять миллилитров 30% сахарозы в PBS на мозг и инкубируйте в течение ночи при четырех градусах Цельсия.
На следующий день, после того как ткань опустится на дно трубки, удалите мозги из сахарозы и впитайте оставшийся раствор сахарозы куском целлюлозной фильтровальной бумаги. Далее погрузите каждый мозжечок в состав оптимальной температуры резки в одноразовую пластиковую форму, и заморозьте на сухом льду. Разрежьте криогенный блок на секции толщиной 10 микрон с помощью криостата и держите секции при температуре минус 80 градусов Цельсия до использования.
Когда будете готовы приступить к иммуноокрашиванию, сначала высушите предметные стекла при комнатной температуре в течение 30 минут, а затем дважды постирайте по 10 минут каждый раз в PBS. Обведите срезы жидкостной блокирующей ручкой и инкубируйте срезы в блокирующем растворе в течение часа при комнатной температуре. Добавьте первичные антитела против молекул, представляющих интерес в блокирующем растворе, и инкубируйте в течение ночи при четырех градусах Цельсия.
Промойте предметные стекла 0,1% Тритоном, содержащим PBS, три раза по 10 минут каждый. Затем добавьте флуорофорное конъюгированное вторичное антитело, разведенное в блокирующем растворе, содержащем DAPI, и инкубируйте срезы в течение одного часа при комнатной температуре в темноте. Промойте предметные стекла в PBS-T три раза в течение 10 минут каждый раз, затем установите предметные стекла и держите при температуре четыре градуса Цельсия до получения изображения.
Клетки hek293T, стабильно экспрессирующие Streptococcus pyogenes cas9, трансфицировали плазмидами, экспрессирующими sgRNA и нацеленными на них. Экспрессию GFP в живых клетках контролировали с помощью флуоресцентного клеточного тепловизора через 48 часов после трансфекции. На этом изображении показана пораженная последовательность sgРНК на основе экспрессии GFP.
На этом изображении показано отсутствие экспрессии GFP в результате неэффективной последовательности sgРНК. На этих изображениях показано иммуноокрашивание GFP, Ki67 и p27 в мозжечке у мыши p7-rosa26-LSL-cas9 с флоксированной стоп-кассетой и последовательностями bicistronic cas9 и EGFP, которые были подвергнуты электропорации в E13.5 с плазмидой Cre, экспрессирующей контрольную sgRNA. Секция имеет противодействие DAPI.
Обратите внимание на GFP-экспрессирующие клетки во внешнем слое гранулярных клеток, отмеченные Ki67. После освоения эта операция может быть выполнена менее чем за 30 минут на одной мыши. При проведении этой процедуры важно помнить о том, что с эмбрионом нужно обращаться очень осторожно, всегда использовать капилляры с острыми концами и располагать электроды под точным углом, чтобы обеспечить доставку электрических импульсов к крыше четвертого желудочка.
После своего развития этот метод проложил путь исследователям в области медицинских наук к изучению причинных факторов неврологических расстройств, в том числе опухолей головного мозга в мозжечке мыши.
View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos
В данной статье представлен метод CRISPR-опосредованной соматической мутагенезиса на основе электропорации для анализа функций генов в гранулярных клетках мозжечка. Данный подход позволяет эффективно оценивать роль генов в нормальном развитии мозжечка и формировании опухолей головного мозга.
CRISPR-mediated somatic mutagenesis in cerebellar granule cells via in utero electroporation enables rapid, cost-effective functional interrogation of disease-relevant genes in neurodevelopmental and neuro-oncology research. This approach bypasses the time and resource constraints of germline models, supporting earlier target validation and mechanistic de-risking in the discovery pipeline. The method's quantitative phenotyping and chimeric modeling facilitate predictive confidence for portfolio triage and translational continuity.
This method integrates at the interface of early discovery and preclinical model development, bridging genetic target identification with in vivo functional validation.