Объединяя анализ ДНК в добыче сырой вириона с анализом РНК от зараженных листьев, чтобы обнаружить новый вирус геномов

11.5K просмотров

08:56 мин.

27 июля 2018 г.

10.3791/57855-v

27 июля 2018 г.

11.5K просмотров

Jeanmarie Verchot¹ , Aastha Thapa² , Dulanjani Wijayasekara³ , Peter R. Hoyt⁴

¹Texas A&M Agrilife Center at Dallas, ²Noble Research Center, Oklahoma State University, ³Department of Biology, College of Engineering and Natural Sciences, The University of Tulsa, ⁴Bioinformatics and Genomics Core Facility, Department of Biochemistry and Molecular Biology, Oklahoma State University

Здесь мы представляем новый подход для выявления вирусов растений с двойной нити ДНК геномов. Мы используем стандартные методы для извлечения ДНК и РНК из зараженных листьев и осуществлять секвенирование нового поколения. Инструменты bioinformatic собрать последовательности в Сахалинской, определить Сахалинской, представляющих геном вируса и назначить геномов таксономических групп.