Investigation of Genetic Dependencies Using CRISPR-Cas9-based Competition Assays

Anagha Deshpande; Bo Rui Chen; Luyi Zhao; Kelsey Saddoris; Mayuri Kerr; Nan Zhu; Prashant Mali; Aniruddha J. Deshpande

doi:10.3791/58710

Исследование генетических зависимостей с помощью анализов на основе ТРИФОСФАТЫ Cas9 конкурс

JoVE Journal
Cancer Research

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Cancer Research

Investigation of Genetic Dependencies Using CRISPR-Cas9-based Competition Assays

Исследование генетических зависимостей с помощью анализов на основе ТРИФОСФАТЫ Cas9 конкурс

Full Text

10,026 Views

11:05 min

January 7, 2019

DOI: 10.3791/58710-v

Anagha Deshpande¹, Bo Rui Chen¹, Luyi Zhao¹, Kelsey Saddoris¹, Mayuri Kerr¹, Nan Zhu², Prashant Mali³, Aniruddha J. Deshpande¹

¹Tumor Initiation and Maintenance Program,Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute, ²Blood Research Institute,Blood Center of Wisconsin, ³Department of Bioengineering,University of California, San Diego

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Эта рукопись описывает основанный ТРИФОСФАТЫ-Cas9 метод кластерного регулярно Interspaced короткие палиндром повторяет (ТРИФОСФАТЫ) для простого и оперативного расследования роли нескольких генов кандидат в острый миелоидный лейкоз (ОМЛ) пролиферации в параллельно. Эта техника является масштабируемым и может быть применен в других рак клеточных линий, а также.

Это видео продемонстрирует простой метод для исследования нескольких генов-кандидатов в AML параллельно, используя систему Crisper-Cas9 в сочетании с цитометрией потока на основе конкурентного анализа роста. Основным преимуществом этой техники является то, что она быстрая и масштабируемая. Демонстрация процедуры будет Бо Руи Чэнь, пост документ из нашей лаборатории.

Программное обеспечение для проектирования CRISPR на основе Интернета используется для разработки четырех-шести отдельных RNAs руководства для гена интереса. Для начала заполните соответствующую информацию в полях звездочками. Затем выберите целевой геном для одного руководства РНК-дизайна.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos