22 февраля 2019 г.
Мы опишем, как анализы в vitro и in vivo инфекции, которые могут использоваться для анализа деятельности хост кодирования факторов.
Микробные патогены, которые размножаются внутриклеточно, должны в конечном итоге выйти из инфицированной клетки. Что, по сравнению с другими аспектами взаимодействия патогенов-хозяина, относительно недостаточно изучено. Здесь мы описываем методы анализа патогенного эффлюкса.
Мы показываем, как относительно просто анализы могут быть использованы либо для оценки эффективности эффлюкса или характеризуют пост-эффлюкс патогенов Общие методы, описанные здесь широко применимы, хотя конкретные модели клеток-хозяинов патогенов могут отличаться в кинетике, дозах и, возможно, считывателях. Как и при создании какой-либо экспериментальной системы, крайне важно установить четкий контроль, который обеспечит соблюдение подлинных биологических процессов в экспериментальных образцах или когортах. Демонстрацией процедуры будет Петория Гейл, аспирантка из моей лаборатории.
Для начала инфекционного эксперимента используйте пипетку, чтобы добавить в колодцы 20 микролитров свежеприготовленного Lm inoculum, при этом блюдо слегка наклонено, а кончик пипетки аккуратно помещается в чрезмерное ось. Избегайте прикосновения к стенам колодец с наконечником пипетки. Аккуратно пипетка содержимое каждого хорошо, чтобы обеспечить полное смешивание.
Не трясти или значительно наклонить пластину, чтобы избежать распространения LM над стенами хорошо. Верните блюдо клеточной культуры в 37 градусов по Цельсию, пять процентов инкубатора двуокиси углерода. Используйте условные средства массовой информации из неинфицированных клеток в качестве разбомбительного для подготовки 10 микрограмм на миллилитр раствора гентамицина.
На 30 минут после заражения, осторожно добавить 30 микролитров раствора гентамицина в блюдо, чтобы достичь конечной концентрации двухточечий пять микрограмм на миллилитр. Аккуратно пипетка содержимое хорошо смешать и вернуть блюдо клеточной культуры в инкубатор. Чтобы собрать урожай, слегка наклоните блюдо и осторожно используйте пипетки, чтобы удалить весь меас из колодец.
Добавьте в колодец пяти миллилитров дистиллированной стерильной воды. Через 30 секунд перенесите полученную воду лизат в микроцентрифугную трубку с одной точкой пять миллилитров и вихрь энергично в течение 10 секунд. Добавьте четырехтокаправленные пять микролитров и 50 микролитров воды к 450 микролитров дистиллированной стерильной воды для подготовки десятикратного и стократного разбавления.
Кратко вихрь для обеспечения тщательного смешивания. Добавьте 50 микролитров оригинальных десятикратных разбавленных и стократных разбавленных образцов на лизогенный бульон агар пластины, и распределить с помощью пластины распределитель. Для анализа новых LM, извлечь 10 микролитров наложения средств массовой информации из блюда и разделить его на два пятиминерных aliquots и микро центрифуг трубки.
Добавьте пять микролитров DMEM/FCS в одну алициту и добавьте пять микролитров DMEM/FCS, содержащих пять микролитров на миллилитр гентамицин, во вторую алициту в качестве контроля. Подождите пять минут при комнатной температуре. Добавьте 90 микролитров дистиллированной стерильной воды в каждую алициту и вихрь два энергично в течение 10 секунд.
Затем добавьте 50 микролитров образца на пластины LB agar и распределите с помощью распределители пластин. Храните пластины в 37 градусов по Цельсию инкубатор в течение двух дней, прежде чем перечислять Lm колоний. Используя автоматизированный счетчик ячеек, отрегулируйте подготовленные, сырые две-шесть-четыре точки семь клеток к концентрации один раз от 10 до шестой клетки на миллилитр.
Добавьте один миллилитр образца в скважины из шести скважин ткани культуры пластины. Заразить клетки с подготовленным Lm inoculum, что соответствует множественности инфекции 50. В одной точке пять часов после заражения, в одной точке пять миллилитров микроцентрифуг трубки заполнены 500 микролитров четыре процента PFA, собирать средства массовой информации из первого набора скважин и место трубки на льду.
Для сбора внутриклеточной Lm, добавить один миллилитр дистиллированной, стерильной воды в каждой хорошо. Через 60 секунд перенесите полученный лизат воды в одноточек пять миллилитров микроцентрифуг трубки с 500 микролитров четырехпроцентной ПФА. Вихрь трубки энергично в течение 10 секунд и поместить его на лед.
Для остальных скважин удалите мультимедиа и замените на один миллилитр DMEM/FCS пятими микрограммами на миллилитр гентамицин, чтобы убить внеклеточный Lm.Promptly вернуть блюдо в инкубатор. Через 30 минут удалите мультимедиа и замените DMEM/FCS без гентамицина. Еще через два-четыре часа собирайте средства массовой информации в лисаты во второй и третий раз поставить точку в трубках и поместить их на лед, чтобы охладить.
Центрифуговые трубки по 10 000 раз G в течение семи минут. Используя пипетку, удалите супернатант, не нарушая гранулы. Добавьте окрашивающий коктейль, содержащий 50 микролитров четырехпроцентного ПФА и 15 микролитров фаллоидин в трубку и смешайте, чтобы приостановить каждую гранулу.
Инкубировать трубки в темноте при четырех градусах по Цельсию в течение 20 минут. После инкубации добавьте один миллилитр буфера FACS к каждой трубке и пипетке вверх и вниз, чтобы перемешать. Спиновые трубки в центрифуге по 10 000 раз G в течение семи минут.
Удалите супернатант, не нарушая гранулы. Для немедленного использования приостанавливайте каждую гранулу в 400 микролитров буфера FAX. При хранении для более тщательного анализа добавьте 200 микролитров буфера FAX и 200 микролитров по четыре процента PFA в трубку и смешайте, чтобы приостановить.
Использование инфекционных условий в кратком лечении антибиотиком гентамицина для устранения невоинализированных Lm, нулевой точки один-пять процентов дикого типа Lm восстанавливается после одной точки пять часов совместного инкубации с культурными макрофагами. В ходе последующей совместной инкубации произошло четырехкратное и пятиохократное увеличение восстановления жизнеспособного ЛМ, которые представляют собой исключительно внутриклеточное распространение. Сопоставимый профиль наблюдался для штамма Lm, обладая гипервирулянтной prfA во время первоначальной инфекции, но не между тремя и шестью HPI.
Когда prfA был удален из штамма Lm, есть последующее снижение восстановления штамма после длительного совместного инкубации. Когда гентамицин удаляется из скважин в шесть HPI, внеклеточный Lm может быть обнаружен через час для диких типа и гипервирулянтных штаммов prfA, но не для штамма с prfA удалены. Средства массовой информации, накладыв как неинфицированные, так и инфицированные макрофаги, содержали светоразбрасывные твердые частицы размером с бактерию.
Однако только средства массовой информации из зараженных макрофагов обладали положительными сигналами GFP в пределах размера gating. С инфицированными макрофагами наблюдалось во времени увеличение появления фаллоиден-положительного Lm. При обливки макрофагов в 48-хорошо ткани культуры блюдо, оставить некоторые скважины без клеток.
Эти неклеточные контрольные скважины затем обрабатываются точно так же, как клеточные скважины, с точки зрения добавления патогена, антибиотиков и т.д., чтобы гарантировать, что экспериментальные сигналы зависят от присутствия клеток-хозяй. Подобно экспериментам, показанным на цифрах один и три, патогенные или принимающие факторы и или небольшие молекулы могут быть проверены на их влияние на патогенный клеточный эффлюкс.
Просмотрите полный транскрипт и получите доступ к тысячам научных видео
В этой статье рассматриваются методы анализа эффлюкса внутриклеточных микробных патогенов. Она подчеркивает как in vitro, так и in vivo методы исследования инфекций, которые могут быть использованы для оценки активности факторов, кодируемых хозяином, и эффективности эффлюкса патогенов.
Understanding pathogen efflux mechanisms provides critical insights into host-pathogen dynamics, enabling target validation for anti-infective strategies. Quantitative assays for cellular efflux support mechanistic de-risking in early discovery by linking pathogen factors to host responses. This approach enhances predictive confidence in identifying modulators of eukaryotic cell function relevant to therapeutic intervention.
Positioned within early discovery to lead identification, this method supports hypothesis testing, assay readiness, and quantitative analytics critical for downstream decision-making.