26 января 2019 г.
Мы представляем протокол для создания молекулярных челноки, где поверхность придерживается кинезин моторов белков продвинуть красителя, меченного микротрубочек. Слабого взаимодействия kinesins с поверхностью позволяет их реверсивные привязанность к нему. Это создает систему наноразмерных, которая exhibits динамической сборки и разборки его компонентов, сохраняя при этом свою функциональность.
Этот протокол имеет важное значение, поскольку он открывает двери для дальнейшего исследования в разработке наномасштабных биологических систем, которые находятся в динамическом равновесии. Этот метод заполняет часть разрыва между инженерными и природными структурами, поскольку он позволяет изучать то, что мы могли бы назвать, самовосстановление или динамическую замену молекулярных компонентов. Самый важный совет для того, чтобы попробовать этот метод в первый раз, чтобы убедиться, что экспериментатор следует всем протоколам безопасности.
Во-первых, подготовить фондовые решения, изложенные в текстовом протоколе. Пипетка 21,8 микролитров BRB80 Buffer в небольшую микро центрифугу трубки. Добавьте 1 микролитер раствора хлорида магния, 1 микролитер раствора запаса GTP и 1,2 микролитера раствора DMSO для завершения подготовки буфера роста микротрубочек.
Чтобы начать полимеризацию микротрубочек, добавьте 6,25 микролитров буфера роста микротрубочек непосредственно в 20 микрограммовую алицитат лиофилизированного тубулина; помечены как возбужденные на 647 нанометров. Вихрь на 40 RPS в течение 5 секунд. Охладить алицит на льду в течение 5 минут.
Затем инкубировать при 37 градусах по Цельсию в течение 45 минут. Для начала стабилизации микротрубочек добавьте 5 микролитров раствора пачлитакселя сликтом в 490 микролитров буфера BRB80. Vortex раствор на 30 RPS в течение 10 секунд.
После того, как 45 минут инкубации для микротрубочек вверх, добавить 5 микролитров этого решения в BRB80, и paclitaxel смеси, чтобы создать раствор MT100. Во-первых, добавьте 9,0 микролитров раствора алицита в 291 микролитер буфера BRB80. Пипетт 83 микролитров раствора корпусина BRB80 в новую 6-миллилитровую микро центрифугу трубки.
Добавьте 1 микролитер D-глюкозы, оксидазы глюкозы, каталазы, ПТТ, фосфата креатина и фосфокиназы. Затем добавьте 1 микролитр раствора АТФ в подвижность раствора. Флик, или вихрь aliquot однородно распространять химические вещества.
Далее добавьте 1 микролитр подготовленного кинезинового раствора в подвижность раствора, так что окончательная концентрация составляет 20 наномоляров. Добавьте 10 микролитров раствора MT100 в подвижность раствора. Для ячеек потока используйте как большую крышку, так и небольшую крышку.
Промыть все крышки дважды этанолом и дважды ультрапурной водой. Sonicate промывают крышки в ультрачистой воде в течение 5 минут. Затем высушите крышки в духовке при температуре от 50 до 75 градусов по Цельсию.
Используйте УФ-озоноочиститель для лечения одной стороны каждой крышки в течение 15 минут при комнатной температуре и в нормальных атмосферных условиях. Используя пинцет, переверните каждый coverslip и использовать УФ-озона для лечения необработанных стороны, а также. Sonicate обработанные крышки в ультрапурной воде в течение 5 минут.
Затем высушите их в духовке при температуре от 50 до 75 градусов по Цельсию. Далее, Дон защитное снаряжение, как указано в текстовом протоколе. Погрузите каждый coverslip в солевой раствор в течение 15 секунд.
Вымойте крышки дважды в толуоле и три раза в метаноле. Используйте под давлением азота, чтобы высушить крышки. Как только крышки высохнут, вырежьте кусок двухсторонней ленты, который составляет 2 сантиметра на 2,5 сантиметра.
Разрежьте этот кусок пополам вертикально на две 1 сантиметр на 2,5 сантиметра полосы. Положите большую крышку на тонкий стеклоочиститель задачи и придерживаться ленты полосы к нему, длина-мудрый по краям, чтобы создать 1 сантиметр на 2,5 сантиметра области между кусочками ленты. Stick небольшой крышкой на верхней части ленты полосы, чтобы закончить сборку потока ячейки.
Во-первых, поток около 20 микролитров решения PEG-PPG-PEG в собранный поток ячейки. Пусть раствор поглощается на поверхности в течение 5 минут, затем, обменять это решение с 20 микролитров буфера BRB80 три раза, пропуская буфер дюйма Поток 20 микролитров подвижного раствора в ячейку потока.
После этого, печать края потока ячейки с жиром, чтобы предотвратить испарение, если запланированный эксперимент длится более часа. Выполняйте визуализацию с помощью полной внутренней микроскопии флорескции объективного типа. Поместите каплю масла погружения на цель.
Затем поместите ячейку потока на платформу микроскопа. И довести цель до тех пор, пока есть контакт между нефтью на цель и поток ячейки. Используйте систему блокировки микроскопа, чтобы заблокировать весь лазерный свет от побега.
Затем включите лазер и сосредоточьтесь на нижней поверхности клетки потока с помощью 642 нанометрового лазера для изображения микротрубочек и 488 нанометрового лазера для изображения кинезиновых двигателей GFP. Запись изображений или видео, представляющих интерес. Изображения могут быть записаны до тех пор, пока есть подвижность в ячейке потока.
В этом исследовании представлена активная наномасштабная система, которая самостоятельно собирает слабо связывающие строительные блоки для построения собственного трека. С помощью микроскопии тифа, скользящие микротрубоконы по отдельности изображены от кинезин-моторов. Микротрубоконы видны при возбуждении с помощью 647 нанометрового лазера.
И GFP кинезин видны, когда возбужденных с 488 нанометровый лазер. Время между возбуждением и красным и зеленым светом было менее одной секунды. Как видно, скользящие микротрубоконы накапливают кинезин-двигатели из раствора и откладывают их на поверхность.
Кинезин двигатели остаются в результате микротрубочек в течение короткого периода времени, прежде чем вернуться к раствору. Очень важно иметь правильную концентрацию реагентов в антифаде подвижности раствора, в противном случае, отбеливание фотографий приведет к провалу эксперимента. Этот метод прокладывает путь для более эффективного использования белковых двигателей в наномасштабных инженерных системах.
Таким образом, позволяет проектировать и изучать более сложные наноструктуры.
В данном исследовании представлен протокол создания молекулярных шаттлов с использованием моторных белков кинезинов для перемещения меченных красителем микротрубочек. Система обеспечивает возможность динамической сборки и разборки при сохранении функциональности.
Данный протокол позволяет изучать динамические наноразмерные системы, в которых молекулярные компоненты самособираются и диссоциируют в состоянии равновесия, что служит моделью для механистического снижения рисков на ранних этапах валидации мишеней. Имитируя биологический транспорт с помощью обратимо прикрепленных моторных белков, эта система обеспечивает прогностическую достоверность скрининговых анализов, требующих стабильной и воспроизводимой подвижности. Система представляет собой релевантную для изучения заболеваний платформу для оценки влияния соединений на динамику цитоскелета без необходимости перманентной иммобилизации.
Данный метод подходит для рабочих процессов на ранних стадиях поиска, когда приоритет отдается взаимодействию с мишенью и функциональному анализу перед оптимизацией соединений-лидеров.