12 февраля 2019 г.
Протокол описывает используется воспроизводимый метод, предназначенный для использования с supernatants культуры клеток для обнаружения поверхностных epitopes на небольших внеклеточного везикулы (EV). Он использует конкретные иммунопреципитации EV, с использованием бисера в сочетании с антителами, которые признают поверхностный антиген CD9, CD63 и CD81. Этот метод оптимизирован для анализа цитометрии вниз по течению потока.
Внеклеточные пузырьки все чаще используются в качестве диагностического биомаркера и потенциального терапевтического инструмента во многих областях. Flow Cytometric является наиболее прямой вперед аналитический метод для характеристики костюма сталкиваются маркеры этот протокол может быть использован при анализе assized частицы, быстро, и применимо к обычным сейсмометры без необходимости специальной настройки или выделенный инструмент. Хотя этот протокол используется для классификации внеклеточных пузырьков от сказал условие и среды, она может быть расширена в направлении классификации крови прибыл AVs, чтобы заменить инвазивных биопсий тканей у пациентов.
Для исследователей, новых к протоколу, очень важно выполнить шаги, описанные в разделе метода настройки, и внимательно следить за продемонстрированы стратегии получения Начать путем покрытия 55 сантиметров в квадрате Петри-блюда с 02%porcine кожи желатина, в PBS. Через 15 минут, мыть блюдо и пластины 4,4 раза 10 до пятого сердечного прародителя клетки на каждое блюдо в 7 миллилитров Iscove в модифицированных Dulbecco's Medium, или IMDM, дополненный 20%fetal сыворотки крупного рогатого скота, и 1%пенициллин и стрептомицин для их инкубации при 37 градусов по Цельсию и 5%углекислого газа. Когда клетки достигают около 80% слияния, мыть культуры в два раза с PBS Дулбекко без кальция и магния и кормить клетки с 10 milileters сыворотки свободной экзосомы производства среды.
Через 7 дней с каждой пластины сгустите кондиционированную среду в единую полипропиленовую центрифугу и центрифугу для удаления любого клеточного мусора. Перенесите супернатент в 100-килодальтонную центрифугу фильтровальной трубки, и сосредоточьте очищенную, кондиционированную, среду с дополнительной центрифугой. Перенесите концентрат в трубку микроцентрифуги для окончательной центрифугации скамейки и добавьте супернатант в поликарбонатную толстую стенку микроцентрифугной трубки.
Заполните трубку PBS, до конечного объема 3,2 milileters, и загрузить образец в титановый фиксированный ангельский ротор. Затем загрузите ротор в настольный ультрацентрифуг для ультрацентрифугации и повторно насадите гранулы в 100 микролитров свежего PBS. Для отслеживания и анализа наночастиц количественно, разбавить 1 микролитр ультрацентрифугированного образца, в 999 микролитров PBS, и загрузить образец в 1 миллилет шприц без пузырьков.
Загрузите шприц в входный порт экзаменационной камеры и включите лазер. Используйте кнопку захвата, чтобы открыть камеру и настроить фокус. Затем завемить по крайней мере три различных кадра по 60 секунд каждый и использовать опцию пакетного процесса в программном обеспечении, чтобы проанализировать три различных приобретения.
Чтобы подготовить образец к приобретению, сначала добавьте соответствующие экспериментальные моноклональные антитела, конъюгированные бусинки захвата в соотношении 1:1:1, в микроцентрифугу трубки, и вихрь в результате захвата бисера бассейн. Далее добавьте соответствующий объем выборки к 1 микролитеру пула бусинки захвата для генерации 1 раза от 10 до 8 частиц плюс 1,2 раза от 10 до 5 бусин на тестовую концентрацию. Добавьте 1 микролитер из бисера в трубку с маркировкой бисера как отрицательный контроль, и отрегулируйте громкость в каждой трубке до 100 микролитров со свежим PBS.
Затем поместите трубки в термомешалке, с встряхивания, на 400 оборотов в минуту, и от 4 до 10 по Цельсию, на ночь. На следующий день, передать образцы на круглое дно 96 хорошо пластины, и добавить соответствующие florescence конъюгированных антител к каждому хорошо. После 1 часа инкубации при 4 до 10 градусов по Цельсию, добавить 100 микролитров PBS к каждой хорошо, и открыть приобретение программного обеспечения.
Выберите цитометр и систему запуска программы, чтобы начать инструмент и открыть новый эксперимент. Создайте экспериментальный шаблон, выберите пластину и добавьте пластину. Выберите положение образцов на пластине, и нажмите набор, а также образец.
Введите имя образца в правилах именования, откройте вкладку канала и выберите соответствующие каналы сигнала флорескции. Теперь загрузите пластину в инструмент. И нажмите точка участок, чтобы создать новую область рассеяния вперед по сравнению с боковой области рассеяния точка участка.
Выберите инициализировать, чтобы начать лазер и fluidics и нажмите запустить, чтобы начать приобретение. Отрегулируйте шкалу, чтобы показать население в середине вперед по сравнению с боковой участок рассеяния, и сделать бисер ворота вокруг всей популяции выборки, чтобы исключить мусор. Нажмите стоп и точка участок для создания вперед рассеяния высоты по сравнению с вперед рассеяния области точка участка, и ворота образца на бисер населения.
Нарисуйте новые ворота вокруг большего населения и назовите его Singlets, и нажмите точка участок, чтобы создать один флуоресцентный сигнал по сравнению с боковой рассеяния области точка участка, в экспериментальном флюорофор используется. Ворота новый участок точка на Singlets. Затем выберите количество событий для записи и выберите запись для начала экспериментального приобретения.
В конце анализа загрузите файлы приобретения в соответствующее программное обеспечение для анализа и откройте новый протокол. Создайте точечные участки для каждого файла, как только что продемонстрировано, и установите всю ось рассеяния в линейную шкалу, и все флуоресцентные оси для шкалы журнала. Затем покажите геометрическое значение флоресции в соответствующих каналах сигналов, чтобы рассчитать полное изменение среднего интенсивности флорескции, в различных внеклеточных препаратах везикулы.
После тестирования различных условий, чтобы установить минимальное общее количество внеклеточных пузырьков, чтобы достичь ранней экспоненциальной фазы кривой интенсивности среднего флуоресценции, минимальное количество частиц было определено в 1 раз от 10 до 8 частиц на окрашивание. Оптимальная концентрация антител в 1 раз от 10 до 8 частиц для достижения наивысшего сигнала без связывания неспецифических антител, была определена как 10 микрограмм на миллилитр как для анти-CD9_FITC и анти-CD63_PE антител и пять микрограмм на миллилитр для анти CD81_PE антитела. Чтобы подтвердить пригодность метода, для анализа чашки формы внеклеточных пузырьков, а не мембранного мусора, внеклеточные пузырьки были sonicated, в результате чего снижение среднего флуоресценции интенсивности, после всего лишь 30 секунд sonication, без флорескции обнаружены на всех после одной минуты механического нарушения.
Собственная очистка X от клеток-предшественников сердца, как было продемонстрировано, дает внеклеточные пузырьки, выражая низкий уровень CD9 и высокий уровень CD63 и CD81 у обеих популяций клеток. Кроме того, в то время как собственные маркеры поверхности X четко идентифицируются без ультрацентрифугации, этот шаг обогащения значительно повышает средняя интенсивность флуоресценции этих маркеров. При работе с внеклеточными пузырьками, есть более небрежные гранулы наночастицы могут быть легко пропущены.
Поэтому необходимо следовать всем шагам, как это попродемонстрировано в протоколе. Использование внеклеточных пузырьков в качестве биомаркера в настоящее время является одним из самых новых полевых исследований. И в скором времени, может быть переведен в клинической диагностики используется в качестве альтернативного инструмента скрининга.
Просмотрите полный транскрипт и получите доступ к тысячам научных видео
Этот протокол описывает воспроизводимый метод обнаружения поверхностных эпитопов на малых внеклеточных везикулах (EV) с использованием супернатантов клеточной культуры. Метод включает специфическую иммунопреципитацию EV с помощью перли с антиген-связанными антителами для идентификации поверхностных антигенов CD9, CD63 и CD81, оптимизированный для анализа в потоковом цитометре.
Flow cytometric analysis of extracellular vesicles (EVs) from cell-conditioned media enables semi-quantitative, high-throughput profiling of EV surface antigens, supporting early-stage biomarker discovery and mechanistic de-risking. This approach provides scalable, reproducible data on vesicle populations, facilitating confident target validation and translational continuity across discovery and preclinical pipelines. The method's compatibility with conventional flow cytometers enhances accessibility and enterprise-wide adoption for EV-based research initiatives.
This method integrates into the discovery-to-preclinical continuum by enabling robust EV marker analysis from cell culture supernatants, supporting both early hypothesis testing and downstream translational research.