Studying RNA Interactors of Protein Kinase RNA-Activated during the Mammalian Cell Cycle

Sujin Kim; Minjeong Kang; Yoosik Kim

doi:10.3791/59215

Изучая РНК посредники РНК активирована во время цикла Mammalian клетки киназы протеина

JoVE Journal
Biochemistry

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Biochemistry

Studying RNA Interactors of Protein Kinase RNA-Activated during the Mammalian Cell Cycle

Изучая РНК посредники РНК активирована во время цикла Mammalian клетки киназы протеина

Full Text

6,907 Views

10:05 min

March 5, 2019

DOI: 10.3791/59215-v

Sujin Kim¹, Minjeong Kang¹, Yoosik Kim¹

¹Department of Chemical and Biomolecular Engineering and KI for Health Science and Technology (KIHST),Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST)

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Мы представляем экспериментальные подходы для изучения РНК посредники протеинкиназы привязки двуцепочечной РНК РНК активированный (PKR) во время млекопитающих клеточного цикла, используя НеЬа клетки. Этот метод использует формальдегида crosslink РНК-PKR комплексов и иммунопреципитации обогатить PKR-прыгните РНК. Эти РНК могут быть далее проанализированы через высокопроизводительного секвенирования или qRT-PCR.

Этот протокол предоставляет метод для выявления РНК-взаимодействователей РНК связывающего белка PKR в геноме всей образом. Это помогает нам лучше понять пост-транскрипционные регуляции экспрессии генов РНК связывающий белок. Основным преимуществом этого метода является то, что он использует эффективное скрещивание формальдегида, чтобы исправить RNase связаны с РНК-связывающих белков и обогатить их с помощью иммунопреципиентации.

Активированный PKR наблюдается у пациентов с нейродегенеративными заболеваниями, такими как болезнь Паркинсона и Болезнь Альцгеймера. Выявление PKR-взаимодействующих двухместных RNase поможет нам лучше понять патогенез этих дегенеративных заболеваний. Этот метод может быть использован для изучения РНК-взаимодействователей любых РНК-связывающих белков.

View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos