Биоинформатика трубопровод точно и эффективно анализировать microRNA транскриптомы в растениях

7.8K просмотров

Процитировано: 2

06:34 мин

21 января 2020 г.

10.3791/59864-v

21 января 2020 г.

7.8K просмотров

Ying Wang^*¹^,² , Zheng Kuang^*¹^,² , Lei Li² , Xiaozeng Yang¹

¹Beijing Key Laboratory of Agricultural Genetic Resources and Biotechnology, Beijing Agro-Biotechnology Research Center, Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences, ²State Key Laboratory of Protein and Plant Gene Research, Peking-Tsinghua Center for Life Sciences, School of Advanced Agricultural Sciences and School of Life Sciences, Peking University

^* These authors contributed equally

Конвейер биоинформатики, а именно miRDeep-P2 (miRDP2 для краткости), с обновленными критериями miRNA растений и пересмотренным алгоритмом, может точно и эффективно анализировать транскриптомы микроРНК в растениях, особенно для видов со сложными и крупными геномами.

Больше видео

miRDeep2

Bowtie 2

Chapters in this video