Murine линии на основе модели хронического ингибивания CDK9 для изучения широко распространенных негенетических дефектов транскрипционной удлинения (TEопределенно) в раках

Учитывая, что рак Тедеффа является значительным препятствием против иммунотерапии, наша фармакологическая модель является выгодным инструментом, поскольку она соответствующим образом имитирует широко распространенные транскрипционные и эпигенетические дефекты, наблюдаемые при таких раковых заболеваниях, и позволяет изучать эти негенетические аномалии, чтобы получить новые идеи, найти новое применение существующих препаратов, или найти новые стратегии против таких видов рака. Это простая в установлении и обысловимая модель для изучения транскрипционных дефектов удлинения при раковых заболеваниях, что позволяет изучать опухолевые иммунные взаимодействия как в пробирке, так и в in vivo. Этот метод также может быть применен к линиям карциномы человека.

Мы протестировали это на T47D и CAL51 в краткосрочной перспективе, что дает возможность для аналогичных TEdeff-подобных характеристик. Протокол, который мы описываем здесь, дает базовую основу для сведения к минимуму известных переменных, критически важных для генерации TEdeff-подобных функций при хроническом торможении CDK9. Тем не менее, необходимо позаботиться об оптимизации точной сублетной дозы флавопиридола для других линий мурина.