Транскриптом-широкое профилирование белково-РНК-взаимодействий путем перекрестного связывания и иммунопреципиентации при посредничестве FLAG-Biotin Tandem Purification

Только связывающие белки контролируют несколько биологических процессов. Этот метод FLAG-Biotin CLIP-seq, следовательно, глобально профилированного специального и временного расположения РНК и RBPs в клетках млекопитающих. Этот метод позволяет эффективно обнаруживать прямые РНК, связанные с белком, без SDS-PAGE и процедур переноса мембраны.

По сравнению с традиционным CLIP-seq изотопов бесплатно и не требует белка конкретных антител. Начните с покрытия около 3 миллионов эмбриональных клеток мыши STEM в 10-сантиметровой пластине и инкубации их в одночасье. На следующий день удалите среду с помощью вакуума и обработать клетки двумя миллилитров 0,25%трипсина ЭДТА в течение двух минут при комнатной температуре.