Оптимизация для секвенирования и анализа деградированных образцов FFPE-РНК

11.8K просмотров

Процитировано: 19

07:30 мин

8 июня 2020 г.

10.3791/61060-v

8 июня 2020 г.

11.8K просмотров

Yelena Levin^*¹ , Keyur Talsania^*¹^,² , Bao Tran¹ , Jyoti Shetty¹ , Yongmei Zhao¹^,² , Monika Mehta¹

¹NCI CCR Sequencing Facility, Frederick National Laboratory for Cancer Research, ²Advanced Biomedical and Computational Sciences, Frederick National Laboratory for Cancer Research

^* These authors contributed equally

Этот метод описывает шаги по улучшению качества и количества последовательности данных, которые могут быть получены из формалина фиксированной парафин-встроенных (FFPE) РНК образцов. Мы описываем методологию для более точной оценки качества образцов FFPE-РНК, подготовки библиотек секвенирования и анализа данных из образцов FFPE-РНК.