2D-HELS MS SEQ: Общий метод на основе LC-MS для прямого и de novo секвенирования смесей РНК с различными модификациями нуклеотидов

2.1K просмотров

Цитируется: 8

05:41 мин.

10 июля 2020 г.

10.3791/61281-v

10 июля 2020 г.

2.1K просмотров

Ning Zhang¹^,² , Shundi Shi² , Barney Yoo³ , Xiaohong Yuan¹ , Wenjia Li⁴ , Shenglong Zhang¹

¹Department of Biological and Chemical Sciences, New York Institute of Technology, ²Department of Chemical Engineering, Columbia University, ³Department of Chemistry, Hunter College, City University of New York, ⁴Department of Computer Science, New York Institute of Technology

В данной статье мы описываем подробный протокол метода секвенирования на основе LC-MS, который может быть использован как прямой метод для секвенирования короткой РНК (<35 nt на прогон) без промежуточного продукта кДНК, так и в качестве общего метода для секвенирования различных модификаций нуклеотидов в одном исследовании с точностью до одного основания.