Сегментация и линейное измерение для анализа состава тела с использованием Slice-O-Matic и Horos

Было показано, что дегенерация ленточных мышц при саркопении является прогностического фактора для выживания рака и успеха лечения. Анализ состава третьей поясничной области представляет интерес, так как он обеспечивает количественную характеристику скелетных мышц и в рамках КТ дает качественную информацию о жировой ткани. Следующие процедуры предоставляют протокол и сегментированную вертикаль в программном обеспечении sliceOmatic, а также ваши протоколы измерений для анализа композиции на изображениях КТ и МРТ.

Выбор протокола позвонков L3 завершается в пределах ГЭ-центриты. Имейте в виду, что при использовании другого программного обеспечения инструменты могут отличаться. Откройте снимки КТ или МРТ пациента, сделанные в интересующих сроки.

Выберите области монитора, вид окна 2 В. Выберите корональный или сагиттальный вид на левом экране, перейдя к сериям, а затем выбрав корональные или сагиттальные изображения. Выберите осевой вид на правом экране, перейдя к последовательному, а затем выбрав осевые изображения.

Нажмите на conn, перекрестную ссылку, чтобы связать два изображения, затем прокрутите изображения на корональном или сагиттальном виде, чтобы убедиться, что позвонки позвоночника легко видны. Затем прокрутите изображения осевого вида, чтобы найти позвонки L1. L1 является первым позвоночном, который не имеет реберного крепления.

Отсчитайте от L1 до позвонков L3. Обязательно используйте сагиттальный или корональный вид для справки, чтобы найти центр позвонков L3. Экспортируйте изображение L3, перейдя в меню экзамена, выберите экспорт изображений, выбранные изображения.

Убедитесь, что формат DICOM. Затем выберите место, в которое должно быть сохранено изображение. Дважды щелкните файл DICOM, чтобы открыть sliceOmatic.

После загрузки программы перетащите изображение DICOM в любое место на экран sliceOmatic. Перейдите в режимы, регион роста, чтобы начать сегментацию. Выберите инструменты, зафиксируйте теги.

Эта функция будет использоваться на последующих этапах. Нажмите на красный под растущей областью, чтобы установить ограничения H.U.для мышц. Затем нажмите на кнопку выключения рядом с нижним пределом.

Это настроит его на включение. Отрегулируйте предел с помощью ползунка, чтобы он был как можно ближе к отрицательному 29. Затем используйте колесо мыши, чтобы установить его точно на отрицательный 29.

Затем нажмите кнопку выключения рядом с верхним пределом, чтобы установить его на. Используйте ползунок и колесо мыши, чтобы установить предел H.U.limit на положительный 150 Далее, нажмите на зеленые два, чтобы установить H.U.limits для I.M.A.T., и установите нижний и верхний пределы таким же образом, но установив нижний предел на отрицательный 190 и верхний предел на отрицательный 30. Нажмите на желтую пятерку, чтобы установить пределы для V.A.T.this time, установленные в нижнем пределе на отрицательный 150 и верхний предел на отрицательный 50.

Наконец, нажмите на циановую семерку, чтобы установить пределы H.U.для S.A.T., установив нижний предел отрицательным 190, а верхний предел отрицательным 30. Нажмите клавиши плюс и минус на клавиатуре, чтобы увеличить изображение по мере необходимости. Отрегулируйте масштаб по мере необходимости на протяжении всего процесса сегментации.

Выберите красный и убедитесь, что параметр кисти настроен на рисование. Используйте размер кисти, который наиболее эффективен для изображения, и начните рисовать, нажав на мышечную ткань. Закрасьте псоа, параспинальные группы мышц и косые группы мышц.

Позаботьтесь о краях мышц, которые находятся близко к позвоночнику, внутренним органам или жидкостям, чтобы убедиться, что они не помечены как мышцы. Если что-либо помечено ложно, выберите «Нет» и удалите ошибку. После того, как все мышцы будут помечены, выберите одну в меню блокировки тегов.

Это гарантирует, что ни одна мышца не будет случайно стертой или повторно помечена по мере продолжения сегментации. Выберите зеленые два и закрасьте ткань I.M.A.T. в мышечной фасции. Обратите внимание, что большинство промежутков внутри самой мышцы будут I.M.A.T.Обратите внимание, что края мышечной фасции часто легче по внешнему виду, чем окружающие ткани.

Это может быть полезным руководством, особенно в областях, где косые группы мышц встречаются с параспинальными группами мышц и в области ниже спины эректора, но выше фасциальной линии. После того, как все I.M.A.T. будут помечены тегами, выберите их в меню блокировки тегов. Затем выберите желтую пятерку из меню роста региона, чтобы начать сегментировать V.A.T.One по-прежнему может использовать опцию кисти, но для многих изображений может быть проще и быстрее использовать опцию «увеличить до D».

Если вы используете grow to D, обязательно выберите наименьший размер кисти, а затем нажмите на V.A.T.tissue в изображении, чтобы пометить его. Убедитесь, что ткани или жиры внутри кишечника или других органов не помечены как V.A.T. Как только все V.A.T.is помечены, выберите пять в меню блокировки тегов. Наконец, выберите циановую семерку из меню роста региона, чтобы пометить S.A.T.tissue.

Опять же, в зависимости от изображения, S.A.T.ткань часто легче пометить с помощью опции grow to D. После того, как ткань S.A.T.помечена, проверьте края, особенно вокруг кожи, чтобы убедиться, что только подкожный жир помечен как S.A.T. После того, как все ткани были помечены, посмотрите на изображение, чтобы убедиться, что нет ошибок или неправильно помеченных тканей. По завершении перейдите к инструментам, пометьте объем поверхности.

Нажмите на кнопку значений окна и запишите площадь поверхности каждой ткани и средние значения H.U. Наконец, перейдите в файл, сохраните файлы тегов. При этом будет сохранен файл тегов, в котором находится образ DICOM.

Чтобы начать сегментацию МРТ, перейдите в режимы роста региона. Глядя в окно предварительного просмотра, мы можем увидеть гистограмму значений H.U., где первый пик - воздух, следующий - скелетные мышцы, и если следующие пики различимы, они будут костью, за которой следует жировая ткань. Обратите внимание, что при использовании изображений МРТ обычно только скелетные мышцы могут быть уверенно сегментированы из-за плохой дискриминации жировой ткани.

Выберите красный и поверните нижний предел, оставив его равным нулю. Затем включите верхний предел и измените параметр колеса мыши на верхний предел. Затем выберите параметр «Краска и большая кисть», затем наведите курсор на мышцу psoas так, чтобы область курсора включает в себя как мышцы, так и кости.

Чтобы быть уверенным в том, что кость не помечена как мышца, установите верхний предел консервативно, перемещая колесо мыши до тех пор, пока верхний предел не будет включать в себя какие-либо внешние костные ткани. Затем сегментирует мышечную ткань, непосредственно прилегающую к позвоночнику. Затем переместите курсор на linea alba или в любое другое место на сканировании, где жировую ткань и мышцы легко дифференцировать.

Увеличьте верхний предел как можно выше, не включая жировую ткань. Отсюда можно приступать к сегментированию всех оставшихся скелетных мышц. Обратите внимание, что для некоторых изображений верхний предел может потребоваться постоянно корректировать.

Обратите внимание, что, хотя установка верхнего предела с помощью этой двухэтапной процедуры является консервативной, она оптимизирует количество скелетных мышц, которые должны быть помечены, не беспокоясь о значительной ошибочной маркировке кости или жировой ткани. По завершении перейдите к инструментам, пометьте объем поверхности и выберите значения окна, чтобы записать площадь поверхности и средние значения H.U. скелетной мышцы. Было показано, что линейное измерение области позвонков L3 тесно коррелирует с общей мышечной массой.

Преимуществом линейного измерения является его простота и скорость, а также тот факт, что его можно сделать на любом программном обеспечении с помощью инструмента линейки или инструмента коробки. Этот протокол демонстрируется с помощью приложения Horace Medical Imaging. Если вы используете другое программное обеспечение, имейте в виду, что конкретные инструменты могут очень.

Импортируйте изображение в средство просмотра, нажав на импорт, затем перейдя к местоположению изображения и выбрав открыть. После импорта нажмите на изображение или имя пациента, чтобы отобразить изображение внизу. Дважды щелкните изображение, чтобы развернуть его, что также откроет параметры инструмента.

Определите группы псоа и параспинальных мышц. Отметим, квадратус поясничного не следует учитывать при определении краев параспинальных групп мышц. Выберите инструмент «Линейка».

Провести вертикальную линию от самых высоких точек группы мышц до самого низа группы мышц. Затем проведите горизонтальную линию от самого широкого края группы мышц до другого самого широкого края группы мышц. Повторите этот процесс как для правой, так и для левой псоа, а также для правой и левой параспинальных групп.

Обратите внимание, что нарисованные линии должны пересекаться под 90 градусами. Обратите внимание, что если бы края нарисованных линий были соединены, это соединение должно было создать коробку, охватывающую всю группу мышц. В Horace Medical Viewer трудно использовать инструмент линейки, чтобы обеспечить пересечение линий под 90 градусами.

По этой причине вместо этого следует использовать инструмент рисования коробок. Выберите инструмент «Прямоугольник». Нарисуйте коробку вокруг каждой группы мышц, теперь обратите внимание, что края коробки касаются самой высокой и самой низкой частей мышцы, а также самых широких частей мышцы.

До тех пор, пока инструмент box отображает свои вертикальные и горизонтальные размеры, он может быть предпочтительнее инструмента линейки, поскольку он позволяет легко визуализировать границы мышц. Правильно сегментированное изображение КТ или МРТ не должно иметь мышечных меток за пределами фасциальных линий, а для изображений КТ не должно быть жировой метки в мышечной фасции или на коже. Запишите площадь мышечной поверхности рядом с ростом пациента, чтобы рассчитать индекс скелетных мышц.

Для компьютерного томографии области поверхности жировой ткани могут быть записаны на основе конкретных исследований или клинических вопросов, представляющих интерес. Кроме того, средние значения H.U.могут быть записаны для контроля качества L3 линейное измерение должно иметь линейку или коробку измерений, охватывающих всю каждую мышцу. Запишите горизонтальную ширину и вертикальную высоту каждой мышцы, а также рост пациента.

Умножьте ширину и высоту для каждой мышцы, затем суммируйте эти области, чтобы получить общую площадь мышц. Рассчитайте индекс линейного измерения, разделив общую площадь на рост пациента в квадрате. Продемонстрированный протокол позволяет клиницистам и исследователям использовать L3 КТ или МРТ для получения быстрой и надежной количественной информации для оценки саркопении.