September 1st, 2020
Здесь представлен протокол криогенного переноса замороженных образцов в зонд динамической ядерной поляризации (DNP) с магическим углом вращения (MAS) ядерного магнитного резонанса (ЯМР). Протокол включает в себя указания по хранению ротора до эксперимента и указания по измерениям жизнеспособности до и после эксперимента.
Чувствительность ЯМР-спектроскопии MAS с помощью ДНФ позволяет охарактеризовать белки внутри интактных клеток в их эндогенной концентрации. Это применение требует тщательного обращения с образцом. Некоторые морфологии сохраняются, и клетки становятся жизнеспособными при их криогенном переносе в спектрометр с использованием этого протокола.
Введение холодного ротора может привести к образованию влаги и льда, что может механически препятствовать раскрутке образца. Эта демонстрация поможет провести эксперименты для уверенного выполнения криогенного переноса. Для начала положите под крышку и на дно криогенного флакона подушку, сделанную из кусочка салфетки или бумажного полотенца.
Поместите 3,2-миллиметровый сапфировый ротор в криогенный флакон, обитый папиросной бумагой, маркированным концом к дну флакона. Медленно заморозьте ротор, поместив флакон в контейнер с контролируемой скоростью охлаждения, и поместите контейнер в морозильную камеру с температурой 80 градусов Цельсия минимум на три часа. Переложите криогенный флакон с замороженным ротором в небольшую вакуумную колбу, наполненную жидким азотом.
Используйте вакуумную колбу для переноски образца к спектрометру. Наполните сухую, теплоизолированную вакуумную колбу из пенопласта с широким горлышком 500 миллилитров на один литр жидкого азота. Возьмите криогенный флакон из колбы для переноса и держите его чуть выше поверхности жидкого азота, чтобы защитить его от атмосферы.
Держа криогенный флакон горлышком флакона слегка вниз, открутите крышку и дайте ротору скользнуть в ванну с жидким азотом. Предварительно охладите микроцентрифужную пробирку объемом 1,5 миллилитра, погрузив ее в жидкий азот. С помощью пинцета под поверхностью ванны с жидким азотом переместите ротор в микроцентрифужную трубку так, чтобы приводной наконечник был обращен к дну пробирки, а маркировка была обращена к отверстию.
С помощью пинцета удерживайте трубку с ротором под жидким азотом за горлышко. С помощью второй пары пинцетов удерживайте ловушку ЯМР над поверхностью жидкого азота, наклоненной под острым углом по отношению к микроцентрифужной трубке. Чтобы перевести ротор из ловушки образцов ЯМР на спектрометр ЯМР, поместите криокамеру в режим выброса нажатием кнопки «Выброс».
Вставьте открытый конец ловушки образцов ЯМР в микроцентрифужную пробирку, пока она еще находится под поверхностью жидкого азота. Поднимите микроцентрифужную пробирку и ЯМР-улавливатель образцов, чтобы ротор упал в ловушку для проб. Встряхните улавливатель образцов и трубку, если ротор застрял на ободе
.Оставьте пустую микроцентрифужную пробирку в верхней части ловушки образцов ЯМР, чтобы защитить ротор от воздуха. Снимите другой пустой уловитель проб с зонда и положите его на пол. Перенесите уловитель образцов ЯМР, содержащий ротор, в другую руку.
Затем извлеките микроцентрифужную трубку и сразу же вставьте ее в зонд. Подайте сигнал сотруднику, работающему с криокамерой, чтобы он нажал стоп, извлек и вставил. Раскрутите образец до желаемой скорости вращения, регулируя подшипник и давление потока.
Налейте от 500 миллилитров до одного литра жидкого азота в вакуумную колбу с широким горлышком для пены и поставьте ванночку под спектрометр. Опустите пустой криогенный флакон с кусочком папиросной бумаги в ванну с жидким азотом. Уменьшите скорость вращения до нуля килогерц, уменьшив поток приводного газа и газа подшипника, и выбросьте ротор, переключившись в режим выброса.
Не выключая режим выброса, снимите улавливатель проб с зонда и опустите ротор прямо в колбу с широким горлышком из пенопласта, содержащую жидкий азот. С помощью предварительно охлажденного пинцета перенесите ротор в предварительно охлажденный криогенный флакон под поверхность жидкого азота. Предварительно охладите крышку криогенного флакона, опустив ее в жидкий азот.
Извлеките флакон с ротором и жидким азотом из ванны и закройте пробирку предварительно охлажденной крышкой. Снова погрузите криогенный флакон в жидкий азот. Образец может быть перемещен в долгосрочное хранилище жидкого азота или немедленно распакован для дальнейшего анализа.
Криогенное введение предварительно замороженных образцов клеток млекопитающих в ЯМР-спектрометр поддерживает жизнеспособность на протяжении всего эксперимента ЯМР. При использовании этого протокола проницаемость трипанового синего клеток клеток млекопитающих после ЯМР MAS аналогична проницаемости клеток, не подверженных какому-либо изменению температуры. Если клетки медленно замораживают, а затем нагревают до комнатной температуры перед введением, клеточная жизнеспособность снижается до менее чем 10%.
При попытке выполнить протокол обратитесь за помощью с нажатием кнопки извлечения и вращением образца, чтобы образец можно было ввести в зонд до того, как он нагреется, убедившись, что в зонд не попадет влага, и будьте уверены, что спектрометр будет работать холодным в течение многих недель. Этот протокол применим к любым системам, в которых колебания температуры могут нарушить целостность образца, например, к реакциям замораживания, гашения или характеризации захваченных промежуточных продуктов реакции, ферментологии и сворачиванию белков.
Этот протокол описывает криогенный перенос замороженных образцов в зонд ядерного магнитного резонанса (ЯМР) с магическим углом вращения (MAS), с фокусом на поддержании целостности и жизнеспособности образцов. Он направлен на решение проблемы накопления влаги при введении ротора в спектрометр, обеспечивая сохранение функциональных характеристик клеток на протяжении всего эксперимента.
Cryogenic sample handling enables preservation of cellular integrity for dynamic nuclear polarization NMR studies of intracellular proteins at endogenous concentrations. This approach supports target validation in native cellular environments by maintaining viability through low-temperature transfer. The protocol addresses a key bottleneck in applying high-sensitivity NMR to drug discovery workflows requiring mechanistic de-risking of therapeutic targets.
The method fits within the early discovery continuum, enabling structural characterization after target identification and before lead optimization, particularly for intracellular targets requiring native-cell context.