December 23rd, 2020
Здесь мы представляем гидрофобный метод очистки тканей, который позволяет рассматривать молекулы-мишени как часть неповрежденных структур мозга. Этот метод в настоящее время подтвержден для борьбы с F344/N и трансгенных крыс с ВИЧ-1 обоих полов.
Общая цель этой техники очистки состоит в том, чтобы разработать метод очистки тканей мозга крысы. Этот протокол также может быть использован для трансгенной крысы с ВИЧ-1. Основное преимущество этого метода заключается в том, что ткань мозга крысы может быть оставлена нетронутой для очистки, что позволяет проводить полный анализ на уровне цепи.
Демонстрировать процедуру будут Кристин Киршнер, кандидат наук из моей лаборатории, а также Хайлунг Ли, научный сотрудник из моей лаборатории. После проведения транскардиальной перфузии у крысы в возрасте от трех до шести недель удалите мозг из черепа с помощью щипцов. Затем поместите его в сагиттальное положение и разрежьте на четыре равных участка шириной три миллиметра с помощью лезвия бритвы и матрицы мозга крысы.
Закрепите каждую секцию в четырехпроцентной PFA в герметичной пятимиллилитровой пластиковой трубке на ночь на шейкере при температуре четыре градуса Цельсия. На следующий день продолжайте фиксацию при комнатной температуре в течение одного часа. Вымойте каждую секцию три раза с PBS в течение примерно 30 минут за одну стирку.
Промытые секции последовательно инкубируют в 20, 40, 60, 80 и 100% растворе метанола в течение одного часа каждая. Повторите обезвоживание со 100% метанолом. Затем охладите образцы в 100% метаноле при четырех градусах Цельсия в течение 10 минут.
Приготовьте раствор, содержащий 66% DCM и 33% метанола, и инкубируйте охлажденные участки в этом растворе в течение ночи при комнатной температуре с встряхиванием. На следующий день дважды промойте образец метанолом в течение 30 минут и охладите его в 100% метаноле при четырех градусах Цельсия в течение 10 минут. Для отбеливания поместите образец в свежую пятипроцентную перекись водорода в метаноле и инкубируйте его в течение ночи при температуре четыре градуса Цельсия.
После ночной инкубации образец последовательно инкубируют в 80, 60, 40 и 20% растворах метанола в течение одного часа при комнатной температуре. Затем инкубируйте образец в PBS в течение одного часа и промойте его дважды в растворе, по одному в течение одного часа за промывку. Наполните одномиллилитровый шприц 2,5 микролитрами одного процента биотина-CTB и медленно вводите его в участок прилежащего ядра в течение 20 секунд.
Оставьте кончик иглы на месте на одну минуту и медленно снимите его в течение 10 секунд, чтобы предотвратить утечку. Инкубируйте образец в третьем растворе, а затем в четвертом растворе в течение двух дней каждый на водяной бане при температуре 37 градусов Цельсия. Затем добавьте первичное антитело и продолжайте инкубацию в течение семи дней.
Промойте образец пять раз в растворе два в течение одного часа за промывку и храните его в растворе два при комнатной температуре в течение ночи. Инкубируйте образец со вторичным антителом в течение семи дней на водяной бане при температуре 37 градусов Цельсия. Наконец, промойте его пять раз в растворе два в течение одного часа за промывку и храните в растворе два при комнатной температуре в течение ночи при слабом освещении.
Инкубируйте образец последовательно в 20, 40, 60, 80 и 100% метаноле в течение одного часа при комнатной температуре. Затем инкубируйте его в свежем 100% метаноле на ночь. На следующий день инкубируйте образец в свежеприготовленном 66% DCM в 33% метаноле в течение трех часов при комнатной температуре с встряхиванием.
Через три часа инкубируйте образец в дибензиловом эфире, не встряхивая, до тех пор, пока он не станет прозрачным. Затем храните его в дибензиловом эфире до проведения визуализации. Приобретите камеру для 3D-принтера и закрепите ее на предметном стекле микроскопа с помощью эпоксидной смолы.
Поместите образец в квадратное пространство в центре камеры и полностью заполните камеру дибензиловым эфиром. Наденьте на камеру защитный колпак толщиной 0,17 мм и надавите, чтобы убедиться, что он полностью соприкасается со стенками камеры. Затем заклейте края с помощью эпоксидной смолы.
Обязательно вращайте камеру, чтобы пузырьки воздуха могли выйти из заправочного отверстия. Заполните камеру дополнительным количеством дибензилового эфира. Затем запечатайте заливное отверстие эпоксидной смолой и дайте ему застыть.
Рассмотрите образец с помощью системы конфокального микроскопа, чтобы выполнить z-сканирование с четырехкратным увеличением. Конфокальное изображение гидрофобно очищенного образца ткани при четырехкратном увеличении показывает плотное окрашивание TH в области черной субстанции, редкие нейроны TH, прилегающие к черной субстанции, и темно-черную область ткани, в которой отсутствуют нейроны TH. Типичная морфология ТГ-положительного нейрона при 20-кратном увеличении имеет большую сому и несколько ветвящихся отростков.
В то время как окрашенная IBA1 микроглия имеет мелкие клеточные тела и более короткие процессы расширения. Идеальное конфокальное изображение показывает положительное и плотное окрашивание TH в области черной субстанции с подходящим усилением флуоресценции. Примеры плохих конфокальных изображений включают неправильно сфокусированное изображение со слишком большим флуоресцентным усилением, ложноположительное окрашивание яркими пятнами, не сфокусированными с остальной тканью, и сильное фоновое окрашивание в результате использования блокирующей сыворотки, которая не совпадает с вторичным антителом.
Здесь показано положительное окрашивание СТБ в мозге крысы. Длинные тонкие волокна представляют собой афферентные выступы вдоль дофаминергического пути. Колокализация ТГ и СТБ позволяет визуализировать место инъекции в области прилежащего ядра, которое выглядит в виде плотно флуоресцентного зеленого круга.
Показана колокализация ТГ и СТБ в черной субстанции. Самое важное, о чем следует помнить при попытке проведения этой процедуры, — это дать образцу достаточно времени для инкубации во всех растворах антител и достаточно времени для полного очищения перед визуализацией. Образец должен находиться в ограниченном контакте с воздухом, так как это может повредить образец.
Этот метод очень универсален и может быть использован для исследования множества различных белков, представляющих интерес в различных областях мозга. Данная методика помогает проложить путь нейробиологам к исследованию мозга крысы на уровне цепи, что имеет важное значение для изучения мозга как целостной системы.
View the full transcript and gain access to thousands of scientific videos
Это исследование представляет новый гидрофобный метод очищения тканей для визуализации целевых молекул в неповрежденных структурах головного мозга, с особым акцентом на мозг крысы, включая как контрольную модель F344/N, так и трансгенные модели с ВИЧ-1. Техника позволяет проводить полный анализ на уровне цепей, поддерживая целостность ткани мозга.
This hydrophobic tissue clearing method enables intact rat brain analysis for circuit-level studies, supporting target validation in neurodegenerative and infectious disease models. By preserving tissue integrity while allowing high-resolution imaging of molecular markers, it reduces the need for sectioning and associated artifacts. The approach provides predictive value in preclinical target de-risking by enabling whole-brain phenotyping and pathway mapping.
The method integrates into early discovery workflows by enabling hypothesis testing and pathway clarification in intact brain tissue, supporting lead identification through circuit-level phenotyping.