23 мая 2021 г.
Здесь мы представляем пошаговый протокол полуавтоматизированного подхода к анализу данных длительной электрокардиографии (ЭКГ) мышей на основные параметры ЭКГ и распространенные аритмии. Данные получаются имплантируемыми телеметрическими передатчиками у живых и бодрствующих мышей и анализируются с использованием Ponemah и ее аналитических модулей.
Анализ больших наборов данных ЭКГ, особенно при скрининге любой аритмии, очень сложен и трудоемкий. Наш полуавтоматический подход позволяет гораздо быстрее и удобнее проводить скрининг на аритмии у мышей. Такой полуавтоматический подход приводит к более точным результатам.
Процедуру продемонстрирует Апарна Чивукула, аспирант моей лаборатории. Начните с анализа основных параметров ЭКГ. Нажмите «Настройка темы» или «Сведения о канале», чтобы выбрать любой из производных параметров.
Поскольку мыши следуют циркадному ритму, анализируйте две ЭКГ в состоянии покоя в день. Один в дневное время и один в ночное время для контроля циркадных эффектов, выбирая подходящее время в зависимости от цикла включения или выключения света в животном учреждении. Выберите участок ЭКГ с хорошим качеством сигнала и стабильной частотой сердечных сокращений на графике тренда сердечного ритма в пределах определенного разумного периода времени около этой временной точки.
Подтвердите точность проверяющих масок или вручную настройте 20 последовательных комплексов QRS и добавьте отсутствующие метки проверки. Для дальнейших вычислений и визуализаций отметьте строки, содержащие значения этих 20 последовательных комплексов QRS, в списке производных параметров и скопируйте в электронную таблицу или статистическое программное обеспечение. Откройте аналитические данные, щелкнув Experiment Data Insights и наблюдав за панелью поиска вверху.
Затем отобразите панель «Результаты». Наблюдайте за количеством поисковых обращений, отображаемых в виде гистограммы в нижней части панели. Учитывая, что нормальная частота сердечных сокращений мыши составляет от 500 до 724 ударов в минуту, определите правило поиска, брадикардию, для выявления брадикардии.
Щелкните правой кнопкой мыши в списке поиска и выберите Создать новый поиск, чтобы открыть диалоговое окно записи поиска. Щелкните правой кнопкой мыши в белом поле и выберите Добавить новое предложение. Используя выпадающие меню и текстовые поля, определите правило поиска, Bradycardia Single, как значение меньше 500, и нажмите Ok, чтобы добавить это правило поиска в список.
Примените это правило поиска, щелкнув и перетащив его в интересующий канал слева. Поскольку брадикардия требует более одного длинного интервала РР, определите дополнительное правило поиска брадикардии, чтобы учесть это. Нажмите ok, чтобы добавить это правило поиска в список.
Примените это правило поиска, щелкнув и перетащив его в интересующий канал слева. Чтобы подтвердить брадикардию и отклонить ложные результаты, просмотрите каждый результат вручную, щелкнув левой кнопкой мыши по форме волны. Нажмите STRG плюс R, чтобы отклонить выбранный результат, который затем исчезнет из списка.
Чтобы определить правило поиска для обнаружения тахикардии, щелкните правой кнопкой мыши в списке поиска и выберите Создать новый поиск, чтобы открыть диалоговое окно ввода поиска. Затем щелкните правой кнопкой мыши в белом поле и выберите Добавить новое предложение. Используя выпадающие меню и текстовые поля, определите правило поиска Tachycardia Single как значение больше 724 и нажмите Ok, чтобы добавить это правило поиска в список.
Примените это правило поиска, щелкнув и перетащив его в интересующий канал слева. Поскольку тахикардия требует более одного короткого интервала RR, определите дополнительное правило поиска, Tachycardia, чтобы учесть это, и нажмите Ok, чтобы добавить это правило поиска в список. Примените это правило поиска, щелкнув и перетащив его в интересующий канал слева.
Чтобы подтвердить тахикардию и отклонить ложные результаты, просмотрите каждый результат вручную, щелкнув левой кнопкой мыши по форме сигнала, и используйте ярлык STRG плюс R, чтобы отклонить выбранный результат. Чтобы обнаружить синоатриальные и атриовентрикулярные блоки, щелкните правой кнопкой мыши в списке поиска и выберите Создать новый поиск, чтобы открыть диалоговое окно ввода поиска. Затем щелкните правой кнопкой мыши в белой палитре и выберите Добавить новое предложение.
Используя раскрывающиеся меню и текстовые поля, определите правило поиска Пауза как значение больше 300 и нажмите кнопку ОК, чтобы добавить это правило поиска в список примените это правило поиска, щелкнув и перетащив его в интересующий канал слева. Чтобы подтвердить паузу, решите, является ли пауза синоатриальной или преджелудочковой блокадой, и отклоните ложные результаты. Просмотрите каждый результат вручную, щелкнув левой кнопкой мыши по форме сигнала и нажав STRG плюс R, чтобы отклонить выбранный результат, который исчезнет из списка результатов.
Такой подход позволил обнаружить периоды снижения частоты сердечных сокращений, повышения атриовентрикулярной и желудочковой проводимости, а также измененной реполяризации у мышей, получавших новый препарат. Кроме того, протокол использовался для определения временного течения возникновения аритмии в виде следов, представленных при нормальном синусовом ритме, синусовой паузе, трех степенях атриовентрикулярной блокады и фибрилляции предсердий. Окончательные показания многообразны и зависят от дизайна исследования и темы исследования.
При фибрилляции предсердий общая тяжесть заболевания была установлена в качестве прогностического маркера и может быть рассчитана на основе данных, полученных с помощью этого протокола.
Просмотрите полный транскрипт и получите доступ к тысячам научных видео
В данной статье представлен полуавтоматический пошаговый протокол анализа данных длительной ЭКГ-телеметрии у мышей для выявления аритмий. Использование программного обеспечения Ponemah и его модулей ECG Pro и Data Insights позволяет оптимизировать процесс идентификации и подтверждения аритмических событий, повышая скорость и точность обработки больших массивов данных, полученных от бодрствующих мышей в условиях свободного перемещения.
Высокопроизводительный полуавтоматический анализ данных длительной ЭКГ-телеметрии у мышей позволяет устранить критический пробел в доклинических исследованиях сердечной безопасности и механизмов возникновения аритмии. Данный рабочий процесс повышает прогностическую достоверность валидации мишеней и способствует обоснованному с учетом рисков продвижению новых терапевтических средств за счет обеспечения надежной количественной оценки электрофизиологии сердца на релевантных моделях заболеваний. Интеграция автоматизированного и ручного анализа обеспечивает целостность и воспроизводимость данных на всех этапах фундаментальных и трансляционных исследований.
Данный рабочий процесс полуавтоматического анализа ЭКГ связывает этапы раннего поиска, идентификации ведущих соединений и доклинической оценки безопасности, обеспечивая надежное количественное фенотипирование сердечных аритмий на моделях мышей.