2 августа 2021 г.
Здесь представлен экспериментальный рабочий процесс, позволяющий обнаружить обработку каспазы-8 непосредственно на вызывающем смерть сигнальном комплексе (DISC) и определяющий состав этого комплекса. Эта методология имеет широкое применение, от разгадки молекулярных механизмов путей гибели клеток до динамического моделирования сетей апоптоза.
Инициация апоптоза опосредована активацией каспаз на маркерных молекулярных платформах. Представлено обнаружение ключевого инициационного клеточного комплекса гибели DISC, который служит платформой для активации каспазы-8. Преимущество данной методики в том, что она позволяет обнаруживать сборку и состав комплекса DISC наряду с предоставлением информации об обработке каспазы-8 в данном комплексе.
Начните эксперимент с клетками, которые на 80-90% сливаются и прилипают к блюду. Выбросьте среду и добавьте свежую среду в клетки адгезивов. Затем стимулируют клетки выбранной концентрацией CD95L, удерживая пластинку под углом и пипетируя лиганд в среду, не касаясь адгезивных клеток.
Чтобы собрать клетки, поместите чашку из клеток на лед. Добавьте 10 миллилитров холодного PBS в суспензию ячейки и соскоблите прикрепленные ячейки с пластины. Соберите клеточную суспензию в 50-миллилитровую трубку.
Дважды вымойте посуду с 10 миллилитрами холодного PBS и добавьте раствор для мытья в ту же 50-миллилитровую трубку. Затем центрифугируют клеточную суспензию в 500 раз G в течение пяти минут при четырех градусах Цельсия. После выброса супернатанта повторно суспендируют ячейку гранулы в одном миллилитре холодного PBS.
Затем переложите клеточную суспензию в 1,5-миллилитровую трубку. Центрифугируйте клеточную суспензию и повторно суспендируйте гранулу ячейки в одном миллилитре холодного PBS снова. Повторите центрифугирование еще раз, затем повторно суспендируйте гранулу клетки в одном миллилитре лизисного буфера и инкубируйте ее в течение 30 минут на льду.
После инкубации центрифугируют лизат с максимальной скоростью в течение 15 минут при четырех градусах Цельсия, затем переносят супернатант в чистую трубку. Выбросьте гранулу и соберите 50-микролитровой образец лизата в другую пробирку для определения концентрации белка. Для иммунопреципитации добавьте к лизату два микролитра антитела против АПО1 и 10 микролитров подготовленных шариков сефарозы белка А.
Добавьте 10 микролитров только бисера в отдельную трубку, содержащую лизат, чтобы служить в качестве контроля бисера. Инкубируйте смесь, содержащую лизат, антитела и бусины сефарозы белка А в течение ночи при четырех градусах Цельсия с мягким перемешиванием. На следующий день центрифугируйте смесь в 500 раз в G в течение четырех минут при четырех градусах Цельсия.
После выброса супернатанта вымойте шарики, добавив один миллилитр холодного PBS и выбросив супернатант после центрифугирования. Повторите этот шаг не менее трех раз. После отказа от последней промывки PBS аспирируйте бусины предпочтительно шприцем Гамильтона объемом 50 микролитров.
Чтобы выполнить вестерн-блот, добавьте 20 микролитров 4-кратного загрузочного буфера в бусины и нагревайте при 95 градусах Цельсия в течение 10 минут. Одновременно нагревайте контроль лизата при 95 градусах Цельсия в течение пяти минут. Загрузите лизаты, иммунопреципитанты и белковый стандарт на гель SDS 12,5% и работайте с постоянным напряжением 80 вольт.
После того, как гель будет завершен, перенесите белки из геля SDS в нитроцеллюлозную мембрану. После того, как перенос будет завершен, поместите промокшую мембрану в коробку и высиживайте ее в течение часа в блокирующем растворе под мягким перемешиванием, затем трижды промывайте мембрану в течение пяти минут PBST. Для обнаружения белков добавляют первое первичное антитело в указанном разведении к мембране и инкубируют его в течение ночи при четырех градусах Цельсия с мягким перемешиванием.
На следующий день промыть мембрану тремя пятиминутными промывками PBST, затем инкубировать мембрану с 20 миллилитрами вторичного антитела с легким встряхиванием в течение одного часа при комнатной температуре. Снова промыть мембрану три раза ПБСТ. После отказа от последней промывки PBST добавьте примерно один миллилитр субстрата пероксидазы хрена к мембране и обнаружите сигнал хемолюминесценции.
Стимуляция клеток рака шейки матки HeLa-CD95 с помощью CD95L привела к высокому уровню образования CD95 DISC, контролируемому с помощью иммунопреципитации CD95. CD95, FADD, прокаспаза-8, прокаспаза-10 и c-FLIPS наблюдались в этих иммунопреципитациях CD95, указывающих на эффективное формирование DISC. Продукты расщепления p43-FLIP и p22-FLIP были обнаружены в иммунопреципитациях, что указывает на активацию каспазы-8.
Клетки HeLa-CD95, которые чрезмерно экспрессируют c-FLIP в течение длительного времени, были использованы для анализа образования CD95 DISC. Подобно родительским клеткам HeLa-CD95, в иммунопреципитациях этих клеток без лечения CD95L не было обнаружено рекрутирования белков FADD, прокаспазы-9, прокаспазы-10, c-FLIP и PARP1. Активированные первичные Т-клетки характеризовались высокими уровнями CD95, FADD, прокаспазы-8, прокаспазы-10 и c-FLIPS в иммунопреципитациях против CD95.
Этот метод позволяет анализировать молекулярное образование DISC, включая обработку каспазы-8 на DISC. Все этапы стирки очень важны. Кроме того, следует серьезно относиться к точкам стимуляции и времени инкубации.
Только так можно измерить сборку на комплексе DISC. Однако для измерения активации каспазы-8 можно также проводить анализы активности каспазы-8. Такой подход позволил нам получить новое понимание инициации апоптоза.
Просмотрите полный транскрипт и получите доступ к тысячам научных видео
В данной статье представлен экспериментальный рабочий процесс для детектирования процессинга caspase-8 в сигнальном комплексе, индуцирующем гибель (DISC). Данная методология позволяет определить состав комплекса DISC, что имеет широкое применение для понимания путей гибели клеток и сетей апоптоза.
Понимание состава и динамики комплекса, индуцирующего гибель (DISC), имеет решающее значение для снижения рисков при разработке терапевтических стратегий, направленных на апоптоз. Данный метод позволяет напрямую измерить рекрутирование и процессинг прокаспазы-8 внутри DISC, обеспечивая понимание механизмов, которые необходимы для валидации мишеней в путях внешнего апоптоза. Количественная оценка формирования DISC и активации каспазы-8 позволяет исследователям оценивать взаимодействие с мишенью и модуляцию пути с большей прогностической уверенностью в доклинических моделях.
Данный метод вписывается в континуум исследований от валидации мишени через идентификацию ведущего соединения до доклинической оценки, предоставляя биохимические доказательства модуляции сигнального пути на уровне DISC.