Гибридная сборка генома De Novo для генерации полных геномов мочевых бактерий с использованием технологий короткого и длинного считывания секвенирования

7.8K просмотров

Цитируется: 9

12:08 мин.

20 августа 2021 г.

10.3791/62872-v

20 августа 2021 г.

7.8K просмотров

Этот протокол детализирует комплексный подход к культивированию, секвенированию и сборке гибридного генома мочевых бактерий de novo. Он обеспечивает воспроизводимую процедуру для генерации полных, круговых последовательностей генома, полезных для изучения как хромосомных, так и внехромосомных генетических элементов, способствующих колонизации мочи, патогенезу и распространению устойчивости к противомикробным препаратам.

Больше видео

de novo

Chapters in this video

0:04

Introduction

1:00

dsDNA Pool Cleanup and Concentration

3:25

Sequence the Genome Library

5:14

Long (MinION) Reads

6:55

Generating Hybrid Genome Assembly

8:34

Assessing Assembly Quality

9:34

Genome Annotation

10:07

Results: Analysis of Extracted DNA and Complete Genome Sequencing of Urinary Bacteria

11:37

Conclusion

Related Videos