Ресурсы биоинформатики для изучения гликано-опосредованных белковых взаимодействий

3.6K просмотров

11:21 мин.

20 января 2022 г.

10.3791/63356-v

20 января 2022 г.

3.6K просмотров

Frédérique Lisacek¹^,²^,³

¹Proteome Informatics Group, SIB Swiss Institute of Bioinformatics, ²Computer Science Department, University of Geneva, ³Section of Biology, University of Geneva

Этот протокол иллюстрирует, как исследовать, сравнивать и интерпретировать гликомы белка человека с помощью онлайн-ресурсов.

Больше видео

Взаимодействия гликанов с белками

инструменты гликоинформатики

базы данных гликопротеинов

визуализация гликанов

анализ N-гликома

анализ O-гликома

база данных GlyConnect

специфичность гликома белков

сравнение состава гликанов

Chapters in this video

0:05

Introduction

1:11

Accessing Resources from Glyco@Expasy and Exploring the Contextual Information of a Protein N-Glycome

2:43

Visualizing and Correlating the Contextual Information of a Protein N-Glycome

5:38

Glycan-Binding Information in UniLectin

6:59

Browsing the HGI Challenge High Confidence Dataset

7:45

Comparing the O-Glycome of a Selected Serum Protein in GlyConnect

8:47

Results: Combining Outputs of GlyConnect Octopus, GlyConnect Compozitor, and UniLectin

10:49

Conclusion