Исследование микробной кооперации с помощью визуализационного масс-спектрометрического анализа бактериальных колоний, выращенных на агаре и в тканях во время инфекции

Наш протокол позволяет визуализировать пространственный метаболизм микробных взаимодействий, происходящих во время инфекции. Мы разработали этот рабочий процесс масс-спектрометрии для бактериальных кокультур, выращенных на агаровых и тканевых моделях. Анализ нетрадиционных субстратов, таких как бактериальные культуры, выращенные на агаре, сопряжен со многими проблемами.

Используя наш протокол, бактериальные образцы могут быть соответствующим образом высушены, чтобы облегчить применение матрицы MALDI при последующем масс-спектрометрическом анализе изображений. Этот метод широко применим к различным метаболитам, микробным патогенам или заболеваниям, а также к типам образцов, где требуется пространственная мера клеточной или тканевой биохимии, особенно при изучении типов образцов, которые требуют обезвоживания перед анализом. После подготовки макроколоний бактериальных культур удалите колонии агарозных бактерий, установленные на предметных стеклах микроскопа с покрытием ITO, из упаковочного материала.