AMEBaS: Автоматическое выделение срединной линии и вычитание фона ратиометрических флуоресцентных таймлапсов поляризованных одиночных ячеек

1.1K просмотров

Цитируется: 2

06:03 мин.

23 июня 2023 г.

10.3791/64857-v

23 июня 2023 г.

1.1K просмотров

Rafael Badain¹ , Daniel S. C. Damineli¹^,² , Maria Teresa Portes³ , José Feijó⁴ , Stefano Buratti⁵ , Giorgia Tortora⁶ , Hugo Neves de Oliveira¹ , Roberto M. Cesar Jr¹

¹Institute of Mathematics and Statistics, University of São Paulo, ²Center for Mathematics, Computing and Cognition, Federal University of ABC, ³Department of Botany, Institute of Biosciences, University of São Paulo, ⁴Cell Biology and Molecular Genetics Department, University of Maryland, ⁵Department of Biosciences, University of Milan, ⁶Department of Physics, Politecnico di Milano

Современные методы анализа внутриклеточной динамики поляризованных одиночных клеток часто являются ручными и не стандартизированы. В этой рукописи представлен новый конвейер анализа изображений для автоматизации срединного извлечения одиночных поляризованных ячеек и количественной оценки пространственно-временного поведения по временным интервалам в удобном онлайн-интерфейсе.