21 июля 2023 г.
Этот протокол демонстрирует измерения комбинационного рассеяния света с поверхностным усилением одной молекулы (SERS) с использованием наноантенны ДНК-оригами (DONA) в сочетании с колокализованной атомно-силовой микроскопией (АСМ) и рамановскими измерениями.
Наше исследование направлено на разработку новых инструментов для обнаружения отдельных молекул с помощью поверхностно-усиленного комбинационного рассеяния или источника. Это единственный метод, который обеспечивает химический отпечаток молекулы и достаточно чувствителен для обнаружения отдельных молекул. Таким образом, можно получить подробную механистическую информацию о химических реакциях.
Наноструктуры ДНК-оригами использовались для точного позиционирования как плазмонных наночастиц, так и молекул-мишеней. И это необходимо, потому что усиленное комбинационное рассеяние происходит из небольшого нанометрового объема между наночастицами, которые мы называем горячими точками. И сейчас мы создали новую плазмонную ДНК-наноантенну оригами именно для этой цели.
Основная задача состоит в том, чтобы поместить молекулы-мишени в такие горячие точки между двумя наночастицами и собрать рамановские данные ровно с одной наноантенной структуры. Для сбора больших объемов данных и эффективной корреляции между атомно-силовой микроскопией необходимо провести рамановскую спектроскопию. Плазмонные ДНК-оригами-наноантенны позволяют воспроизводить большое количество плазмонных димеров, в которых молекула-мишень точно расположена между наночастицами в горячей точке.
И благодаря корреляции данных АСМ и комбинационного рассеяния мы теперь можем убедиться, что обнаружена только одна молекула. Теперь мы можем отслеживать отдельные молекулы, такие как молекулы красителей или белки, в режиме реального времени, а также их поведение в горячих точках и их реакцию на химические изменения в окружающей среде. Например, недавно наблюдалось изменение спинового состояния отдельных молекул человека.
В будущем мы планируем отслеживать химические реакции на мономолекулярном уровне и изучать механизмы их реакции. Кроме того, мы можем использовать эту технологию для обнаружения биомолекул, имеющих отношение к медицине, с очень высокой чувствительностью.
В данном протоколе продемонстрированы измерения гигантского комбинационного рассеяния (SERS) одиночных молекул с использованием наноантенны из ДНК-оригами (DONA) в сочетании с колокализованной атомно-силовой микроскопией (AFM) и рамановской спектроскопией. Целью исследования является разработка инструментов для детектирования одиночных молекул и мониторинга их поведения в режиме реального времени.
SERS единичных молекул с использованием плазмонных наноантенн из ДНК-оригами обеспечивает беспрецедентную химическую специфичность на уровне отдельных молекул, восполняя критический пробел в механистическом снижении рисков и валидации мишеней для биофармацевтических исследований и разработок. Эта возможность позволяет в режиме реального времени отслеживать поведение молекул и протекание реакций, что повышает прогностическую достоверность на ранних этапах поиска и в трансляционных исследованиях. Данный подход улучшает процесс принятия решений по портфелю препаратов, выявляя молекулярную гетерогенность и механизмы реакций, которые остаются скрытыми при анализе объемных проб.
Данный метод интегрируется в процесс разработки лекарственных средств — от ранних механистических исследований до идентификации ведущих соединений и трансляционных исследований, предоставляя многократно используемую платформу для аналитики отдельных молекул.