4D Light-sheet Imaging of Zebrafish Cardiac Contraction

Xinyuan Zhang; Alireza Saberigarakani; Milad Almasian; Sohail Hassan; Manasa Nekkanti; Yichen Ding

doi:10.3791/66263

4D-визуализация сердечного приступа рыбки данио

JoVE Journal
Bioengineering

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Bioengineering

4D Light-sheet Imaging of Zebrafish Cardiac Contraction

4D-визуализация сердечного приступа рыбки данио

Full Text

1,555 Views

07:07 min

January 5, 2024

DOI: 10.3791/66263-v

Xinyuan Zhang¹, Alireza Saberigarakani¹, Milad Almasian¹, Sohail Hassan¹, Manasa Nekkanti¹, Yichen Ding^1,2,3

¹Department of Bioengineering,The University of Texas at Dallas, ²Center for Imaging and Surgical Innovation,The University of Texas at Dallas, ³Hamon Center for Regenerative Science and Medicine,UT Southwestern Medical Center

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Summary

Этот протокол использует визуализацию светового листа для исследования сократительной функции сердца у личинок данио-рерио и получения информации о механике сердца с помощью отслеживания клеток и интерактивного анализа.

Transcript

В нашем исследовании используется 4D-визуализация светового листа для изучения сократительной функции сердца у рыбок данио, стремясь понять динамику сердечных сокращений на уровне отдельных клеток. Одной из важнейших экспериментальных задач является достижение высокого пространственного терминального разрешения, динамической визуализации сердечной функции при наблюдении за естественными сердечными ритмами. Наше исследование восполняет пробел в анализе сложной 4D-динамики сердца при одноклеточном разрешении.

Мы используем параллельные вычисления на базе GPU, виртуальную реальность и расширенное отслеживание клеток для интерпретации данных изображений светового полотна. Наша новая платформа виртуальной реальности предлагает интерактивный подход к оценке регионарных сердечных сокращений, предоставляя манипулятивные функции для более глубокого анализа. Облегчая ориентированный на пользователя анализ сердечных сокращений, наш протокол может привести к более глубокому пониманию сердечного развития и заболевания.