ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<meta charset="utf8"></head><body>Долгосрочное отслеживание и количественная оценка подвижности видов акантамебы

<ol><li>Randag, A. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+rising+incidence+of+Acanthamoeba+keratitis%3A+A+7-year+nationwide+survey+and+clinical+assessment+of+risk+factors+and+functional+outcomes%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">The rising incidence of Acanthamoeba keratitis: A 7-year nationwide survey and clinical assessment of risk factors and functional outcomes.</a> PLoS One. 14 (9), e0222092(2019).</li>
<li>Szentmary, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Acanthamoeba+keratitis+-+Clinical+signs%2C+differential+diagnosis+and+treatment%5BTitle%5D)+AND+%22J+Curr+Ophthalmol%22%5BJournal%5D)">Acanthamoeba keratitis - Clinical signs, differential diagnosis and treatment.</a> J Curr Ophthalmol. 31 (1), 16-23 (2019).</li>
<li>Carnt, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Acanthamoeba+keratitis%3A+confirmation+of+the+UK+outbreak+and+a+prospective+case-control+study+identifying+contributing+risk+factors%5BTitle%5D)+AND+%22Br+J+Ophthalmol%22%5BJournal%5D)">Acanthamoeba keratitis: confirmation of the UK outbreak and a prospective case-control study identifying contributing risk factors.</a> Br J Ophthalmol. 102 (12), 1621-1628 (2018).</li>
<li>Verani, J. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((National+outbreak+of+Acanthamoeba+keratitis+associated+with+use+of+a+contact+lens+solution%2C+United+States%5BTitle%5D)+AND+%22Emerg+Infect+Dis%22%5BJournal%5D)">National outbreak of Acanthamoeba keratitis associated with use of a contact lens solution, United States.</a> Emerg Infect Dis. 15 (8), 1236-1242 (2009).</li>
<li>Tu, E. Y., Joslin, C. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Recent+outbreaks+of+atypical+contact+lens-related+keratitis%3A+what+have+we+learned%5BTitle%5D)+AND+%22Am+J+Ophthalmol%22%5BJournal%5D)">Recent outbreaks of atypical contact lens-related keratitis: what have we learned.</a> Am J Ophthalmol. 150 (5), 602-608 (2010).</li>
<li>International Organization for Standardization. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ISO+14729%3A2001%2FA1.+Ophthalmic+optics-Contact+lens+care+products-Microbiological+requirements+and+test+methods+for+products+and+regimens+for+hygienic+management+of+contact+lenses%5BTitle%5D)+AND+%22International+Organization+for+Standardization%22%5BJournal%5D)">ISO 14729:2001/A1. Ophthalmic optics-Contact lens care products-Microbiological requirements and test methods for products and regimens for hygienic management of contact lenses.</a> International Organization for Standardization. , Geneva, Switzerland. (2010).</li>
<li>ASC Z80, Parent Committee Meeting. , Available from: 
 <a target="_blank" href="https://www.thevisioncouncil.org/sites/default/files/ASCZ80_ParentCommitteeMinutes_February_27_2018_FINALMar19-2018.pdf">https://www.thevisioncouncil.org/sites/default/files/ASCZ80_ParentCommitteeMinutes_February_27_2018_FINALMar19-2018.pdf</a> (2023).</li>
<li>Rayamajhee, B., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Acanthamoeba%2C+an+environmental+phagocyte+enhancing+survival+and+transmission+of+human+pathogens%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Parasitol%22%5BJournal%5D)">Acanthamoeba, an environmental phagocyte enhancing survival and transmission of human pathogens.</a> Trends Parasitol. 38 (11), 975-990 (2022).</li>
<li>Reverey, J. F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Superdiffusion+dominates+intracellular+particle+motion+in+the+supercrowded+cytoplasm+of+pathogenic+Acanthamoeba+castellanii%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Superdiffusion dominates intracellular particle motion in the supercrowded cytoplasm of pathogenic Acanthamoeba castellanii.</a> Sci Rep. 5, 11690(2015).</li>
<li>Thapa, S., Lukat, N., Selhuber-Unkel, C., Cherstvy, A. G., Metzler, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transient+superdiffusion+of+polydisperse+vacuoles+in+highly+motile+amoeboid+cells%5BTitle%5D)+AND+%22J+Chem+Phys%22%5BJournal%5D)">Transient superdiffusion of polydisperse vacuoles in highly motile amoeboid cells.</a> J Chem Phys. 150 (14), 144901(2019).</li>
<li>Rudell, J. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Acanthamoeba+migration+in+an+electric+field%5BTitle%5D)+AND+%22Invest+Ophthalmol+Vis+Sci%22%5BJournal%5D)">Acanthamoeba migration in an electric field.</a> Invest Ophthalmol Vis Sci. 54 (6), 4225-4233 (2013).</li>
<li>Fukaya, S., Aoki, K., Kobayashi, M., Takemura, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Kinetic+analysis+of+the+motility+of+giant+virus-infected+amoebae+using+phase-contrast+microscopic+images%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Kinetic analysis of the motility of giant virus-infected amoebae using phase-contrast microscopic images.</a> Front Microbiol. 10, 3014(2019).</li>
<li>Fukaya, S., Takemura, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Kinetic+analysis+of+Acanthamoeba+castellanii+infected+with+giant+viruses+quantitatively+revealed+process+of+morphological+and+behavioral+changes+in+host+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiol+Spectr%22%5BJournal%5D)">Kinetic analysis of Acanthamoeba castellanii infected with giant viruses quantitatively revealed process of morphological and behavioral changes in host cells.</a> Microbiol Spectr. 9 (1), 0036821(2021).</li>
<li>Cheng, H. J., Hsu, C. H., Hung, C. L., Lin, C. Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+review+for+cell+and+particle+tracking+on+microscopy+images+using+algorithms+and+deep+learning+technologies%5BTitle%5D)+AND+%22Biomed+J%22%5BJournal%5D)">A review for cell and particle tracking on microscopy images using algorithms and deep learning technologies.</a> Biomed J. 45 (3), 465-471 (2022).</li>
<li>Mathieu, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Time-lapse+lens-free+imaging+of+cell+migration+in+diverse+physical+microenvironments%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+Chip%22%5BJournal%5D)">Time-lapse lens-free imaging of cell migration in diverse physical microenvironments.</a> Lab Chip. 16 (17), 3304-3316 (2016).</li>
<li>Svensson, C. M., Medyukhina, A., Belyaev, I., Al-Zaben, N., Figge, M. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Untangling+cell+tracks%3A+Quantifying+cell+migration+by+time+lapse+image+data+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Cytometry+A%22%5BJournal%5D)">Untangling cell tracks: Quantifying cell migration by time lapse image data analysis.</a> Cytometry A. 93 (3), 357-370 (2018).</li>
<li>Piltti, K. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Live-cell+time-lapse+imaging+and+single-cell+tracking+of+in+vitro+cultured+neural+stem+cells+-+Tools+for+analyzing+dynamics+of+cell+cycle%2C+migration%2C+and+lineage+selection%5BTitle%5D)+AND+%22Methods%22%5BJournal%5D)">Live-cell time-lapse imaging and single-cell tracking of in vitro cultured neural stem cells - Tools for analyzing dynamics of cell cycle, migration, and lineage selection.</a> Methods. 133, 81-90 (2018).</li>
<li>Campolo, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Continuous+real-time+motility+analysis+of+Acanthamoeba+reveals+sustained+movement+in+absence+of+nutrients%5BTitle%5D)+AND+%22Pathogens%22%5BJournal%5D)">Continuous real-time motility analysis of Acanthamoeba reveals sustained movement in absence of nutrients.</a> Pathogens. 10 (8), 995(2021).</li>
<li>Campolo, A., Patterson, B., Lara, E., Shannon, P., Crary, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Complete+recovery+of+Acanthamoeba+motility+among+surviving+organisms+after+contact+lens+care+disinfection%5BTitle%5D)+AND+%22Microorganisms%22%5BJournal%5D)">Complete recovery of Acanthamoeba motility among surviving organisms after contact lens care disinfection.</a> Microorganisms. 11 (2), 299(2023).</li>
<li>Crary, M. J., Walters, R., Shannon, P., Gabriel, M. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Variables+affecting+the+recovery+of+Acanthamoeba+trophozoites%5BTitle%5D)+AND+%22Pathogens%22%5BJournal%5D)">Variables affecting the recovery of Acanthamoeba trophozoites.</a> Pathogens. 10 (2), 221(2021).</li>
<li>imagej. , Available from: 
 <a target="_blank" href="https://imagej.net/plugins/trackmate/tutorials/getting-started">https://imagej.net/plugins/trackmate/tutorials/getting-started</a> (2024).</li>
<li>Cherstvy, A. G., Nagel, O., Beta, C., Metzler, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Non-Gaussianity%2C+population+heterogeneity%2C+and+transient+superdiffusion+in+the+spreading+dynamics+of+amoeboid+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Phys+Chem+Chem+Phys%22%5BJournal%5D)">Non-Gaussianity, population heterogeneity, and transient superdiffusion in the spreading dynamics of amoeboid cells.</a> Phys Chem Chem Phys. 20 (35), 23034-23054 (2018).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>&frac14; Звонарь» s раствор</td><td>ThermoFisher Scientific</td><td>BR0052G</td><td>Oxoid Ringers Solution Tablets. Следуйте инструкциям, чтобы сделать Звонари с силой в одну четверть вместо полной.</td></tr><tr><td>10 & микро; L дозатор</td><td>Eppendorf Research</td><td>3123000039</td><td>2 & микро; L-20 и микро; L одноканальный</td></tr><tr><td>10 & микро; L наконечники для пипеток</td><td>Neptune Scientific, Сан-Диего, Калифорния, США</td><td>BT10.N</td><td>10 &micro; L Универсальный барьерный наконечник</td></tr><tr><td>48 луночный планшет</td><td>Millipore Sigma,&nbsp;</td><td>CLS3548</td><td>Многолуночная пластина Corning Costar TC-Treated: полистирольная пластина, лунки с плоским дном, стерильная, с крышкой</td></tr><tr><td>50 мл конические пробирки (1 на каждый образец, 1 на каждый проход 2 образца)</td><td>Fisher Scientific</td><td>Falcon 352098</td><td>Falcon 50 мл высокопрозрачные конические центробежные трубки, полипропиленовая</td></tr><tr><td>96-луночная пластина</td><td>Millipore Sigma, Берлингтон, Массачусетс, США</td><td>CLS3596</td><td>Многолуночная пластина Corning Costar TC-Treatment: полистирольная пластина, лунки с плоским дном, стерильная, с крышкой</td></tr><tr><td>Acanthamoeba&nbsp; </td><td>American Type Culture Collection, Манассас, Вирджиния, США</td><td>ATCC 30461</td><td>Этот протокол был проверен на соответствие ATCC 50655, 30872, 50702, 30010, 30461, 50370, 50703, 30137, PRA-115 и PRA-411</td></tr><tr><td>Аксенические питательные среды (AC6)</td><td>Изготовлено в домашних</td><td>условиях н/д</td><td>Содержит 20 г биосата пептона, 5 г глюкозы, 0,3 г KH2PO4, 10 и микро; г витамина В12 и 1 стакан5 мг&nbsp; L-метионин на литр дистиллированной деионизированной воды. Отрегулируйте pH до 6,6-6,95 с помощью 1 М NaOH и автоклавируйте при 121 °°; C в течение 20 минут, хранить при комнатной температуре до 3 месяцев.</td></tr><tr><td>Центрифуга и подходящий ротор</td><td>Thermo Scientific, Waltham, MA, США</td><td>Sorvall ST 40R</td><td>Любая эквивалентная центрифуга и ротор приемлемы, если они могут вращать конические пробирки объемом 50 мл при 500 x g в течение 5 минут</td></tr><tr><td>Хемотаксис и инструмент</td><td></td><td></td> миграции <td>Бесплатное программное обеспечение на основе ImageJ, доступное по адресу https://ibidi.com/chemotaxis-analysis/171-chemotaxis-and-migration-tool.html</td></tr><tr><td>Одноразовый гемоцитометр</td><td>Bulldog Bio, Портсмут, Нью-Гэмпшир, США</td><td>DHC-N01</td><td>Neubauer Улучшенный 2-чиповый одноразовый гемоцитометр, индивидуально упакованное, непирогенное</td></tr><tr><td>программное обеспечение ImageJ с плагином Trackmate (этот протокол написан с помощью Trackmate версии 6.0.2.)</td><td></td><td></td><td>Бесплатное программное обеспечение, разработанное Национальными институтами здравоохранения, доступно по адресу imagej.net. Плагин Trackmate доступен в https://imagej.net/plugins/trackmate/</td></tr> <tr><td>Микроскоп, предпочтительно с автоматическим подвижным столиком</td><td>Nikon, Токио, Япония</td><td></td><td>В этом исследовании использовался микроскоп Nikon Eclipse Ti-U, а автоматизированный подвижный столик был использован для одновременной записи изображений в нескольких лунках.</td></tr><tr><td>Программное обеспечение NIS-Elements</td><td></td> Серологическая пипетка Nikon <td></td><td></td></tr><tr><td></td><td>Fisher Scientific, Hampton, NH, США</td><td>BrandTech 26331</td><td>BrandTech accu-jet pro Pipet Controller</td></tr><tr><td>Серологические наконечники для пипеток</td><td>VWR</td><td>5 мл: 76201-710 10 мл: 170356 25 мл: 89130-900 50 мл: 75816-088</td><td>VWR Серологическая пипетка, непирогенная</td></tr><tr><td>стерильная алюминиевая передающая проточная ячейка</td><td>Biosurface Technologies Corporation, Бозмен, Массачусетс, США</td><td>FC 81-AL</td><td>Анодированная алюминиевая одноканальная передающая проточная ячейка с 96-луночной пластиной для использования с инвертированным микроскопом</td></tr><tr><td>T75 Flask VWR</td><td>, Раднор, Пенсильвания, США</td><td>734-2316</td><td>VWR Tissue Culture Flask, 182,5 см, Обработанная поверхность, Заглушка с уплотнительной крышкой, Стерильная</td></tr></tbody></table>

Количественное определение acanthamoeba spp. Подвижность

Quantification of Acanthamoeba spp. Motility

Количественное определение Acanthamoeba spp. Подвижность

Acanthamoeba keratitis is a severe ocular infection that poses treatment challenges and can lead to blindness. Despite its ubiquity and potential ...

quantification-of-acanthamoeba-spp-motility

Research

JoVE Journal

Biology

Биология

Phagokinetic анализа трек подвижности является метод, используемый для оценки движения клеток. В частности, анализ мер хемокинез (случайный подвижность клеток) с течением времени в количественном выражении. Анализ использует способность клеток для создания измеримых отслеживать их движение на коллоидное золото покрытием покровные.

Количественные оценки миграции клеток в Phagokinetic анализа подвижности трек

Источник: Моралес-Сото, Н. и др., Подготовка, визуализация и количественная оценка анализов подвижности поверхности бактерий. J. Vis. Exp. (2015)В этом видео показан роевой анализ с использованием бактерий, экспрессирующих зеленый флуоресцентный белок, для наблюдения за подвижностью поверхности мягкого агара. Покадровая съемка фиксирует скоординированное расширение и образование усиков, подчеркивая подвижность поверхности бактерий.

Роевой анализ для визуализации подвижности бактериальной поверхности

Это видео демонстрирует анализ для количественной оценки внутриклеточного роста паразитов в макрофагах, полученных из костного мозга (BMM). Клетки макрофагов инфицированы подвижными и неподвижными инвазивными стадиями Leishmania, метациклическими промастиготами и амастиготами соответственно. Паразиты проникают в макрофаги, интернализуются в паразитофорную вакуоль и размножаются внутри. Внутриклеточный рост паразита количественно определяют с помощью микроскопа после флуоресцентного окрашивания...

Анализ in vitro для количественной оценки внутриклеточного роста паразита в макрофагах

Подвижность роя зависит от физических факторов и факторов окружающей среды. Мы описываем двухэтапный протокол и рекомендации по обходу проблем, обычно связанных с подготовкой роевого анализа и сбором данных. Метод макроскопической визуализации используется для получения подробной информации о поведении роя, которая не обеспечивается современными методами анализа.

Подготовка, Imaging, и количественное определение бактериальной поверхности моторики Анализы

Многие бактерии используют подвижность, управляемую жгутиками, чтобы ориентироваться в окружающей среде и колонизировать благоприятное окружение как индивидуально, так и коллективно. Здесь показано использование трех установленных методов, которые используют подвижность в качестве инструмента выбора для выявления компонентов / путей, способствующих плаванию и роевой подвижности.

Исследование подвижности жгутиков у кишечной палочки путем применения трех установленных методов в серии

Этот протокол описывает два чувствительных анализа для различения легких, умеренных и тяжелых двигательных нарушений у моделей бокового амиотрофического склероза C. elegans с общей полезностью для штаммов C. elegans с измененной подвижностью.

Оценка двигательных нарушений в моделях C. elegans бокового амиотрофического склероза

Здесь мы описываем использование пластин градиента индуктора для оценки подвижности бактериального роя при одновременном получении множественных реакций концентрации.

Количественная оценка подвижности роя бактериальной поверхности на градиентных пластинах индуктора

Двунаправленный митотический кинезин-5 Cin8 накапливается в кластерах, которые расщепляются и сливаются во время их подвижности. Накопление в кластерах также изменяет скорость и направленность Cin8. Здесь описан протокол анализа подвижности с очищенным Cin8-GFP и анализа подвижных свойств отдельных молекул и кластеров Cin8.

Подвижность одиночных молекул и кластеров двунаправленного кинезина-5 Cin8, очищенного из клеток S. cerevisiae

Этот протокол описывает, как производить актиновые кометы на поверхностях шариков с использованием коммерчески доступных белковых ингредиентов. Такие системы имитируют протрузивные структуры, обнаруженные в клетках, и могут быть использованы для изучения физиологических механизмов производства силы упрощенным способом.

Восстановление подвижности на основе актина с помощью коммерчески доступных белков

Этот протокол представляет собой быстрый и эффективный метод идентификации генетических факторов, участвующих в различных типах движений у Pseudomonas aeruginosa.

Высокопроизводительный метод наблюдения за фенотипами подвижности у Pseudomonas aeruginosa

Узнайте методы количественного анализа подвижности Acanthamoeba с помощью микроскопии и высококонтентного анализа изображений. Это исследование помогает понять механизмы развития акантамёбного кератита и улучшить гигиену контактных линз.

Количественное определение Acanthamoeba spp. Подвижность

Больше видео